Projekty finansowane przez NCN

Modelowanie struktury RNA ukierunkowane na motywy funkcjonalne

Konkurs: OPUS 27 , panel: ST6

Kierownik: prof. Marta Szachniuk

Politechnika Poznańska

Metody obliczeniowe dla zrozumienia mikrośrodowiska immunologicznego nowotworów na podstawie danych obrazowania przestrz...

Konkurs: SONATA 19 , panel: NZ2

Kierownik: dr Krzysztof Gogolewski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Eksploracja motywów pętli wielokrotnych w strukturach RNA

Konkurs: SONATA 19 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Tomasz Żok

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki i Telekomunikacji

Unifikacja modeli makro-ewolucyjnych i sieci filogenetycznych

Konkurs: OPUS 26 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Paweł Górecki

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Zrozumienie egzaptacji tkankowo-specyficznych wzmacniaczy genów poprzez modelowanie zmian przestrzennej architektury chr...

Konkurs: PRELUDIUM BIS 4 , panel: ST6

Kierownik: prof. Anna Barbara Gambin

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Drożdżowa topoizomeraza DNA II jako modelowy cel molekularny dla nowych związków przeciwgrzybowych

Konkurs: OPUS 23 , panel: NZ6

Kierownik: dr hab. Iwona Gabriel

Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny

Modelowanie mikrodomen bakteryjnych pod kątem interakcji z wybranymi środkami przeciwdrobnoustrojowymi.

Konkurs: PRELUDIUM 21 , panel: NZ9

Kierownik: dr Mateusz Igor Rzycki

Politechnika Wrocławska

Metoda modelowania de novo struktury RNA w oparciu o więzy z danych doświadczalnych

Konkurs: SONATA 17 , panel: NZ1

Kierownik: dr Sunandan Mukherjee

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

Przewidywanie struktur 3D RNA z wykorzystaniem generatywnych sieci przestawnych

Konkurs: PRELUDIUM BIS 2 , panel: ST6

Kierownik: prof. Marta Xymena Szachniuk

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki i Telekomunikacji

Nowa metodologia dla lepszego zrozumienia oddziaływań ligandów z RNA.

Konkurs: OPUS 20 , panel: NZ2

Kierownik: dr Filip Artur Stefaniak

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

Uczenie maszynowe, modelowanie biologiczne i przetwarzanie obrazów medycznych w prognozowaniu przerzutów raku płuc.

Konkurs: OPUS 19 , panel: ST6

Kierownik: prof. Andrzej Świerniak

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Nowoczesna nanocząstka i organizm modelowy – toksyczna relacja? Fizjologiczne i komórkowe przyczyny zaburzeń rozwojowych...

Konkurs: OPUS 19 , panel: NZ7

Kierownik: prof. Maria Jadwiga Augustyniak

Uniwersytet Śląski w Katowicach, Wydział Nauk Przyrodniczych

Wieloskalowa przestrzenna reorganizacja chromatyny w odpowiedzi na stres replikacyjny i jej rola w ochronie przed niesta...

Konkurs: OPUS 19 , panel: NZ2

Kierownik: prof. Dariusz Michał Plewczyński

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Przestrzenny model sieciowy zróżnicowania sekwencji i struktury genomu ludzkiego w skali populacyjnej

Konkurs: PRELUDIUM BIS 1 , panel: ST6

Kierownik: prof. Dariusz Michał Plewczyński

Politechnika Warszawska, Wydział Matematyki i Nauk Informacyjnych

Wykorzystanie metody głębokiego uczenia w analizie sekwencji genomu zwierząt hodowlanych

Konkurs: PRELUDIUM BIS 1 , panel: NZ9

Kierownik: prof. Joanna Szyda

Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu, Wydział Biologii i Hodowli Zwierząt

Eksploracja cech i modelowanie struktury kwadrupleksów

Konkurs: OPUS 18 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Marta Xymena Szachniuk

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki i Telekomunikacji

Modelowanie matematyczne procesów neutralizacji reaktywnych form tlenu w różnych typach komórek

Konkurs: PRELUDIUM 18 , panel: ST6

Kierownik: Sylwia Monika Ciesielska

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Telekomunikacyjne podejście do modelowania metabolizmu komórek

Konkurs: OPUS 17 , panel: ST6

Kierownik: prof. Tadeusz Antoni Wysocki

Politechnika Bydgoska im. Jana i Jędrzeja Śniadeckich, Wydział Telekomunikacji, Informatyki i Elektrotechniki

Algorytmy i modele statystyczne służące do przewidywania schematów fragmentacji cząsteczek podczas dysocjacji indukowane...

Konkurs: PRELUDIUM 17 , panel: ST6

Kierownik: Grzegorz Marek Skoraczyński

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Biologicznie Znacząca Rekonstrukcja Sieci Filogenetycznych

Konkurs: OPUS 17 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Paweł Piotr Górecki

Uniwersytet Warszawski

Kataliza DNA: w poszukiwaniu odpowiedzi

Konkurs: SONATA 14 , panel: NZ2

Kierownik: dr Maria Ponce Salvatierra

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

Mechanizmy zwiększenia cytotoksyczności fleomycyny przez antymon i kadm u modelowego organizmu drożdży Saccharomyces cer...

Konkurs: PRELUDIUM 16 , panel: NZ2

Kierownik: Ewa Pilarczyk

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Nauk Biologicznych

Analiza cytogenomiczna istotnych zagadnień organizacji genomu jądrowego poliploidalnej trawy modelowej Brachypodium hybr...

Konkurs: OPUS 16 , panel: NZ3

Kierownik: prof. Robert Hasterok

Uniwersytet Śląski w Katowicach, Wydział Nauk Przyrodniczych

Połączenie metody Rosetta z gruboziarnistym modelem SURPASS w nowy wieloskalowy algorytm modelowania białek i ich komple...

Konkurs: OPUS 15 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Dominik Gront

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Głębokie sztuczne sieci neuronowe w integracji profilu ekspresji krążących i wewnątrzkomórkowych cząsteczek miRNA pacjen...

Konkurs: PRELUDIUM 15 , panel: NZ5

Kierownik: dr Konrad Stawiski

Uniwersytet Medyczny w Łodzi, Wydział Lekarski

Rola i współdziałanie dehydrogenazy AidB i dioksygenazy AlkB w naprawie uszkodzeń zasad DNA i RNA

Konkurs: OPUS 15 , panel: NZ3

Kierownik: dr hab. Agnieszka Maciejewska

Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

Koherentne Modele i Wydajne Algorytmy dla Duplikacji Genomowych

Konkurs: OPUS 14 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Paweł Górecki

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Rozwój metod statystycznych i algorytmicznych stosowanych w spektroskopii mas

Konkurs: SONATA 13 , panel: ST6

Kierownik: dr Michał Startek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Zintegrowane podejście do modelowania struktury i dynamiki białek z wykorzystaniem gruboziarnistego pola siłowego UNRES ...

Konkurs: HARMONIA 9 , panel: ST4

Kierownik: dr hab. Cezary Czaplewski

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Opracowanie nowych metod projektowania cząsteczek RNA o zadanej strukturze oraz zastosowanie ich do konstruowania nowych...

Konkurs: OPUS 13 , panel: NZ2

Kierownik: prof. Janusz Bujnicki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Efektywne algorytmy symulacji modeli procesów stochastycznych w biologii obliczeniowej oraz metody syntezy modeli szlakó...

Konkurs: OPUS 12 , panel: ST6

Kierownik: dr Krzysztof Puszyński

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Opracowanie metod korekcji obciążenia pomiarów poziomu ekspresji genów

Konkurs: SONATA 12 , panel: ST7

Kierownik: dr Roman Jaksik

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Wykrywanie źródeł zaburzeń sygnalizacja w komórkach rakowych

Konkurs: PRELUDIUM 12 , panel: ST6

Kierownik: Karol Nienałtowski

Instytut Podstawowych Problemów Techniki Polskiej Akademii Nauk

Gruboziarnista metoda do modelowania struktury przestrzennej cząsteczek RNA, uwzględniająca niekanoniczne parowania zasa...

Konkurs: OPUS 12 , panel: ST6

Kierownik: dr Michał Boniecki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

RNApolis - metody i algorytmy do modelowania i analizy struktury RNA

Konkurs: OPUS 12 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Marta Szachniuk

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki i Telekomunikacji

Rozróżnienie pomiędzy współistniejącymi zjawiskami hybrydyzacji oraz ułatwionego samozapłodnienia u blisko spokrewnionyc...

Konkurs: OPUS 12 , panel: NZ8

Kierownik: prof. Barbara Płytycz

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biologii

Modelowanie Monte Carlo odpowiedzi komórki na uszkodzenia DNA pod wpływem wiązek mieszanych

Konkurs: SONATA 12 , panel: ST7

Kierownik: dr Beata Brzozowska-Wardecka

Uniwersytet Warszawski, Wydział Fizyki

Włączenie informacji o genetycznej różnorodności do analizy danych z sekwencjonowania DNA

Konkurs: OPUS 11 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Norbert Dojer

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

MLGenSig (Machine Learning Genetic Signatures) Metody uczenia maszynowego w budowie zintegrowanych sygnatur genetycznych

Konkurs: OPUS 11 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Przemysław Biecek

Politechnika Warszawska, Wydział Matematyki i Nauk Informacyjnych

Bayesowska analiza podtypów raka pęcherza moczowego na podstawie wysokoprzepustowych danych

Konkurs: PRELUDIUM 11 , panel: ST6

Kierownik: Krzysztof Gogolewski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Wiarygodność Modeli Horyzontalnego Transferu Genów

Konkurs: PRELUDIUM 11 , panel: ST6

Kierownik: Agnieszka Mykowiecka

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Nowe algorytmy do oceny struktur klonalnych oraz do modelowania niejednorodnych ewolucji dla zastosowań w genomice nowot...

Konkurs: OPUS 11 , panel: ST6

Kierownik: prof. Andrzej Polański

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Modelowanie gruboziarniste kationów wapniowych, sodowych, magnezowych i potasowych z białkami

Konkurs: PRELUDIUM 11 , panel: ST4

Kierownik: dr Agnieszka Lipska

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Specyficzne oddziaływania białko-DNA a sensybilizowane uszkodzenia fotochemiczne i radiacyjne w modyfikowanych oligonukl...

Konkurs: ETIUDA 4 , panel: ST5

Kierownik: Paweł Wityk

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Bioinformatyczne metody modelowania i weryfikacji hipotezy Świata RNA.

Konkurs: ETIUDA 4 , panel: ST6

Kierownik: Natalia Szóstak

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki

INNOwacyjne SubstancjE Przeciwbakteryjne do Terapii o szerokim spektrum działania

Konkurs: OPUS 10 , panel: NZ7

Kierownik: dr Sebastian Kraszewski

Politechnika Wrocławska

Wieloskalowe modelowanie mechanizmu indukowanej przez ceramid śmierci komórek nerwowych

Konkurs: PRELUDIUM 10 , panel: ST6

Kierownik: Weronika Wronowska

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Genomika Obliczeniowa: Problemy, Algorytmy i Modele

Konkurs: OPUS 10 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Paweł Górecki

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Narzędzia bioinformatyczne do automatycznej identyfikacji obszarów guza i jego heterogeniczności na bazie profili metabo...

Konkurs: OPUS 10 , panel: ST6

Kierownik: prof. Joanna Polańska

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Protokół wirtualnych badań przesiewowych oparty o automatycznie generowane modele farmakoforowe na bazie wyodrębnionych ...

Konkurs: HARMONIA 7 , panel: NZ2

Kierownik: Stefan Mordalski

Instytut Farmakologii PAN