Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

TUMORMAP: Wyznaczanie map pod-klonów guzów nowotworowych i ich mikrośrodowiska w ultrawysokiej rozdzielczości przestrzennej i molekularnej

2020/38/E/NZ2/00305

Słowa kluczowe:

uczenie maszynowe modele probabilistyczne modelowanie przestrzenne oddziaływanie guz-mikrośrodowisko ewolucja guza obrazowanie guza

Deskryptory:

  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ2_8: Biologia obliczeniowa

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

woj.

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Ewa Szczurek 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: SONATA BIS 10 - ogłoszony 2020-07-29

Przyznana kwota: 1 927 200 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2021-04-09

Zakończenie projektu: 2026-04-08

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt w realizacji

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (2)
  1. SIEVE: joint inference of single nucleotide variants and cell phylogeny from single-cell DNA sequencing data
    Autorzy:
    S. Kang, N. Borgsmuller, M. Valecha, J. Kuipers, J.M. Alves, S. Prado-Lopez, D. Chantada, N. Beerenwinkel, D. Posada, E. Szczurek
    Czasopismo:
    Genome Biology (rok: 2022, tom: 23, strony: 248), Wydawca: Biomed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s13059-022-02813-9 - link do publikacji
  2. SIEVE: joint inference of single nucleotide variants and cell phylogeny from single-cell DNA sequencing data
    Autorzy:
    S. Kang, N. Borgsmuller, M. Valecha, J. Kuipers, J.M. Alves, S. Prado-Lopez, D. Chantada, N. Beerenwinkel, D. Posada, E. Szczurek
    Czasopismo:
    Genome Biology (rok: 2022, tom: 23, strony: 248), Wydawca: Biomed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s13059-022-02813-9 - link do publikacji