Projekty finansowane przez NCN

Identyfikacja miejsc cięcia substratów peptydowych przez enzymy proteolityczne z wykorzystaniem dokowania gruboziarniste...

Konkurs: OPUS 29 , panel: NZ1

Kierownik: dr hab. Michał Koliński

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego PAN

COGRIMEN 2.0 - pakiet narzędzi modelowania gruboziarnistego i pełnoatomowego biomolekuł w ośrodkach ciągłych

Konkurs: OPUS 29 , panel: ST4

Kierownik: prof. Sławomir Hubert Filipek

Uniwersytet Warszawski

Włączenie zależności temperaturowej potencjałów interakcji łańcuchów bocznych do pola siłowego UNRES

Konkurs: PRELUDIUM 24 , panel: ST4

Kierownik: Mateusz Leśniewski

Uniwersytet Gdański

Wgląd w funkcję modyfikacji potranslacyjnych białek poprzez wielkoskalowe idługoskalowe symulacje dynamiki molekularnej...

Konkurs: SONATA 19 , panel: ST4

Kierownik: dr Agnieszka Gabriela Lipska

Politechnika Gdańska

Skorelowane oddziaływania średniopolowe przenoszone wzdłuż łańcucha polipeptydowego jako klucz do zrozumienia tworzenia ...

Konkurs: OPUS 26 , panel: ST4

Kierownik: prof. Józef Adam Liwo

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Odszyfrowanie "kodu siarczanowego" glikozaminoglikanów w celu zrozumienia ich funkcji w macierzy pozakomórkowej

Konkurs: OPUS 25 , panel: ST4

Kierownik: dr hab. Sergey Samsonov

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Zintegrowane metody modelowania kompleksów białko-białko i złożonych układów biologicznych

Konkurs: SHENG 2 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Sebastian Kmiecik

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych

Modelowanie, wspomagane przez dane doświadczalne, struktury zespołów statystycznych białek wewnętrznie nieuporządkowanyc...

Konkurs: SHENG 2 , panel: ST4

Kierownik: prof. Józef Adam Liwo

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Badania komputerowe zwijania i dimeryzacji białek na rybosomie

Konkurs: OPUS 18 , panel: ST4

Kierownik: prof. Mai Suan Li

Instytut Fizyki PAN

Gruboziarniste modelowanie węglowodanów

Konkurs: OPUS 18 , panel: ST4

Kierownik: dr hab. Wojciech Sylwester Płaziński

Instytut Katalizy i Fizykochemii Powierzchni im. Jerzego Habera PAN

Opracowanie nowej metody dokowania białko-białko w oparciu o giętkie dokowanie krótkich fragmentów peptydowych.

Konkurs: OPUS 17 , panel: NZ2

Kierownik: dr Mateusz Kurciński

Uniwersytet Warszawski

Modelowanie molekularne tworzenia struktury białkowej przez glikozaminoglikany oraz ich wpływ na biologicznie istotne od...

Konkurs: SONATA BIS 8 , panel: ST4

Kierownik: dr Sergey Samsonov

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Połączenie metody Rosetta z gruboziarnistym modelem SURPASS w nowy wieloskalowy algorytm modelowania białek i ich komple...

Konkurs: OPUS 15 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Dominik Gront

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Mapowanie gruboziarnistych modeli kwasów nukleinowych z pola NARES-2P do reprezentacji pełnoatomowej

Konkurs: PRELUDIUM 14 , panel: ST4

Kierownik: Łukasz Golon

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Modelowanie gruboziarniste procesów biochemicznych z udziałem białek przy uwzględnieniu ziarnistych struktur wody i lipi...

Konkurs: OPUS 14 , panel: ST4

Kierownik: dr Adam Sieradzan

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Zintegrowane podejście do modelowania struktury i dynamiki białek z wykorzystaniem gruboziarnistego pola siłowego UNRES ...

Konkurs: HARMONIA 9 , panel: ST4

Kierownik: dr hab. Cezary Ryszard Czaplewski

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Zwiększenie globalnej i lokalnej dokładności gruboziarnistego modelu UNRES białek oraz jego rozszerzenie na symulacje ba...

Konkurs: OPUS 13 , panel: ST4

Kierownik: prof. Józef Adam Liwo

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Gruboziarnista metoda do modelowania struktury przestrzennej cząsteczek RNA, uwzględniająca niekanoniczne parowania zasa...

Konkurs: OPUS 12 , panel: ST6

Kierownik: dr Michał Boniecki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Modelowanie gruboziarniste kationów wapniowych, sodowych, magnezowych i potasowych z białkami

Konkurs: PRELUDIUM 11 , panel: ST4

Kierownik: dr Agnieszka Gabriela Lipska

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Algorytmy globalnego dokowania białek oparte na gruboziarnistym modelu UNRES

Konkurs: PRELUDIUM 9 , panel: ST4

Kierownik: dr Paweł Krupa

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Dyfrakcyjny rentgenowski pomiar naprężeń w uogólnionych siatkach pomiarowych - nowe możliwości badawcze dla materiałów o...

Konkurs: PRELUDIUM 9 , panel: ST8

Kierownik: Bogusz Kania

Instytut Metalurgii i Inżynierii Materiałowej im. Aleksandra Krupkowskiego PAN

Gruboziarnisty model oddziaływań nanocząstek z białkami do symulacji transportu substancji leczniczych do miejsc docelow...

Konkurs: PRELUDIUM 9 , panel: ST4

Kierownik: dr Magdalena Anna Mozolewska

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Mechanizmy naprawdze DNA: od gruboziarnistego do pełnoatomowego opisu

Konkurs: SONATA 9 , panel: ST4

Kierownik: dr Adam Kazimierz Sieradzan

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

COGRIMEN - metoda modelowania gruboziarnistego dużych układów biologicznych w ośrodkach ciągłych

Konkurs: OPUS 8 , panel: ST4

Kierownik: prof. Sławomir Hubert Filipek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Zintegrowane podejście do przewidywania struktur białek oraz kompleksów białek przy użyciu gruboziarnistego pola siłoweg...

Konkurs: HARMONIA 5 , panel: ST4

Kierownik: prof. Józef Adam Liwo

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Jednolity model gruboziarnisty makromolekuł biologicznych oparty o średniopolowe oddziaływania multipol-multipol

Konkurs: MAESTRO 3 , panel: ST4

Kierownik: prof. Józef Adam Liwo

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii