Projekty finansowane przez NCN

Obliczeniowy model specyficznej tkankowo regulacji genów.

Konkurs: ETIUDA 3 , panel: NZ2

Kierownik: Paweł Bednarz

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Wykorzystanie metod uczenia maszynowego w zadaniach komputerowo wspomaganego projektowania leków.

Konkurs: ETIUDA 3 , panel: NZ2

Kierownik: Sabina Podlewska

Instytut Farmakologii PAN

Porównawcza analiza strukturalno-funkcjonalna in silico białek STAT i IRF, w celu identyfikacji związków chemicznych, dz...

Konkurs: ETIUDA 3 , panel: NZ2

Kierownik: Małgorzata Szeląg

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Identyfikacja elementów regulatorowych i czynników transkrypcyjnych odpowiedzialnych za różnice w transkrypcji genów pom...

Konkurs: PRELUDIUM 8 , panel: NZ2

Kierownik: Paweł Bednarz

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Opracowanie wielostanowego komputera DNA poprzez zastosowanie wielu enzymów restrykcyjnych

Konkurs: OPUS 1 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Tomasz Popławski

Uniwersytet Łódzki, Wydział Biologii i Ochrony Środowiska

seQinspector - analiza mechanizmów regulacji transkrypcji genów w skali całego genomu

Konkurs: PRELUDIUM 1 , panel: NZ2

Kierownik: dr Marcin Piechota

Instytut Farmakologii PAN

Stochastyczne zmiany fenotypu dzielących się bakterii

Konkurs: PRELUDIUM 7 , panel: NZ2

Kierownik: dr Joanna Jaruszewicz-Błońska

Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN

Mechanizmy determinujące los komórki w odpowiedzi na stress. Analiza eksperymentalna i teoretyczna

Konkurs: OPUS 7 , panel: NZ2

Kierownik: prof. Tomasz Lipniacki

Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN

PerM-Cloud, Algorytmy i metody przetwarzania dużych zbiorów danych genomicznych w środowiskach chmur obliczeniowych na p...

Konkurs: OPUS 7 , panel: NZ2

Kierownik: dr Michał Okoniewski

Politechnika Warszawska, Wydział Elektroniki i Technik Informacyjnych

Teoretyczne badania nad strukturą receptorów związanych z białkiem G. Narzędzia wspomagające modelowanie homologiczne or...

Konkurs: ETIUDA 2 , panel: NZ2

Kierownik: Stefan Mordalski

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii

Regulacja kaskady RAF/MEK/ERK przez izoformy RAF

Konkurs: PRELUDIUM 6 , panel: NZ2

Kierownik: Paweł Kocieniewski

Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN

Badanie struktury centrum aktywnego gamma-sekretazy oraz jej interakcji z wybranymi substratami.

Konkurs: PRELUDIUM 5 , panel: NZ2

Kierownik: Krzysztof Młynarczyk

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Opracowanie narzędzia do automatycznej oceny kompleksów ligandów z receptorami serotoninowymi opartego o wykorzystanie m...

Konkurs: PRELUDIUM 5 , panel: NZ2

Kierownik: Sabina Podlewska

Instytut Farmakologii PAN

Mechanizm wiązania liganda oraz zmiany konformacyjne w cząsteczce receptora beta2-adrenergicznego

Konkurs: SONATA 5 , panel: NZ2

Kierownik: dr Anita Płazińska

Uniwersytet Medyczny w Lublinie, Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Analityki Medycznej

Zostosowanie wysoko wydajnych metod obliczeniowych do modelowania dynamiki dywersyfikacji hemaglutyniny wirusa grypy

Konkurs: OPUS 5 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Dariusz Plewczyński

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Emergentne własności biologicznych krajobrazów dostosowania na podstawie modeli sztucznego życia

Konkurs: PRELUDIUM 4 , panel: NZ2

Kierownik: dr Marcin Zagórski

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej

Teoretyczny model SH2-zależnej dimeryzacji białka STAT1 jako nowe narzędzie do identyfikacji specyficznych inhibitorów a...

Konkurs: PRELUDIUM 4 , panel: NZ2

Kierownik: Małgorzata Szeląg

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Analiza struktury sekwencji regulatorowych i predykcja dynamiki ekspresji genów.

Konkurs: PRELUDIUM 3 , panel: NZ2

Kierownik: dr Marta Iwanaszko

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Przewidywanie struktury kompleksu Cascade.

Konkurs: PRELUDIUM 3 , panel: NZ2

Kierownik: dr Joanna Kasprzak

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Metody obliczeniowe do detekcji mutacji związanych z opornością na antybiotyki w szczepach bakteryjnych

Konkurs: PRELUDIUM 3 , panel: ST6

Kierownik: Michał Woźniak

Uniwersytet Warszawski

Całościowa adnotacja enhancerów ssaków w oparciu o dane genomowe i funkcjonalne

Konkurs: OPUS 3 , panel: NZ2

Kierownik: prof. Jerzy Tiuryn

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Projektowanie nowych związków, wpływających na agregację beta-amyloidu oraz przekaźnictwo cholinergiczne, metodami model...

Konkurs: FUGA 1 , panel: NZ2

Kierownik: dr Marek Bajda

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Nowa metoda bioinformatyczna do predykcji miejsc wiązania ligandów w strukturach RNA

Konkurs: PRELUDIUM 2 , panel: NZ2

Kierownik: dr Anna Philips

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Wydział Biologii

Całościowe przewidywanie kooperatywnych elementów regulatorowych w genomach eukariotycznych

Konkurs: PRELUDIUM 2 , panel: NZ2

Kierownik: Aleksander Jankowski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Opracowanie nowej funkcji oceniającej modele kompleksów białek z małymi cząsteczkami i jej zastosowanie do zbadania oddz...

Konkurs: PRELUDIUM 2 , panel: NZ2

Kierownik: dr Irina Tuszyńska

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Metody obliczeniowe dla zrozumienia mikrośrodowiska immunologicznego nowotworów na podstawie danych obrazowania przestrz...

Konkurs: SONATA 19 , panel: NZ2

Kierownik: dr Krzysztof Gogolewski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Badanie wpływu cech genomowych na sygnatury mutacyjne w nowotworach

Konkurs: OPUS 26 , panel: NZ2

Kierownik: dr Damian Wójtowicz

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Czy introny fagowe to luka w naszej wiedzy?

Konkurs: SONATA BIS 13 , panel: NZ2

Kierownik: dr Jakub Barylski

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Optymalizacja gruboziarnistych symulacji dynamiki molekularnej do badania tuneli dużych białek z zagłębionymi miejscami ...

Konkurs: PRELUDIUM 22 , panel: NZ2

Kierownik: Nishita Mandal

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Matematyczne modelowanie roli mikro-RNA w regulacji poziomu transkryptów i efektywności translacji w komórkach napromien...

Konkurs: OPUS 23 , panel: NZ2

Kierownik: prof. Marek Kimmel

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Rola i właściwości fizyczne trójwymiarowej struktury chromatyny w różnicowaniu komórek krwiotwórczych w odpowiedzi na pr...

Konkurs: PRELUDIUM BIS 3 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Jakub Mieczkowski

Gdański Uniwersytet Medyczny, Międzynarodowa Agenda Badawcza

Znaczenie zjawiska "discordant methylation" w fizjologii komórki

Konkurs: OPUS 22 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Tomasz Wojdacz

Pomorski Uniwersytet Medyczny w Szczecinie

Wielo-skalowa metoda składania włókien amyloidowych przy użyciu struktur protofilamentów przewidzianych na podstawie gru...

Konkurs: OPUS 22 , panel: NZ2

Kierownik: dr Michał Koliński

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego Polskiej Akademii Nauk

Zrozumienie biofizycznych czynników ograniczających precyzję powstawania wzoru w trakcie rozwoju tkanki

Konkurs: SONATA BIS 11 , panel: NZ2

Kierownik: dr Marcin Zagórski

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej

Funkcjonalne czy niefunkcjonalne? Analiza pozycyjnie zachowanych ortologów długich niekodujących RNA w genomach kręgowcó...

Konkurs: SONATA BIS 11 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Barbara Uszczyńska-Ratajczak

Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk

Genomika ewolucyjna: modelowanie i przewidywanie progresji nowotworów piersi i płuc

Konkurs: OPUS 21 , panel: NZ2

Kierownik: prof. Marek Kimmel

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Przewidywanie i charakteryzajca rozmieszczenia miejsc crossing-over u rzepaku (Brassica napus) z wykorzystaniem technolo...

Konkurs: PRELUDIUM 20 , panel: NZ2

Kierownik: Piotr Kopeć

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Zastosowanie sekwencjonowania następnej generacji i narzędzi obliczeniowych do określenia ekspresji niekodujących RNA u ...

Konkurs: PRELUDIUM 20 , panel: NZ2

Kierownik: Daniel Jakubik

Warszawski Uniwersytet Medyczny

Racjonalna inżynieria acylazy penicyliny G z E. coli w celu zwalczania bakterii w oparciu o wygaszanie kworum jako skute...

Konkurs: PRELUDIUM 20 , panel: NZ2

Kierownik: Bartłomiej Surpeta

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Zintegrowane metody modelowania kompleksów białko-białko i złożonych układów biologicznych

Konkurs: SHENG 2 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Sebastian Kmiecik

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych

Systemy samouczące w projektowaniu związków modulujących aktywację receptorów GPCR.

Konkurs: OPUS 20 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Dorota Latek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Rozwój narzędzi do racjonalnego projektowania leków peptydowych

Konkurs: OPUS 20 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Sebastian Kmiecik

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych

Integracyjna analiza danych genomicznych z pojedynczych komórek

Konkurs: SONATA 16 , panel: NZ2

Kierownik: dr Aleksander Jankowski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

TUMORMAP: Wyznaczanie map pod-klonów guzów nowotworowych i ich mikrośrodowiska w ultrawysokiej rozdzielczości przestrzen...

Konkurs: SONATA BIS 10 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Ewa Szczurek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Genomika funkcjonalna resweratrolu, kurkuminy i podobnych antyoksydantów pochodzenia roślinnego.

Konkurs: OPUS 19 , panel: NZ2

Kierownik: dr Lukasz Huminiecki

Instytut Genetyki i Biotechnologii Zwierząt Polskiej Akademii Nauk

Specyficzność w wykrywaniu PTC w mRNA przez NMD i jego sieć, spostrzeżenia z perspektywy raka i sieciowanie (XL-MS)

Konkurs: SONATINA 4 , panel: NZ2

Kierownik: dr Umesh Kalathiya

Uniwersytet Gdański, Międzynarodowe Centrum Badań nad Szczepionkami Przeciwnowotworowymi

Identyfikacja i całościowa klasyfikacja peptydaz

Konkurs: SONATA 15 , panel: NZ2

Kierownik: dr Kamil Steczkiewicz

Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

Zintegrowana analiza genomicznej, fenotypicznej i przestrzennej heterogeniczności nowotworów

Konkurs: OPUS 17 , panel: NZ2

Kierownik: dr Ewa Szczurek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Opracowanie nowej metody dokowania białko-białko w oparciu o giętkie dokowanie krótkich fragmentów peptydowych.

Konkurs: OPUS 17 , panel: NZ2

Kierownik: dr Mateusz Kurciński

Uniwersytet Warszawski

Algorytmy składania genomów umożliwiające diagnostykę zespołów genetycznych

Konkurs: PRELUDIUM 17 , panel: ST6

Kierownik: Barbara Poszewiecka

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki