Projekty finansowane przez NCN

iCell: przetwarzania informacji w organizmach żywych. Rola struktury przestrzennej i hierarchii skal w sterowaniu proces...

Konkurs: OPUS 8 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Dariusz Plewczyński

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

COGRIMEN - metoda modelowania gruboziarnistego dużych układów biologicznych w ośrodkach ciągłych

Konkurs: OPUS 8 , panel: ST4

Kierownik: prof. Sławomir Filipek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Rola cyklu komórkowego w regulacji polimerazy eta w odpowiedzi na promieniowanie UV w modelowych komórkach S. cerevisiae...

Konkurs: PRELUDIUM 8 , panel: NZ1

Kierownik: Michał Płachta

Instytut Biochemii i Biofizyki PAN

Nowe wydajne metody giętkiego dokowania molekularnego białek.

Konkurs: MAESTRO 6 , panel: ST6

Kierownik: prof. Andrzej Koliński

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Rozwój metodologii porównawczej, nowoczesnych metryk walidacji oraz nowoczesnych technik wizualizacji dla algorytmów bik...

Konkurs: PRELUDIUM 6 , panel: ST6

Kierownik: dr Patryk Orzechowski

Akademia Górniczo-Hutnicza im. Stanisława Staszica w Krakowie, Wydział Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki i Inżynierii Biomedycznej

Budowa realistycznego modelu łzy oraz badanie stabilność jej warstwy lipidowej w warunkach panujących na powierzchni oka...

Konkurs: PRELUDIUM 6 , panel: ST7

Kierownik: Alicja Wizert

Politechnika Wrocławska, Wydział Podstawowych Problemów Techniki

Zintegrowane podejście do przewidywania struktur białek oraz kompleksów białek przy użyciu gruboziarnistego pola siłoweg...

Konkurs: HARMONIA 5 , panel: ST4

Kierownik: prof. Józef Liwo

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Wieloskalowy model wzrostu nowotworu jako kluczowy element systemu do planowania optymalnej terapii antynowotworowej

Konkurs: HARMONIA 5 , panel: ST6

Kierownik: prof. Witold Dzwinel

Akademia Górniczo-Hutnicza im. Stanisława Staszica w Krakowie, Wydział Informatyki, Elektroniki i Telekomunikacji

Stochastyczne modele oparte na monotonicznych procesach Markowa: analiza warunków stacjonarnych.

Konkurs: OPUS 1 , panel: ST1

Kierownik: prof. Ryszard Szekli

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Matematyki i Informatyki

Badanie oddziaływania i przekazywania sygnału w kompleksach receptorów GPCR z arestyną

Konkurs: HARMONIA 4 , panel: ST6

Kierownik: prof. Sławomir Filipek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Badanie możliwości i ograniczeń zastosowania sieci Petriego do modelowania i analizy złożonych systemów biologicznych na...

Konkurs: OPUS 4 , panel: ST6

Kierownik: prof. Piotr Formanowicz

Instytut Chemii Bioorganicznej PAN

Emergentne własności biologicznych krajobrazów dostosowania na podstawie modeli sztucznego życia

Konkurs: PRELUDIUM 4 , panel: NZ2

Kierownik: dr Marcin Zagórski

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej

Modelowanie aktywności transpozonów indukowanej stresem

Konkurs: HARMONIA 3 , panel: ST6

Kierownik: prof. Anna Gambin

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Automatyczne, wysokoprzepustowe modelowanie struktur przestrzennych RNA

Konkurs: MAESTRO 3 , panel: ST6

Kierownik: prof. Ryszard Adamiak

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki

Modelowanie transportu ładunku w motywach strukturalnych RNA

Konkurs: PRELUDIUM 3 , panel: NZ1

Kierownik: Juliusz Stasiewicz

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Analiza wpływu falowania podgrawitacyjnego i wiatrowego na przebudowę dna i brzegu morskiego - rozbudowa i weryfikacja m...

Konkurs: OPUS 3 , panel: ST10

Kierownik: dr hab. Grzegorz Różyński

Instytut Budownictwa Wodnego PAN

Bioinformatyczne i biofizyczne modele sekwencji DNA wiążących NF-kappaB: przewidywanie lokalizacji miejsc wiązania w gen...

Konkurs: OPUS 3 , panel: NZ2

Kierownik: prof. Marek Kimmel

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Genomika adaptacji u dębu i buka, jako modelowych gatunków drzew leśnych

Konkurs: MAESTRO 2 , panel: NZ9

Kierownik: prof. Jarosław Burczyk

Uniwersytet Kazimierza Wielkiego, Wydział Nauk Przyrodniczych

Zrozumienie egzaptacji tkankowo-specyficznych wzmacniaczy genów poprzez modelowanie zmian przestrzennej architektury chr...

Konkurs: PRELUDIUM BIS 4 , panel: ST6

Kierownik: prof. Anna Gambin

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Teoretyczne badania procesów rezonansowego przenoszenia energii w modelowych układach oraz w spiralnych agregatach barwn...

Konkurs: OPUS 2 , panel: ST4

Kierownik: dr hab. Robert Góra

Politechnika Wrocławska, Wydział Chemiczny

Drożdżowa topoizomeraza DNA II jako modelowy cel molekularny dla nowych związków przeciwgrzybowych

Konkurs: OPUS 23 , panel: NZ6

Kierownik: dr hab. Iwona Gabriel

Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny

Modelowanie mikrodomen bakteryjnych pod kątem interakcji z wybranymi środkami przeciwdrobnoustrojowymi.

Konkurs: PRELUDIUM 21 , panel: NZ9

Kierownik: Mateusz Rzycki

Politechnika Wrocławska

Metoda modelowania de novo struktury RNA w oparciu o więzy z danych doświadczalnych

Konkurs: SONATA 17 , panel: NZ1

Kierownik: dr Sunandan Mukherjee

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

Przewidywanie struktur 3D RNA z wykorzystaniem generatywnych sieci przestawnych

Konkurs: PRELUDIUM BIS 2 , panel: ST6

Kierownik: prof. Marta Szachniuk

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki i Telekomunikacji

Nowa metodologia dla lepszego zrozumienia oddziaływań ligandów z RNA.

Konkurs: OPUS 20 , panel: NZ2

Kierownik: dr Filip Stefaniak

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

Uczenie maszynowe, modelowanie biologiczne i przetwarzanie obrazów medycznych w prognozowaniu przerzutów raku płuc.

Konkurs: OPUS 19 , panel: ST6

Kierownik: prof. Andrzej Świerniak

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Nowoczesna nanocząstka i organizm modelowy – toksyczna relacja? Fizjologiczne i komórkowe przyczyny zaburzeń rozwojowych...

Konkurs: OPUS 19 , panel: NZ7

Kierownik: prof. Maria Augustyniak

Uniwersytet Śląski w Katowicach, Wydział Nauk Przyrodniczych

Wieloskalowa przestrzenna reorganizacja chromatyny w odpowiedzi na stres replikacyjny i jej rola w ochronie przed niesta...

Konkurs: OPUS 19 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Dariusz Plewczyński

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Przestrzenny model sieciowy zróżnicowania sekwencji i struktury genomu ludzkiego w skali populacyjnej

Konkurs: PRELUDIUM BIS 1 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Dariusz Plewczyński

Politechnika Warszawska, Wydział Matematyki i Nauk Informacyjnych

Wykorzystanie metody głębokiego uczenia w analizie sekwencji genomu zwierząt hodowlanych

Konkurs: PRELUDIUM BIS 1 , panel: NZ9

Kierownik: prof. Joanna Szyda

Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu, Wydział Biologii i Hodowli Zwierząt

Eksploracja cech i modelowanie struktury kwadrupleksów

Konkurs: OPUS 18 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Marta Szachniuk

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki

Modelowanie matematyczne procesów neutralizacji reaktywnych form tlenu w różnych typach komórek

Konkurs: PRELUDIUM 18 , panel: ST6

Kierownik: Sylwia Ciesielska

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Telekomunikacyjne podejście do modelowania metabolizmu komórek

Konkurs: OPUS 17 , panel: ST6

Kierownik: prof. Tadeusz Wysocki

Uniwersytet Technologiczno-Przyrodniczy im. Jana i Jędrzeja Śniadeckich w Bydgoszczy, Wydział Telekomunikacji, Informatyki i Elektrotechniki

Algorytmy i modele statystyczne służące do przewidywania schematów fragmentacji cząsteczek podczas dysocjacji indukowane...

Konkurs: PRELUDIUM 17 , panel: ST6

Kierownik: Grzegorz Skoraczyński

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Biologicznie Znacząca Rekonstrukcja Sieci Filogenetycznych

Konkurs: OPUS 17 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Paweł Górecki

Uniwersytet Warszawski

Kataliza DNA: w poszukiwaniu odpowiedzi

Konkurs: SONATA 14 , panel: NZ2

Kierownik: dr Maria Ponce Salvatierra

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

Mechanizmy zwiększenia cytotoksyczności fleomycyny przez antymon i kadm u modelowego organizmu drożdży Saccharomyces cer...

Konkurs: PRELUDIUM 16 , panel: NZ2

Kierownik: Ewa Pilarczyk

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Nauk Biologicznych

Analiza cytogenomiczna istotnych zagadnień organizacji genomu jądrowego poliploidalnej trawy modelowej Brachypodium hybr...

Konkurs: OPUS 16 , panel: NZ3

Kierownik: prof. Robert Hasterok

Uniwersytet Śląski w Katowicach, Wydział Nauk Przyrodniczych

Połączenie metody Rosetta z gruboziarnistym modelem SURPASS w nowy wieloskalowy algorytm modelowania białek i ich komple...

Konkurs: OPUS 15 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Dominik Gront

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Głębokie sztuczne sieci neuronowe w integracji profilu ekspresji krążących i wewnątrzkomórkowych cząsteczek miRNA pacjen...

Konkurs: PRELUDIUM 15 , panel: NZ5

Kierownik: dr Konrad Stawiski

Uniwersytet Medyczny w Łodzi, Wydział Lekarski

Rola i współdziałanie dehydrogenazy AidB i dioksygenazy AlkB w naprawie uszkodzeń zasad DNA i RNA

Konkurs: OPUS 15 , panel: NZ3

Kierownik: dr hab. Agnieszka Maciejewska

Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

Koherentne Modele i Wydajne Algorytmy dla Duplikacji Genomowych

Konkurs: OPUS 14 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Paweł Górecki

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Rozwój metod statystycznych i algorytmicznych stosowanych w spektroskopii mas

Konkurs: SONATA 13 , panel: ST6

Kierownik: dr Michał Startek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Zintegrowane podejście do modelowania struktury i dynamiki białek z wykorzystaniem gruboziarnistego pola siłowego UNRES ...

Konkurs: HARMONIA 9 , panel: ST4

Kierownik: dr hab. Cezary Czaplewski

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Opracowanie nowych metod projektowania cząsteczek RNA o zadanej strukturze oraz zastosowanie ich do konstruowania nowych...

Konkurs: OPUS 13 , panel: NZ2

Kierownik: prof. Janusz Bujnicki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Efektywne algorytmy symulacji modeli procesów stochastycznych w biologii obliczeniowej oraz metody syntezy modeli szlakó...

Konkurs: OPUS 12 , panel: ST6

Kierownik: dr Krzysztof Puszyński

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Opracowanie metod korekcji obciążenia pomiarów poziomu ekspresji genów

Konkurs: SONATA 12 , panel: ST7

Kierownik: dr Roman Jaksik

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Wykrywanie źródeł zaburzeń sygnalizacja w komórkach rakowych

Konkurs: PRELUDIUM 12 , panel: ST6

Kierownik: Karol Nienałtowski

Instytut Podstawowych Problemów Techniki Polskiej Akademii Nauk

Gruboziarnista metoda do modelowania struktury przestrzennej cząsteczek RNA, uwzględniająca niekanoniczne parowania zasa...

Konkurs: OPUS 12 , panel: ST6

Kierownik: dr Michał Boniecki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

RNApolis - metody i algorytmy do modelowania i analizy struktury RNA

Konkurs: OPUS 12 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Marta Szachniuk

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki i Telekomunikacji