Search results

1. New and efficient methods for the flexible molecular docking of proteins.

Principal investigator: prof. Andrzej Koliński

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Call: MAESTRO 6, Panel: ST6

2. Development of a new protein-protein docking method based on the flexible docking of short peptide fragments.

Principal investigator: dr Mateusz Kurciński

Uniwersytet Warszawski

Call: OPUS 17, Panel: NZ2

3. Identification of proteolytic cleavage sites in peptide substrates using coarse-grained docking and machine learning met…

Principal investigator: dr hab. Michał Koliński

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego PAN

Call: OPUS 29, Panel: NZ1

4. Multi-scale method for amyloid fibril assembly using protofilament structures predicted by coarse-grained docking simula…

Principal investigator: dr Michał Koliński

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego PAN

Call: OPUS 22, Panel: NZ2

5. Global protein docking algorithms based on the UNRES coarse-grained model

Principal investigator: dr Paweł Krupa

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Call: PRELUDIUM 9, Panel: ST4

6. The influence of environment on biomolecular function, structure and interactions.

Principal investigator: dr hab. Piotr Mikołaj Setny

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Call: SONATA BIS 10, Panel: ST4

7. Novel 2,4-disubstituted pyridine derivatives - synthesis, antimycobacterial activity in vitro, pharmacophore model, mole…

Principal investigator: dr hab. Katarzyna Małgorzata Gobis

Gdański Uniwersytet Medyczny, Wydział Farmaceutyczny

Call: OPUS 13, Panel: NZ7

8. Stop the biting: tracking the insecticide-mediated allosteric changes in voltage-gated sodium channels and design of sel…

Principal investigator: dr Beata Niklas

Uniwersytet Mikołaja Kopernika, Wydział Nauk Biologicznych i Weterynaryjnych

Call: PRELUDIUM 20, Panel: NZ3

9. Combination of Molecular Simulation and Deep Learning for De Novo Drug Design

Principal investigator: dr Tomasz Jakub Danel

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Matematyki i Informatyki

Call: PRELUDIUM 19, Panel: ST6

10. Molecular mechanisms, signal transduction and inhibition of PEBP1-15LOX protein complex triggering the ferroptotic cell …

Principal investigator: dr hab. Karolina Anna Mikulska-Rumińska

Uniwersytet Mikołaja Kopernika, Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej

Call: SONATA 15, Panel: ST4

11. Extension of the CABS-dock method for protein-peptide docking to modelling of membrane proteins

Principal investigator: Maciej Paweł Ciemny

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Call: PRELUDIUM 15, Panel: NZ1

12. Integrative methods for modeling protein-protein complexes and multimolecular assemblies

Principal investigator: prof. Sebastian Kmiecik

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych

Call: SHENG 2, Panel: NZ2

13. Self-learning systems in the design of compounds modulating GPCR receptors activation.

Principal investigator: dr hab. Dorota Latek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Call: OPUS 20, Panel: NZ2

14. Structure and reactivity of avidin-like proteins

Principal investigator: dr Jarosław Jan Panek

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Chemii

Call: OPUS 5, Panel: ST4

15. The application of artificial intelligence to the discovery of new natural drugs with mechanisms aimed at lowering free …

Principal investigator: Maciej Spiegel

Uniwersytet Medyczny im. Piastów Śląskich we Wrocławiu, Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Analiutyki Medycznej, Wydział Farmaceutyczny

Call: PRELUDIUM 21, Panel: NZ7

16. Computational insights into procathepsin maturation mediated by glycosaminoglycans.

Principal investigator: Krzysztof Kamil Bojarski

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Call: PRELUDIUM 16, Panel: ST4

17. Design and Pharmacological Evaluation of Marine Alkaloid-Inspired 5-HT2A Receptor Ligands

Principal investigator: Szymon Kazimierz Kordylewski

Instytut Farmakologii PAN

Call: PRELUDIUM 24, Panel: NZ1

18. Integrative modeling and structure determination of macromolecular complexes comprising RNA and proteins

Principal investigator: prof. Janusz Marek Bujnicki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Call: MAESTRO 9, Panel: NZ1

19. Development of a tool for automatic evaluation of complexes of ligands with serotonin receptors based on the application…

Principal investigator: Sabina Marta Podlewska

Instytut Farmakologii PAN

Call: PRELUDIUM 5, Panel: NZ2

20. New bioinformatics method for predicting ligand-binding sites in RNA structures

Principal investigator: dr Anna Philips

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Call: PRELUDIUM 2, Panel: NZ2

21. Theoretical prediction, chemical synthesis and biological analysis of a novel class of HSPA5 inhibitors

Principal investigator: prof. Arkadiusz Chworoś

Centrum Badań Molekularnych i Makromolekularnych PAN

Call: OPUS 25, Panel: ST4

22. Allosteric regulation of cathepsins and procathepsins enzymatic activity by glycosaminoglycans and their mimetics

Principal investigator: dr Krzysztof Kamil Bojarski

Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny

Call: SONATINA 7, Panel: ST4

23. The use of evolutionary patterns in the optimization of chemotherapy of tuberculosis

Principal investigator: dr Alina Ewa Minias

Instytut Biologii Medycznej PAN

Call: SONATA BIS 9, Panel: NZ6

24. Combining Rosetta method with deeply coarse grained SURPASS model into a novel multiscale algorithm for modeling protein…

Principal investigator: dr hab. Dominik Gront

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Call: OPUS 15, Panel: ST6

25. Modifications of aglycones of leucomycins via Michael addition and Huisgen dipolar cycloaddition as a new routes of synt…

Principal investigator: dr hab. Piotr Przybylski

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Chemii

Call: SONATA BIS 1, Panel: ST5

26. Blocking the TNF-TNFR2 interactions as a novel approach to the ovarian carcinoma treatment

Principal investigator: prof. Sylwia Anna Rodziewicz-Motowidło

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Call: OPUS 21, Panel: NZ7

27. Seeking for CB1 and CB2 receptor ligands among drugs, drug metabolites, and phytochemical compounds

Principal investigator: Adam Stasiulewicz

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Call: PRELUDIUM 18, Panel: NZ7

28. Development of tools for the rational design of peptide therapeutics

Principal investigator: prof. Sebastian Kmiecik

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych

Call: OPUS 20, Panel: NZ2

29. Towards automatic derivation of geometry-based descriptors as surrogates for complex structural approaches in enzyme-sub…

Principal investigator: Carlos Eduardo Sequeiros Borja

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Call: PRELUDIUM 19, Panel: NZ2

30. Development of protocol for in silico design of compounds inhibit Ebola virus infection

Principal investigator: Dawid Zdzisław Warszycki

Instytut Farmakologii PAN

Call: PRELUDIUM 11, Panel: NZ2

31. Development of a new scoring function for models of protein-small molecule complexes and its use for studying the mechan…

Principal investigator: dr Irina Tuszyńska

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Call: PRELUDIUM 2, Panel: NZ2

32. Development of a method for the structure prediction of GPCRs complexes with agonists and antagonists, including the lig…

Principal investigator: dr Michał Koliński

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego PAN

Call: SONATA 1, Panel: NZ2

33. New steroidal platinum complexes with potential application in medicine

Principal investigator: prof. Rafał Ryszard Siciński

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Call: OPUS 8, Panel: ST5

Projects search