Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Gruboziarniste modelowanie węglowodanów

2019/35/B/ST4/01149

Słowa kluczowe:

Węglowodany dynamika molekularna modele gruboziarniste pola siłowe

Deskryptory:

  • ST4_4: Chemia teoretyczna i obliczeniowa
  • ST4_9: Chemia biologiczna

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Instytut Katalizy i Fizykochemii Powierzchni im. Jerzego Habera Polskiej Akademii Nauk

woj.

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Wojciech Sylwester Płaziński 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: OPUS 18 - ogłoszony 2019-09-16

Przyznana kwota: 1 066 800 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2020-09-01

Zakończenie projektu: 2025-05-29

Planowany czas trwania projektu: 56 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt w realizacji

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (12)
  1. Exploring Free Energies of Specific Protein Conformations Using the Martini Force Field
    Autorzy:
    Wojciech Plazinski, Valery Lutsyk, Anita Plazinska
    Czasopismo:
    J. Chem. Theory Comput. (rok: 2024, tom: 20, strony: 2273–2283), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jctc.3c01155 - link do publikacji
  2. Conformational Properties of Glycosaminoglycan Disaccharides: A Molecular Dynamics Study
    Autorzy:
    Valery Lutsyk, Wojciech Plazinski
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry B (rok: 2021, tom: 125, strony: 10900–10916), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.1c04860 - link do publikacji
  3. Conformational flexibility of the disaccharide β-l-Fucp-(1→4)-α-d-Glcp-OMe as deduced from NMR spectroscopy experiments and computer simulations
    Autorzy:
    Wojciech Plazinski, Thibault Angles d'Ortoli, Göran Widmalm
    Czasopismo:
    Organic & Biomolecular Chemistry (rok: 2023, tom: 21, strony: 6979-6994), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D3OB01153D - link do publikacji
  4. Extending the Martini 3 Coarse-Grained Force Field to Carbohydrates
    Autorzy:
    V. Lutsyk, P. Wolski, W. Plazinski
    Czasopismo:
    J. Chem. Theory Comput. (rok: 2022, tom: 18, strony: 5089–5107), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jctc.2c00553 - link do publikacji
  5. Correction: β-1,3-Glucan synthesis, novel supramolecular self-assembly, characterization and application
    Autorzy:
    R. Pylkkänen, P. Mohammadi, V. Liljeström, W. Płaziński, G. Beaune, J.V. I. Timonen, M. Penttilä
    Czasopismo:
    Nanoscale (rok: 2022, tom: 14, strony: 15542-15542), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D2NR90202H - link do publikacji
  6. Extending the Martini 3 Coarse-Grained Force Field to Carbohydrates
    Autorzy:
    V. Lutsyk, P. Wolski, W. Plazinski
    Czasopismo:
    J. Chem. Theory Comput. (rok: 2022, tom: 18, strony: 5089–5107), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jctc.2c00553 - link do publikacji
  7. β-1,3-Glucan synthesis, novel supramolecular self-assembly, characterization and application
    Autorzy:
    R. Pylkkänen, P. Mohammadi, V. Liljeström, W. Płaziński, G. Beaune, J.V.I. Timonen, M. Penttilä
    Czasopismo:
    Nanoscale (rok: 2022, tom: 14, strony: 15533-15541), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D2NR02731C - link do publikacji
  8. Correction: β-1,3-Glucan synthesis, novel supramolecular self-assembly, characterization and application
    Autorzy:
    R. Pylkkänen, P. Mohammadi, V. Liljeström, W. Płaziński, G. Beaune, J.V. I. Timonen, M. Penttilä
    Czasopismo:
    Nanoscale (rok: 2022, tom: 14, strony: 15542-15542), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D2NR90202H - link do publikacji
  9. β-1,3-Glucan synthesis, novel supramolecular self-assembly, characterization and application
    Autorzy:
    R. Pylkkänen, P. Mohammadi, V. Liljeström, W. Płaziński, G. Beaune, J.V.I. Timonen, M. Penttilä
    Czasopismo:
    Nanoscale (rok: 2022, tom: 14, strony: 15533-15541), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D2NR02731C - link do publikacji
  10. Conformational Properties of Glycosaminoglycan Disaccharides: A Molecular Dynamics Study
    Autorzy:
    Valery Lutsyk, Wojciech Plazinski
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry B (rok: 2021, tom: 125, strony: 10900–10916), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.1c04860 - link do publikacji
  11. Exploring Ring Conformation in Uronate Monosaccharides: Insights from Ab Initio Calculations and Classical Molecular Dynamics Simulations
    Autorzy:
    Valery Lutsyk, Wojciech Plazinski*
    Czasopismo:
    J. Phys. Chem. B (rok: 2024, tom: 128, strony: 472–491), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.3c06556 - link do publikacji
  12. Conformational Properties of Glycosaminoglycan Disaccharides: A Molecular Dynamics Study
    Autorzy:
    Valery Lutsyk, Wojciech Plazinski
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry B (rok: 2021, tom: 125, strony: 10900–10916), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.1c04860 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy