Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Efektywne algorytmy symulacji modeli procesów stochastycznych w biologii obliczeniowej oraz metody syntezy modeli szlaków sygnałowych

2016/23/B/ST6/03455

Słowa kluczowe:

biologia obliczeniowa szlaki sygnałowe modelowanie i symulacja

Deskryptory:

  • ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
  • ST6_12: Obliczenia naukowe, narzędzia modelowania i symulacji
  • ST7_4: Inżynieria systemów, sensoryka, automatyka

Panel:

ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne

Jednostka realizująca:

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

woj. śląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Krzysztof Puszyński 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 12 - ogłoszony 2016-09-15

Przyznana kwota: 895 400 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2017-08-24

Zakończenie projektu: 2021-08-23

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Komputer przenośny. Za kwotę 7 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (10)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (3)
  • Publikacje książkowe (3)
  1. Petri nets and ODEs as complementary methods for comprehensive analysis on an example of the ATM–p53–NF-κB signaling pathways
    Autorzy:
    Gutowska K, Kogut D, Kardynska M, Formanowicz P, Smieja J, Puszynski K
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2021, tom: N.A., strony: N.A.), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-022-04849-0 - link do publikacji
  2. Heat shock response regulates stimulus-specificity and sensitivity of the pro-inflammatory NF-κB signalling
    Autorzy:
    Paszek A, Kardyńska M, Begnall J, Smieja J, Spiller D, Widlak P, Kimmel M, Widlak W, Paszek P
    Czasopismo:
    Cell Communication and Signaling (rok: 2020, tom: 18, strony: 45312), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12964-020-00583-0 - link do publikacji
  3. Activation of the atypical NF-κB pathway induced by ionizing radiation is not affected by a p53 status.
    Autorzy:
    Gracjana Zając, Marek Rusin, Barbara Łasut-Szyszka, Krzysztof Puszyński, Piotr Widłak
    Czasopismo:
    Acta Biochimica Polonica (rok: 2021, tom: N.A., strony: N.A.), Wydawca: Polish Biochemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.18388/abp.2020_5942 - link do publikacji
  4. Application of Sensitivity Analysis for Molecular Drug Targets Searching with Regard to the NF-κB Signaling Pathway
    Autorzy:
    Kardyńska M, Smieja J, Puszynski K
    Czasopismo:
    International Journal of Pharma Medicine and Biological Sciences (rok: 2021, tom: 1, strony: 82-87), Wydawca: IJPMBS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.2.82-87 - link do publikacji
  5. Sensitivity Analysis Aimed at Finding Potential Molecular Drug Targets
    Autorzy:
    Jaroslaw Smieja, Małgorzata Kardyńska, Marta Pudlo
    Czasopismo:
    Mathematica Applicanda (Matematyka Stosowana) (rok: 2019, tom: 47 (2), strony: 197-205), Wydawca: Polskie Towarzystwo Matematyczne
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.14708/ma.v47i2.6488 - link do publikacji
  6. Application of sensitivity analysis to discover potential molecular drug targets
    Autorzy:
    Malgorzata Kardynska, Jaroslaw Smieja, Pawel Paszek, Krzysztof Puszynski
    Czasopismo:
    European Journal of Pharmacology (rok: 2020, tom: n.d., strony: n.d.), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Złożona
    Doi:
    brak - link do publikacji
  7. Computational determination of the optimal dose of the cis-platinum to maximize the life time of patients diagnosed with cancer
    Autorzy:
    Emilia Kozłowska, Krzysztof Puszynski
    Czasopismo:
    Mathematica Applicanda (Matematyka Stosowana) (rok: 2019, tom: 47 (2), strony: 187-196), Wydawca: Polskie Towarzystwo Matematyczne
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.14708/ma.v47i2.6485 - link do publikacji
  8. Piece-wise linear models of biological systems - Application, analysis, and comparison with nonlinear models using the example of the p53 regulatory module
    Autorzy:
    Magdalena Ochab, Krzysztof Puszynski
    Czasopismo:
    Plos One (rok: 2020, tom: 1, strony: 20), Wydawca: PLOS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0243823 - link do publikacji
  9. Quantitative analysis reveals crosstalk mechanisms of heat shock-induced attenuation of NF-κB signaling at the single cell level.
    Autorzy:
    Kardyńska M, Paszek A, Smieja J, Spiller D, Widlak W, White MR, Paszek P, Kimmel M
    Czasopismo:
    Plos Computational Biology (rok: 2018, tom: 14, strony: 25), Wydawca: Plos Computational Biology
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pcbi.1006130 - link do publikacji
  10. Single stranded-DNA detection: the role of Wip1 in ATR-dependent pathway.
    Autorzy:
    Kurpas M, Jonak K, Puszynski K
    Czasopismo:
    Mathematica Applicanda (Matematyka Stosowana) (rok: 2018, tom: 46, strony: 10), Wydawca: Polskie Towarzystwo Matematyczne
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.14708/ma.v46i1.6375 - link do publikacji
  1. Apoptotic Regulatory Module as Switched Control System - Analysis of Asymptotic Properties
    Autorzy:
    Ochab M , Swierniak Andrzej , Klamka Jerzy , Puszynski Krzysztof
    Konferencja:
    the 11th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies (BIOSTEC 2018) (rok: 2018, ), Wydawca: SCITEPRESS – Science and Technology Publications, Lda.
    Data:
    konferencja 19-21.01.2018
    Status:
    Opublikowana
  2. Correction of the genes expression measurements based on the probes design features.
    Autorzy:
    Krzysztof Puszynski ; Anna Lalik ; Roman Jaksik
    Konferencja:
    The 13th International Conference on Signal Processing and Communication Systems, ICSPCS'2019 (rok: 2019, ), Wydawca: IEEE
    Data:
    konferencja 43815
    Status:
    Opublikowana
  3. Influence of the Stochasticity in the Model on the Certain Drugs Pharmacodynamics
    Autorzy:
    Krzysztof Puszynski
    Konferencja:
    7th International Work-Conference, IWBBIO 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: Springer Nature Switzerland AG 2019
    Data:
    konferencja 43593
    Status:
    Opublikowana
  1. System with switchings as models of regulatory modules in genomic cell systems
    Autorzy:
    Andrzej Swierniak, Magdalena Ochab, Krzysztof Puszynski
    Książka:
    Studies in Systems, Decision and Control (rok: 2020, tom: 1, strony: 29), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
  2. Układy sterowania z przełaczeniami jako modele modułów regulacyjnych w sieciach genowo-komórkowych
    Autorzy:
    Andrzej Swierniak, Magdalena Ochab, Krzysztof Puszynski
    Książka:
    Automatyka, robotyka i przetwarzanie informacji (rok: 2019, tom: 1, strony: 31), Wydawca: PWN
    Status:
    Opublikowana
  3. Influence of the Number of Thresholds on the Dynamics of Models with Switchings of the Biological Systems
    Autorzy:
    Magdalena Ochab, Krzysztof Puszynski
    Książka:
    Advanced, Contemporary Control (rok: 2020, tom: 1, strony: 587-598), Wydawca: Springer, Cham
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy