Projekty finansowane przez NCN
Rozwój metod statystycznych i algorytmicznych stosowanych w spektroskopii mas
2017/26/D/ST6/00304
Słowa kluczowe:
spektrometria mas algorytmika statystyka obwiednie izotopowe
Deskryptory:
- ST6_6: Algorytmika, algorytmy równoległe, rozproszone i sieciowe, algorytmiczna teoria gier
- ST6_12: Obliczenia naukowe, narzędzia modelowania i symulacji
- ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
Panel:
ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki
woj. mazowieckie
Konkurs: SONATA 13 - ogłoszony 2017-06-14
Przyznana kwota: 348 500 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2018-04-20
Zakończenie projektu: 2022-10-19
Planowany czas trwania projektu: 54 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Komputer przenośny (laptop) (2 szt.). Za kwotę 16 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (5)
- Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
- IsoSpec2: Ultrafast Fine Structure CalculatorAutorzy:Mateusz K. Łącki, Dirk Valkenborg, and Michał P. StartekCzasopismo:Analytical Chemistry (rok: 2020, tom: 92, strony: 9472-9475), Wydawca: American Chemical SocietyStatus:OpublikowanaDoi:10.1021/acs.analchem.0c00959 - link do publikacji
- Masserstein: linear regression of mass spectra by optimal transportAutorzy:Michał Aleksander Ciach, Błazej Miasojedow, Grzegorz Skoraczynski, Szymon Majewski, Michał Startek, Dirk Valkenborg, Anna GambinCzasopismo:Rapid Communications in Mass Spectrometry (rok: 2021, tom: e8956, strony: N/A (wydanie elektroniczne)), Wydawca: John Wiley & SonsStatus:OpublikowanaDoi:10.1002/rcm.8956 - link do publikacji
- masstodon: A Tool for Assigning Peaks and Modeling Electron Transfer Reactions in Top-Down Mass SpectrometryAutorzy:Mateusz K. Łącki, Frederik Lermyte, Błazej Miasojedow, Michał P. Startek, Frank Sobott, Dirk Valkenborg, Anna GambinCzasopismo:Analytical Chemistry (rok: 2019, tom: 91, strony: 1801-1807), Wydawca: American Chemical Society PublicationsStatus:OpublikowanaDoi:10.1021/acs.analchem.8b01479 - link do publikacji
- Envemind: Accurate Monoisotopic Mass Determination Based On Isotopic EnvelopeAutorzy:Piotr Radziński, Dirk Valkenborg, Michał Piotr Startek, Anna GambinCzasopismo:Journal of the American Society for Mass Spectrometry (rok: 2022, tom: 33, strony: 2063-2069), Wydawca: American Chemical SocietyStatus:OpublikowanaDoi:10.1021/jasms.2c00176 - link do publikacji
- OpenMS 3 expands the frontiers of open-source computational mass spectrometryAutorzy:Julianus Pfeuffer , Chris Bielow , Samuel Wein , Kyowon Jeong , Eugen Netz , Axel Walter , Oliver Alka , Lars Nilse , Pasquale Colaianni , Douglas McCloskey , Jihyung Kim , George Rosenberger , Leon Bichmann , Mathias Walzer , Johannes Veit , Bertrand Boudaud , Matthias Bernt , Nikolaos Patikas , Matteo Pilz , Michał Startek , Svetlana Kutuzova , Lukas Heumos , Joshua Charkow , Justin Sing , Ayesha Feroz , Arslan Siraj , Hendrik Weisser , Tjeerd Dijkstra , Yasset Perez-Riverol , Hannes Röst , Oliver KohlbacherCzasopismo:Nature Methods , Wydawca: Nature PortfolioStatus:ZłożonaDoi:10.21203/rs.3.rs-3286368/v1 - link do publikacji
- The Wasserstein Distance as a Dissimilarity Measure for Mass Spectra with Application to Spectral DeconvolutionAutorzy:Szymon Majewski, Michał Aleksander Ciach, Michał Startek, Wanda Niemyska, Błażej Miasojedow, Anna GambinKonferencja:Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI) 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: Schloss Dagstuhl-Leibniz-Zentrum fuer InformatikData:konferencja 20-24 sierpniaStatus:Opublikowana