Projekty finansowane przez NCN
Nowa metodologia dla lepszego zrozumienia oddziaływań ligandów z RNA.
2020/39/B/NZ2/03127
Słowa kluczowe:
RNA,małe molekuły oddziaływania RNA z ligandem racjonalne projektowanie leków
Deskryptory:
- NZ2_7: Bioinformatyka
- ST6_12: Obliczenia naukowe, narzędzia modelowania i symulacji
- ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie
woj.
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 2
Konkurs: OPUS 20 - ogłoszony 2020-09-15
Przyznana kwota: 671 000 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2021-11-01
Zakończenie projektu: 2024-11-01
Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt zakończony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (4)
- RNA tertiary structure prediction in CASP15 by the GeneSilico group: Folding simulations based on statistical potentials and spatial restraintsAutorzy:Eugene F. Baulin; Sunandan Mukherjee; S. Naeim Moafinejad; Tomasz K. Wirecki; Nagendar Goud Badepally; Farhang Jaryani; Filip Stefaniak; Masoud Amiri Farsani; Angana Ray; Tales Rocha de Moura; Janusz M. BujnickiCzasopismo:Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics (rok: 2023, tom: 91, strony: 1800-1810), Wydawca: John Wiley & Sons, IncStatus:OpublikowanaDoi:10.1002/prot.26575 - link do publikacji
- fingeRNAt—A novel tool for high-throughput analysis of nucleic acid-ligand interactionsAutorzy:Natalia A. Szulc , Zuzanna Mackiewicz, Janusz M. Bujnicki , Filip StefaniakCzasopismo:PLoS Computational Biology (rok: 2022, tom: 18(6), strony: 12785), Wydawca: Public Library of ScienceStatus:OpublikowanaDoi:10.1371/journal.pcbi.1009783 - link do publikacji
- fingeRNAt—A novel tool for high-throughput analysis of nucleic acid-ligand interactionsAutorzy:Natalia A. Szulc , Zuzanna Mackiewicz, Janusz M. Bujnicki , Filip StefaniakCzasopismo:PLoS Computational Biology (rok: 2022, tom: 18(6), strony: 12785), Wydawca: Public Library of ScienceStatus:OpublikowanaDoi:10.1371/journal.pcbi.1009783 - link do publikacji
- Structural interaction fingerprints and machine learning for predicting and explaining binding of small molecule ligands to RNAAutorzy:Natalia A Szulc, Zuzanna Mackiewicz, Janusz M Bujnicki, Filip StefaniakCzasopismo:Briefings in Bioinformatics (rok: 2023, tom: 24, strony: 45681), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/bib/bbad187 - link do publikacji