Projekty finansowane przez NCN
Gruboziarnista metoda do modelowania struktury przestrzennej cząsteczek RNA, uwzględniająca niekanoniczne parowania zasad.
2016/23/B/ST6/03433
Słowa kluczowe:
struktura RNA parowania niekanoniczne RNA modele gruboziarniste potencjały statystyczne metody Monte Carlo
Deskryptory:
- ST6_12: Obliczenia naukowe, narzędzia modelowania i symulacji
- ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
- NZ1_4: Biologia strukturalna
Panel:
ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne
Jednostka realizująca:
Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej
woj. mazowieckie
Konkurs: OPUS 12 - ogłoszony 2016-09-15
Przyznana kwota: 741 250 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2017-09-01
Zakończenie projektu: 2021-12-31
Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt zakończony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (1)
- Publikacje książkowe (1)
- SimRNAweb v2.0: a web server for RNA folding simulations and 3D structure modeling, with optional restraints and enhanced analysis of folding trajectoriesAutorzy:S. Naeim Moafinejad , Belisa R.H. de Aquino, MichałJ. Boniecki, Iswarya P.N. Pandar anadar Je y er am, Grig ory Nikolaev, Mar cin Magnus, Masoud Amir i F arsani, Nagendar Goud Badepally, Tomasz K. Wirecki, Filip Stefaniak and Janusz M. BujnickiCzasopismo:Nucleic Acids Research (rok: 2024, tom: 52, strony: W368–W373), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/nar/gkae356 - link do publikacji
- Modeling of three-dimensional RNA structures using SimRNAAutorzy:Tomasz K. Wirecki, Chandran Nithin, Sunandan Mukherjee, Janusz M. Bujnicki, Michał J. BonieckiKsiążka:Protein Structure Prediction (4th edition), Methods in Molecular Biology (rok: 2020, tom: 2165, strony: 103-125), Wydawca: SpringerStatus:Opublikowana