Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Using transcriptomic data for identification of new miRNAs and prediction of miRNA gene structures

2011/01/N/NZ2/01653

Keywords:

microRNA database. RNA-seq EST gene structure SVM

Descriptors:

  • NZ2_7: Bioinformatics
  • NZ2_2: Genomics, transcriptomics, epigenomics
  • NZ2_1: Molecular genetics

Panel:

NZ2 - Genetics, genomics: molecular genetics, genomics, proteomics, bioinformatics, systems biology, genetic epidemiology

Host institution :

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Wydział Biologii

woj. wielkopolskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr Michał Szcześniak 

Number of co-investigators in the project: 2

Call: PRELUDIUM 1 - announced on 2011-03-15

Amount awarded: 76 999 PLN

Project start date (Y-m-d): 2011-12-07

Project end date (Y-m-d): 2014-09-06

Project duration:: 33 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. Serwer wielozadaniowy DELL (25 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (4)
  1. Bazy danych mikroRNA
    Authors:
    Michał Wojciech Szcześniak, Elżbieta Owczarkowska, Jakub Gapski, Izabela Makałowska
    Academic press:
    Postępy Biochemii (rok: 2012, tom: 58, strony: 91-99), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
    Status:
    Published
    DOI:
    brak - link to the publication
  2. miRNEST 2.0: a database of plant and animal microRNAs
    Authors:
    Michał Wojciech Szcześniak, Izabela Makałowska
    Academic press:
    Nucleic Acids Research (rok: 2013, tom: 42, strony: D74-D77), Wydawca: Oxford Journals
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1093/nar/gkt1156 - link to the publication
  3. HuntMi: an efficient and taxon-specific approach in pre-miRNA identification
    Authors:
    Adam Gudyś, Michał Wojciech Szcześniak, Marek Sikora, Izabela Makałowska
    Academic press:
    BMC Bioinformatics (rok: 2013, tom: 14, strony: brak numeracji stron), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1186/1471-2105-14-83 - link to the publication
  4. ERISdb: A Database of Plant Splice Sites and Splicing Signals
    Authors:
    Michał Wojciech Szcześniak, Michał Kabza, Rafał Pokrzywa, Adam Gudyś, Izabela Makałowska
    Academic press:
    Plant and Cell Physiology (rok: 2013, tom: 54, strony: Pp. e10), Wydawca: Oxford Journals
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1093/pcp/pct001 - link to the publication

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy