Projects funded by the NCN

Identification of proteolytic cleavage sites in peptide substrates using coarse-grained docking and machine learning met...

Call: OPUS 29 , Panel: NZ1

Principal investigator: dr hab. Michał Koliński

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego PAN

ARTEMANN: a method for identifying structural motifs and binding sites in RNA and DNA 3D structures

Call: SONATA 20 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Evgenii Baulin

Międzynarodowy Instytut Mechanizmów i Maszyn Molekularnych Polskiej Akademii Nauk

Computational design of next generation rocket fuels based on hypergolic metal-organic frameworks

Call: OPUS 26 , Panel: ST5

Principal investigator: dr hab. Mihails Arhangelskis

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Machine learning and advanced NMR crystallography - complementary tools for optimizing the pathways of synthesis, predic...

Call: OPUS 24 (LAP) , Panel: ST4

Principal investigator: prof. Marek Józef Potrzebowski

Centrum Badań Molekularnych i Makromolekularnych PAN

Computational design of magnetic metal-organic frameworks using ab initio crystal structure prediction

Call: PRELUDIUM BIS 4 , Panel: ST5

Principal investigator: dr hab. Mihails Arhangelskis

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Towards understanding of polymorphism and crystallization pathways of organic molecular crystals

Call: SONATA BIS 12 , Panel: ST4

Principal investigator: dr hab. Marta Katarzyna Dudek

Centrum Badań Molekularnych i Makromolekularnych PAN

Degradation processes of mechanically loaded structures in hydrogen environment

Call: OPUS 23 , Panel: ST8

Principal investigator: dr hab. Magdalena Maria Mieloszyk

Instytut Maszyn Przepływowych im. Roberta Szewalskiego PAN

Biological code of knots – identification of knotted patterns in biomolecules via AI approach

Call: OPUS 22 (LAP) , Panel: NZ1

Principal investigator: dr hab. Joanna Ida Sułkowska

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Multi-scale method for amyloid fibril assembly using protofilament structures predicted by coarse-grained docking simula...

Call: OPUS 22 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Michał Koliński

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego PAN

Fatigue behavior and life assessment of CFRP structures under global non-proportional multiaxial loading conditions

Call: PRELUDIUM 20 , Panel: ST8

Principal investigator: Szymon Jan Duda

Politechnika Wrocławska

Predicting 3D RNA structures using Generative Adversarial Networks

Call: PRELUDIUM BIS 2 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Marta Xymena Szachniuk

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki i Telekomunikacji

Theoretical design and prediction of phosphorescent emissive materials based on halogen bonding interactions and experim...

Call: OPUS 19 , Panel: ST5

Principal investigator: dr Mihails Arhangelskis

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Identification and comprehensive classification of peptidases

Call: SONATA 15 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Kamil Steczkiewicz

Instytut Biochemii i Biofizyki PAN

Ab initio prediction of structures and properties of metal-organic frameworks for sensor applications

Call: SONATA 14 , Panel: ST5

Principal investigator: dr Mihails Arhangelskis

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Vector Error Correction models with time-varying covariance structure in Bayesian analysis and prediction of macroeconom...

Call: OPUS 16 , Panel: HS4

Principal investigator: dr hab. Anna Pajor

UNIWERSYTET EKONOMICZNY W KRAKOWIE, Wydział Finansów i Prawa

Crystal structure prediction (CSP) and NMR crystallography as modern tools for the determination of crystal structures o...

Call: SONATA 14 , Panel: ST4

Principal investigator: dr hab. Marta Katarzyna Dudek

Centrum Badań Molekularnych i Makromolekularnych PAN

Prediction of protein and peptide isoelectric point based on sequence and structure features

Call: OPUS 15 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Łukasz Paweł Kozłowski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Towards accurate prediction of spin-state energetics for transition metal complexes in quantum-chemical calculations

Call: SONATA 13 , Panel: ST4

Principal investigator: dr hab. Mariusz Radoń

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Chemii

An integrated approach to modeling protein structure and dynamics based on the UNRES coarse-grained force field and bioi...

Call: HARMONIA 9 , Panel: ST4

Principal investigator: dr hab. Cezary Ryszard Czaplewski

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Increasing global and local accuracy of the coarse-grained UNRES model of proteins and its extensions to simulating very...

Call: OPUS 13 , Panel: ST4

Principal investigator: prof. Józef Adam Liwo

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Developement of new methods for designing RNA molecules that fold into desired spatial structures and their use for deve...

Call: OPUS 13 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Janusz Marek Bujnicki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Methodology of prediction of residual strength of composite structures based on ultrasonic testing supported by numerica...

Call: PRELUDIUM 13 , Panel: ST8

Principal investigator: dr Angelika Paulina Wronkowicz

Politechnika Śląska, Wydział Mechaniczny Technologiczny

RNA structure prediction based on modeling the target sequence and homologous sequences

Call: PRELUDIUM 9 , Panel: NZ2

Principal investigator: Marcin Magnus

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Identification and comprehensive classification of nucleases including human nucleases

Call: OPUS 8 , Panel: NZ1

Principal investigator: dr hab. Krzysztof Flawiusz Ginalski

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Revisiting the approaches for isotope effects prediction in condensed phase

Call: SONATA BIS 4 , Panel: ST4

Principal investigator: dr hab. Agnieszka Joanna Dybała-Defratyka

Politechnika Łódzka, Wydział Chemiczny

An integrated approach to the prediction of the structures of proteins and protein complexes with the use of the coarse-...

Call: HARMONIA 5 , Panel: ST4

Principal investigator: prof. Józef Adam Liwo

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Conserved RNA structural motifs in influenza virus: toward revealing viral RNA functions

Call: HARMONIA 4 , Panel: NZ1

Principal investigator: dr hab. Elżbieta Kierzek

Instytut Chemii Bioorganicznej PAN

Influence of knotted structure on function of proteins and protein structure prediction

Call: SONATA BIS 2 , Panel: NZ1

Principal investigator: dr hab. Joanna Sułkowska

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Analysis of the structure of regulatory sequences and prediction of gene expression dynamics.

Call: PRELUDIUM 3 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Marta Elżbieta Iwanaszko

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Prediction of Cascade complex structure.

Call: PRELUDIUM 3 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Joanna Maria Kasprzak

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Structural RNomics

Call: MAESTRO 2 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Janusz Marek Bujnicki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Using transcriptomic data for identification of new miRNAs and prediction of miRNA gene structures

Call: PRELUDIUM 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Michał Szcześniak

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Development of a method for the structure prediction of GPCRs complexes with agonists and antagonists, including the lig...

Call: SONATA 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Michał Koliński

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego PAN

Structure prediction of proteins and large protein assemblies guided by low-resolution or/and sparse experimental data.

Call: SONATA 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Dominik Gront

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Thermodynamic research on ionic liquids used for desulfurization of fuels

Call: OPUS 1 , Panel: ST5

Principal investigator: prof. Urszula Maria Domańska-Żelazna

Politechnika Warszawska, Wydział Chemiczny