Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Biologicznie Znacząca Rekonstrukcja Sieci Filogenetycznych

2019/33/B/ST6/00737

Słowa kluczowe:

sieć filogenetyczna drzewo genów drzewo gatunków zdarzenie sieciowe horyzontalny transfer genów rekombinacja hybdrydyzacja drzewo uzgadniające algorytm duplikacja genu głęboka koalescencja metryka drzewowa

Deskryptory:

  • ST6_12: Obliczenia naukowe, narzędzia modelowania i symulacji
  • ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
  • ST6_6: Algorytmika, algorytmy równoległe, rozproszone i sieciowe, algorytmiczna teoria gier

Panel:

ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski

woj.

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Paweł Piotr Górecki 

Liczba wykonawców projektu: 9

Konkurs: OPUS 17 - ogłoszony 2019-03-15

Przyznana kwota: 888 300 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2020-02-01

Zakończenie projektu: 2025-02-05

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt zakończony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (9)
  1. Conflict Resolution Algorithms for Deep Coalescence Phylogenetic Networks
    Autorzy:
    Wawerka, Marcin ; Dąbkowski, Dawid ; Rutecka, Natalia ; Mykowiecka, Agnieszka ; Górecki, Paweł
    Czasopismo:
    Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs) (rok: 2021, tom: 201, strony: 17:1--17:21), Wydawca: Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs)
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4230/LIPIcs.WABI.2021.17 - link do publikacji
  2. Embedding Gene Trees into Phylogenetic Networks by Conflict Resolution Algorithms
    Autorzy:
    Marcin Wawerka, Dawid Dąbkowski, Natalia Rutecka, Agnieszka Mykowiecka, Paweł Górecki
    Czasopismo:
    Algorithms for Molecular Biology (rok: 2022, tom: 17, strony: --), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s13015-022-00218-8 - link do publikacji
  3. Embedding Gene Trees into Phylogenetic Networks by Conflict Resolution Algorithms
    Autorzy:
    Marcin Wawerka, Dawid Dąbkowski, Natalia Rutecka, Agnieszka Mykowiecka, Paweł Górecki
    Czasopismo:
    Algorithms for Molecular Biology , Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Złożona
  4. Rooting Gene Trees via Phylogenetic Networks
    Autorzy:
    Jerzy Tiuryn, Natalia Rutecka, Paweł Górecki
    Czasopismo:
    Lecture Notes in Computer Science (rok: 2022, tom: 13595, strony: 419–431), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/978-3-031-22105-7_37 - link do publikacji
  5. Conflict Resolution Algorithms for Deep Coalescence Phylogenetic Networks
    Autorzy:
    Wawerka, Marcin ; Dąbkowski, Dawid ; Rutecka, Natalia ; Mykowiecka, Agnieszka ; Górecki, Paweł
    Czasopismo:
    Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs) (rok: 2021, tom: 201, strony: 17:1--17:21), Wydawca: Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs)
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4230/LIPIcs.WABI.2021.17 - link do publikacji
  6. Embedding Gene Trees into Phylogenetic Networks by Conflict Resolution Algorithms
    Autorzy:
    Marcin Wawerka, Dawid Dąbkowski, Natalia Rutecka, Agnieszka Mykowiecka, Paweł Górecki
    Czasopismo:
    Algorithms for Molecular Biology (rok: 2022, tom: 17, strony: --), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s13015-022-00218-8 - link do publikacji
  7. The interkingdom horizontal gene transfer in 44 early diverging fungi boosted their metabolic, adaptive, and immune capabilities
    Autorzy:
    Michał Aleksander Ciach, Julia Pawłowska, Paweł Górecki, Anna Muszewska
    Czasopismo:
    Evolution Letters (rok: 2024, tom: qrae009, strony: 45670), Wydawca: Oxford Academic Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/evlett/qrae009 - link do publikacji
  8. Rooting Gene Trees via Phylogenetic Networks
    Autorzy:
    Jerzy Tiuryn, Natalia Rutecka, Paweł Górecki
    Czasopismo:
    Lecture Notes in Computer Science (rok: 2022, tom: 13595, strony: 419–431), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/978-3-031-22105-7_37 - link do publikacji
  9. Conflict Resolution Algorithms for Deep Coalescence Phylogenetic Networks
    Autorzy:
    Wawerka, Marcin ; Dąbkowski, Dawid ; Rutecka, Natalia ; Mykowiecka, Agnieszka ; Górecki, Paweł
    Czasopismo:
    Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs) (rok: 2021, tom: 201, strony: 17:1--17:21), Wydawca: Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs)
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4230/LIPIcs.WABI.2021.17 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy