Projekty finansowane przez NCN
Identyfikacja nowych, długich niekodujących RNA u Danio pręgowanego, czyli rzucanie nowego światła na ciemną materię genomu
2018/31/B/NZ2/01940
Słowa kluczowe:
lncRNAs long non-coding RNAs next-generation sequencing RNA Capture Sequencing Oxford Nanopore zebrafish genome annotation
Deskryptory:
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ2_7: Bioinformatyka
- NZ2_8: Biologia obliczeniowa
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk
woj. wielkopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
dr hab. Barbara Uszczyńska-Ratajczak
Liczba wykonawców projektu: 5
Konkurs: OPUS 16 - ogłoszony 2018-09-14
Przyznana kwota: 1 896 000 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2019-09-01
Zakończenie projektu: 2023-09-02
Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt zakończony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (2)
- The abundance of the long intergenic non-coding RNA 01087 differentiates between luminal and triple-negative breast cancers and predicts patient outcomeAutorzy:De Palma FDE, Del Monaco V, Pol JG, Kremer M, D'Argenio V, Stoll G, Montanaro D, Uszczyńska-Ratajczak B, Klein CC, Vlasova A, Botti G, D'Aiuto M, Baldi A, Guigó R, Kroemer G, Maiuri MC, Salvatore FCzasopismo:Pharmacological Research (rok: 2020, tom: 161, strony: bd), Wydawca: ElsevierStatus:OpublikowanaDoi:10.1016/j.phrs.2020.105249 - link do publikacji
- CapTrap-Seq: A platform-agnostic and quantitative approach for high-fidelity full-length RNA transcript sequencingAutorzy:Carbonell-Sala S, Perteghella T, Lagarde J, Nishiyori H, Palumbo E, Arnan C, Takahashi H, Carninci P, Uszczyńska-Ratajczak B, Guigó RCzasopismo:Nature Communications (rok: 2024, tom: 15, strony: 5278), Wydawca: Nature PortfolioStatus:OpublikowanaDoi:10.1038/s41467-024-49523-3 - link do publikacji