Projects funded by the NCN

Consistent Models and Efficient Algorithms for Genomic Duplications

Call: OPUS 14 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Paweł Górecki

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Development of algorithmic and statistical methods in mass spectrometry

Call: SONATA 13 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Michał Startek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Compression of large-scale genomic data collections

Call: OPUS 13 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Sebastian Deorowicz

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Efficient simulation algorithms for models of stochastic processes in computational biology and synthesis of the signali...

Call: OPUS 12 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Krzysztof Puszyński

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

High-performance computing for next-generation DNA sequencing

Call: OPUS 1 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Aleksandra Świercz

Instytut Chemii Bioorganicznej, Polskiej Akademii Nauk

Detecting origins of signalling aberrations in cancer cells

Call: PRELUDIUM 12 , Panel: ST6

Principal investigator: Karol Nienałtowski

Instytut Podstawowych Problemów Techniki Polskiej Akademii Nauk

A coarse-grained method for RNA 3D structure modeling, with emphasis on non-canonical base pairing.

Call: OPUS 12 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Michał Boniecki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Development of bioinformatics models to analyze 3D RNA structures in torsion angle space

Call: PRELUDIUM 12 , Panel: ST6

Principal investigator: Tomasz Żok

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki

RNApolis - methods and algorithms to model and analyse the RNA structure

Call: OPUS 12 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Marta Szachniuk

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki i Telekomunikacji

Grammatical inference methods in classification of amyloidogenic proteins

Call: OPUS 11 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Olgierd Unold

Politechnika Wrocławska

Algorithms for multiple alignment of genomes. Sequence alignment in a context of phylogenetic reconstruction.

Call: SONATA 11 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Adam Gudyś

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Incorporating genomic variation information into DNA sequencing data analysis

Call: OPUS 11 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Norbert Dojer

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

MLGenSig: Machine Learning Methods for building of Integrated Genetic Signatures

Call: OPUS 11 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Przemysław Biecek

Politechnika Warszawska, Wydział Matematyki i Nauk Informacyjnych

Development of universal data representation models to improve the quality of machine learning techniqes with an exampla...

Call: PRELUDIUM 11 , Panel: ST6

Principal investigator: Magdalena Wiercioch

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Matematyki i Informatyki

Bayesian analysis of bladder cancer subtypes based on high-throughput data

Call: PRELUDIUM 11 , Panel: ST6

Principal investigator: Krzysztof Gogolewski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Credibility of Horizontal Gene Transfer Models

Call: PRELUDIUM 11 , Panel: ST6

Principal investigator: Agnieszka Mykowiecka

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

New algorithms for estimating clonal structures and for modeling heterogenous evolution for applications in cancer genom...

Call: OPUS 11 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Andrzej Polański

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Bioinformatyczne metody modelowania i weryfikacji hipotezy Świata RNA.

Call: ETIUDA 4 , Panel: ST6

Principal investigator: Natalia Szóstak

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki

Multiscale modeling of ceramide induced nerve cells apoptosis

Call: PRELUDIUM 10 , Panel: ST6

Principal investigator: Weronika Wronowska

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Computational Genomics: Problems, Algorithms and Models

Call: OPUS 10 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Paweł Górecki

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Methods for supervised and unsupervised classification of metagenomic DNA fragments extracted from various environmental...

Call: SONATA 10 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Jolanta Kawulok

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Inferring genomic duplication events.

Call: PRELUDIUM 10 , Panel: ST6

Principal investigator: Jarosław Paszek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Bioinformatics tools for automated detection of tumor and its heterogeneity based on cancer metabolome profiling with im...

Call: OPUS 10 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Joanna Polańska

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Substructural Connectivity Fingerprint and Extreme Entropy Machines: A New Method of Compound Representation and Analysi...

Call: PRELUDIUM 9 , Panel: ST6

Principal investigator: Krzysztof Rataj

Instytut Farmakologii PAN

Formal linguistics for proteomics - modeling, analysis and hypotheses testing

Call: SONATA 9 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Witold Dyrka

Politechnika Wrocławska, Wydział Podstawowych Problemów Techniki

Compression and analysis of genomic data

Call: OPUS 9 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Sebastian Deorowicz

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Modelling of fragmentation of biomolecules induced by electron transfer in mass spectrometry

Call: PRELUDIUM 9 , Panel: ST6

Principal investigator: Mateusz Łącki

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

gEMiLia - gEnomic Machine Learning. Machine learning algorithms and methods with cloud computing for biological and medi...

Call: SONATA 9 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Anna Leśniewska

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki