Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Rozwój narzędzi do racjonalnego projektowania leków peptydowych

2020/39/B/NZ2/01301

Słowa kluczowe:

projektowanie leków bioinformatyka strukturalna dokowanie białko-peptyd modelowanie gruboziarniste modelowanie wieloskalowe

Deskryptory:

  • NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
  • NZ2_8: Biologia obliczeniowa
  • NZ2_7: Bioinformatyka

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych

woj.

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Sebastian Kmiecik 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 20 - ogłoszony 2020-09-15

Przyznana kwota: 1 867 576 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2021-07-01

Zakończenie projektu: 2025-07-06

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt w realizacji

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (7)
  1. Protein–Protein Docking with Large-Scale Backbone Flexibility Using Coarse-Grained Monte-Carlo Simulations
    Autorzy:
    Kurcinski, M.; Kmiecik, S.; Zalewski, M.; Kolinski, A.
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2021, tom: 22, strony: 7341), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms22147341 - link do publikacji
  2. Structure prediction of linear and cyclic peptides using CABS-flex
    Autorzy:
    Aleksandra Badaczewska-Dawid, Karol Wróblewski, Mateusz Kurcinski, Sebastian Kmiecik
    Czasopismo:
    Briefings in bioinformatics (rok: 2024, tom: 25, 2, strony: 45665), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bib/bbae003 - link do publikacji
  3. MAPIYA contact map server for identification and visualization of molecular interactions in proteins and biological complexes.
    Autorzy:
    Badaczewska-Dawid A.E., Chandran N., Wróblewski K., Kurcinski M, Kmiecik S.
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2022, tom: 50, strony: W474–W482), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkac307 - link do publikacji
  4. A3D database: structure-based predictions of protein aggregation for the human proteome
    Autorzy:
    Badaczewska-Dawid A.E., Garcia-Pardo J.,Kuriata A., Pujols J., Ventura S., Kmiecik S.
    Czasopismo:
    Biorxiv (rok: 2021, tom: -, strony: -), Wydawca: -
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1101/2021.11.17.468872 - link do publikacji
  5. MAPIYA contact map server for identification and visualization of molecular interactions in proteins and biological complexes.
    Autorzy:
    Badaczewska-Dawid A.E., Chandran N., Wróblewski K., Kurcinski M, Kmiecik S.
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2022, tom: 50, strony: W474–W482), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkac307 - link do publikacji
  6. A3D database: structure-based predictions of protein aggregation for the human proteome
    Autorzy:
    Badaczewska-Dawid A.E., Garcia-Pardo J.,Kuriata A., Pujols J., Ventura S., Kmiecik S.
    Czasopismo:
    Biorxiv (rok: 2021, tom: -, strony: -), Wydawca: -
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1101/2021.11.17.468872 - link do publikacji
  7. Protein–Protein Docking with Large-Scale Backbone Flexibility Using Coarse-Grained Monte-Carlo Simulations
    Autorzy:
    Kurcinski, M.; Kmiecik, S.; Zalewski, M.; Kolinski, A.
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2021, tom: 22, strony: 7341), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms22147341 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy