Projects funded by the NCN

Efficient simulation algorithms for models of stochastic processes in computational biology and synthesis of the signali...

Call: OPUS 12 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Krzysztof Puszyński

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Development of methods for bias correction of gene expression measurements

Call: SONATA 12 , Panel: ST7

Principal investigator: dr Roman Jaksik

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Detecting origins of signalling aberrations in cancer cells

Call: PRELUDIUM 12 , Panel: ST6

Principal investigator: Karol Nienałtowski

Instytut Podstawowych Problemów Techniki Polskiej Akademii Nauk

A coarse-grained method for RNA 3D structure modeling, with emphasis on non-canonical base pairing.

Call: OPUS 12 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Michał Boniecki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Study of mechanism of proteolysis and a selective ligand binding to gamma-secretase complex

Call: OPUS 12 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Sławomir Filipek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

RNApolis - methods and algorithms to model and analyse the RNA structure

Call: OPUS 12 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Marta Szachniuk

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki i Telekomunikacji

Monte Carlo simulations of cell response to DNA damage of various complexities

Call: SONATA 12 , Panel: ST7

Principal investigator: dr Beata Brzozowska-Wardecka

Uniwersytet Warszawski, Wydział Fizyki

Incorporating genomic variation information into DNA sequencing data analysis

Call: OPUS 11 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Norbert Dojer

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

A cis-plus-trans predictive model of mammalian gene expression.

Call: POLONEZ 2 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Lukasz Huminiecki

Instytut Genetyki i Hodowli Zwierząt Polskiej Akademii Nauk

MLGenSig: Machine Learning Methods for building of Integrated Genetic Signatures

Call: OPUS 11 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Przemysław Biecek

Politechnika Warszawska, Wydział Matematyki i Nauk Informacyjnych

Bayesian analysis of bladder cancer subtypes based on high-throughput data

Call: PRELUDIUM 11 , Panel: ST6

Principal investigator: Krzysztof Gogolewski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Credibility of Horizontal Gene Transfer Models

Call: PRELUDIUM 11 , Panel: ST6

Principal investigator: Agnieszka Mykowiecka

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

New algorithms for estimating clonal structures and for modeling heterogenous evolution for applications in cancer genom...

Call: OPUS 11 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Andrzej Polański

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Coarse-grained modeling of the calcium, sodium, magnesium and potassium cations with proteins

Call: PRELUDIUM 11 , Panel: ST4

Principal investigator: dr Agnieszka Lipska

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Development of protocol for in silico design of compounds inhibit Ebola virus infection

Call: PRELUDIUM 11 , Panel: NZ2

Principal investigator: Dawid Warszycki

Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk

Modelowanie i analiza przestrzennej struktury i dynamiki chromatyny w jądrze komórkowym.

Call: ETIUDA 4 , Panel: NZ2

Principal investigator: Przemysław Szałaj

Uniwersytet Medyczny w Białymstoku, Wydział Lekarski z Oddziałem Stomatologii i Oddziałem Nauczania w Języku Angielskim

Oddziaływanie syntetycznych oligomerów z rybosomowym RNA.

Call: ETIUDA 4 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Maciej Jasiński

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Bioinformatyczne metody modelowania i weryfikacji hipotezy Świata RNA.

Call: ETIUDA 4 , Panel: ST6

Principal investigator: Natalia Szóstak

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki

INNOvative antiSEPTic agents for a therapy with a broad spectrum of action

Call: OPUS 10 , Panel: NZ7

Principal investigator: dr Sebastian Kraszewski

Politechnika Wrocławska

Multiscale modeling of ceramide induced nerve cells apoptosis

Call: PRELUDIUM 10 , Panel: ST6

Principal investigator: Weronika Wronowska

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Computational Genomics: Problems, Algorithms and Models

Call: OPUS 10 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Paweł Górecki

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Molecular mechanism of interactions between GPCRs and G protein.

Call: PRELUDIUM 10 , Panel: NZ2

Principal investigator: Stefan Mordalski

Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk

Bioinformatics tools for automated detection of tumor and its heterogeneity based on cancer metabolome profiling with im...

Call: OPUS 10 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Joanna Polańska

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Dynamics of gene expression control for bacterial restriction-modification systems using single-cell technology.

Call: OPUS 10 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr hab. Iwona Mruk

UNIWERSYTET GDAŃSKI, Wydział Biologii

A virtual screening protocol based on automatically generated structure-based pharmacophore models.

Call: HARMONIA 7 , Panel: NZ2

Principal investigator: Stefan Mordalski

Instytut Farmakologii PAN

Modeling 3D structures and dynamics of RNA complexes with metal ions, with particular emphasis on the formation of non-c...

Call: SONATA 9 , Panel: NZ1

Principal investigator: dr Dorota Niedziałek

Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

Formal linguistics for proteomics - modeling, analysis and hypotheses testing

Call: SONATA 9 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Witold Dyrka

Politechnika Wrocławska, Wydział Podstawowych Problemów Techniki

Global protein docking algorithms based on the UNRES coarse-grained model

Call: PRELUDIUM 9 , Panel: ST4

Principal investigator: dr Paweł Krupa

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Modelling of fragmentation of biomolecules induced by electron transfer in mass spectrometry

Call: PRELUDIUM 9 , Panel: ST6

Principal investigator: Mateusz Łącki

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Modelling signal peptides based on hidden semi-Markov models for various taxonomic groups of organisms and peptide types

Call: PRELUDIUM 9 , Panel: NZ2

Principal investigator: Michał Burdukiewicz

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii

SOSnet: sparse modelling and prediction for high-dimensional data.

Call: OPUS 9 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Piotr Pokarowski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Analysis of mechanisms of drug resistance to trastuzumab in HER2 overexpressing breast cancer based on gene expression c...

Call: PRELUDIUM 9 , Panel: NZ2

Principal investigator: Anna Rusek

Uniwersytet Medyczny w Białymstoku, Wydział Lekarski z Oddziałem Stomatologii i Oddziałem Nauczania w Języku Angielskim

RNA structure prediction based on modeling the target sequence and homologous sequences

Call: PRELUDIUM 9 , Panel: NZ2

Principal investigator: Marcin Magnus

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Development of a method for the structure prediction of GPCRs complexes with agonists and antagonists, including the lig...

Call: SONATA 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Michał Koliński

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego PAN