Projekty finansowane przez NCN

COGRIMEN - metoda modelowania gruboziarnistego dużych układów biologicznych w ośrodkach ciągłych

Konkurs: OPUS 8 , panel: ST4

Kierownik: prof. Sławomir Filipek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Zintegrowane podejście do przewidywania struktur białek oraz kompleksów białek przy użyciu gruboziarnistego pola siłoweg...

Konkurs: HARMONIA 5 , panel: ST4

Kierownik: prof. Józef Liwo

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Symulacja zmian konformacyjnych związanych z komunikacją między domenami eukariotycznej syntazy GlcN-6-P za pomocą długo...

Konkurs: PRELUDIUM 5 , panel: NZ2

Kierownik: Aleksandra Miszkiel

Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny

Skorelowane oddziaływania średniopolowe przenoszone wzdłuż łańcucha polipeptydowego jako klucz do zrozumienia tworzenia ...

Konkurs: OPUS 26 , panel: ST4

Kierownik: prof. Józef Liwo

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Optymalizacja gruboziarnistych symulacji dynamiki molekularnej do badania tuneli dużych białek z zagłębionymi miejscami ...

Konkurs: PRELUDIUM 22 , panel: NZ2

Kierownik: Nishita Mandal

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Odszyfrowanie "kodu siarczanowego" glikozaminoglikanów w celu zrozumienia ich funkcji w macierzy pozakomórkowej

Konkurs: OPUS 25 , panel: ST4

Kierownik: dr hab. Sergey Samsonov

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Gruboziarnista dynamika molekularna termometrów RNA w podwyższonej temperaturze

Konkurs: PRELUDIUM 2 , panel: NZ2

Kierownik: Filip Leonarski

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Zintegrowane metody modelowania kompleksów białko-białko i złożonych układów biologicznych

Konkurs: SHENG 2 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Sebastian Kmiecik

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych

Modelowanie, wspomagane przez dane doświadczalne, struktury zespołów statystycznych białek wewnętrznie nieuporządkowanyc...

Konkurs: SHENG 2 , panel: ST4

Kierownik: prof. Józef Liwo

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Rozwój narzędzi do racjonalnego projektowania leków peptydowych

Konkurs: OPUS 20 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Sebastian Kmiecik

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych

Gruboziarniste modelowanie węglowodanów

Konkurs: OPUS 18 , panel: ST4

Kierownik: dr hab. Wojciech Płaziński

Instytut Katalizy i Fizykochemii Powierzchni im. Jerzego Habera Polskiej Akademii Nauk

Opracowanie nowej metody dokowania białko-białko w oparciu o giętkie dokowanie krótkich fragmentów peptydowych.

Konkurs: OPUS 17 , panel: NZ2

Kierownik: dr Mateusz Kurciński

Uniwersytet Warszawski

Modelowanie molekularne tworzenia struktury białkowej przez glikozaminoglikany oraz ich wpływ na biologicznie istotne od...

Konkurs: SONATA BIS 8 , panel: ST4

Kierownik: dr Sergey Samsonov

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Połączenie metody Rosetta z gruboziarnistym modelem SURPASS w nowy wieloskalowy algorytm modelowania białek i ich komple...

Konkurs: OPUS 15 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Dominik Gront

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Wieloskalowe symulacje dynamiki molekularnej w celu zbadania struktury oligomerów amyloidów beta.

Konkurs: PRELUDIUM 14 , panel: NZ1

Kierownik: Dinh Quoc Huy Pham

Instytut Fizyki Polskiej Akademii Nauk

Modelowanie gruboziarniste procesów biochemicznych z udziałem białek przy uwzględnieniu ziarnistych struktur wody i lipi...

Konkurs: OPUS 14 , panel: ST4

Kierownik: dr Adam Sieradzan

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Zintegrowane podejście do modelowania struktury i dynamiki białek z wykorzystaniem gruboziarnistego pola siłowego UNRES ...

Konkurs: HARMONIA 9 , panel: ST4

Kierownik: dr hab. Cezary Czaplewski

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Gruboziarnista metoda do modelowania struktury przestrzennej cząsteczek RNA, uwzględniająca niekanoniczne parowania zasa...

Konkurs: OPUS 12 , panel: ST6

Kierownik: dr Michał Boniecki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Modelowanie gruboziarniste kationów wapniowych, sodowych, magnezowych i potasowych z białkami

Konkurs: PRELUDIUM 11 , panel: ST4

Kierownik: dr Agnieszka Lipska

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Modelowanie struktur 3D i dynamiki kompleksów RNA z jonami metalu, ze szczególnym uwzględnieniem tworzenia się niekanoni...

Konkurs: SONATA 9 , panel: NZ1

Kierownik: dr Dorota Niedziałek

Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

Algorytmy globalnego dokowania białek oparte na gruboziarnistym modelu UNRES

Konkurs: PRELUDIUM 9 , panel: ST4

Kierownik: dr Paweł Krupa

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii