Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Identyfikacja i adnotacja funkcjonalna taksonomicznie-specyficznych genów bakterii

2017/25/B/NZ2/00187

Słowa kluczowe:

geny homologiczne genomika bakterie bioinformatyka

Deskryptory:

  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ2_8: Biologia obliczeniowa

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Wojciech Karłowski 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: OPUS 13 - ogłoszony 2017-03-15

Przyznana kwota: 816 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-01-24

Zakończenie projektu: 2022-12-23

Planowany czas trwania projektu: 59 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Internetowy serwer komputerowy. Za kwotę 120 000 PLN
  2. Wysokiej klasy stacja robocza (2 szt.). Za kwotę 60 000 PLN
  3. Zasilacz awaryjny. Za kwotę 6 814 PLN
  4. Komputer przenośny typu MacBook Pro (2 szt.). Za kwotę 20 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (4)
  1. Taxonomically Restricted Genes in Bacillus may form clusters of homologs and can be traced to a large reservoir of noncoding sequences
    Autorzy:
    Karlowski W.M., Varshney D., Zielezinski A.
    Czasopismo:
    Genome Biology and Evolution (rok: 2023, tom: -, strony: -), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Przyjęta do publikacji
    Doi:
    10.1093/gbe/evad023 - link do publikacji
  2. TRGdb: a universal resource for exploration of taxonomically restricted genes in bacteria
    Autorzy:
    Zielezinski A., Dobrychlop W., Karlowski W.M
    Czasopismo:
    Briefings in Bioinformatics (rok: 2023, tom: -, strony: -), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Złożona
    Doi:
    brak - link do publikacji
  3. Massive annotation of bacterial L-asparaginases reveals their puzzling distribution and frequent gene transfer events
    Autorzy:
    Zielezinski A., Loch J.I., Karlowski W.M., Jaskolski M.
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2022, tom: 12, strony: 15797), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-022-19689-1 - link do publikacji
  4. Benchmarking of alignment-free sequence comparison methods
    Autorzy:
    Zielezinski, A., Girgis, H.Z., Bernard, G., Leimeister, C.-A., Tang, K., Dencker, T., Lau, A.K., Röhling, S., Choi, J.J., Waterman, M.S., Comin, M., Kim, S.-H., Vinga, S., Almeida, J.S., Chan, C.X., James, B.T., Sun, F., Morgenstern, B., Karlowski, W.M.
    Czasopismo:
    Genome Biology (rok: 2019, tom: 20 (1), strony: 144), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s13059-019-1755-7 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy