Projekty finansowane przez NCN

COGRIMEN - metoda modelowania gruboziarnistego dużych układów biologicznych w ośrodkach ciągłych

Konkurs: OPUS 8 , panel: ST4

Kierownik: prof. Sławomir Filipek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Symulacja zmian konformacyjnych związanych z komunikacją między domenami eukariotycznej syntazy GlcN-6-P za pomocą długo...

Konkurs: PRELUDIUM 5 , panel: NZ2

Kierownik: Aleksandra Miszkiel

Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny

Wgląd w funkcję modyfikacji potranslacyjnych białek poprzez wielkoskalowe i długoskalowe symulacje dynamiki molekularnej...

Konkurs: SONATA 19 , panel: ST4

Kierownik: dr Agnieszka Lipska

Politechnika Gdańska

Optymalizacja gruboziarnistych symulacji dynamiki molekularnej do badania tuneli dużych białek z zagłębionymi miejscami ...

Konkurs: PRELUDIUM 22 , panel: NZ2

Kierownik: Nishita Mandal

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Gruboziarnista dynamika molekularna termometrów RNA w podwyższonej temperaturze

Konkurs: PRELUDIUM 2 , panel: NZ2

Kierownik: Filip Leonarski

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Zintegrowane metody modelowania kompleksów białko-białko i złożonych układów biologicznych

Konkurs: SHENG 2 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Sebastian Kmiecik

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych

Rozwój narzędzi do racjonalnego projektowania leków peptydowych

Konkurs: OPUS 20 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Sebastian Kmiecik

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych

Opracowanie nowej metody dokowania białko-białko w oparciu o giętkie dokowanie krótkich fragmentów peptydowych.

Konkurs: OPUS 17 , panel: NZ2

Kierownik: dr Mateusz Kurciński

Uniwersytet Warszawski

Połączenie metody Rosetta z gruboziarnistym modelem SURPASS w nowy wieloskalowy algorytm modelowania białek i ich komple...

Konkurs: OPUS 15 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Dominik Gront

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Wieloskalowe symulacje dynamiki molekularnej w celu zbadania struktury oligomerów amyloidów beta.

Konkurs: PRELUDIUM 14 , panel: NZ1

Kierownik: Dinh Quoc Huy Pham

Instytut Fizyki Polskiej Akademii Nauk

Zwiększenie globalnej i lokalnej dokładności gruboziarnistego modelu UNRES białek oraz jego rozszerzenie na symulacje ba...

Konkurs: OPUS 13 , panel: ST4

Kierownik: prof. Józef Liwo

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Gruboziarnista metoda do modelowania struktury przestrzennej cząsteczek RNA, uwzględniająca niekanoniczne parowania zasa...

Konkurs: OPUS 12 , panel: ST6

Kierownik: dr Michał Boniecki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Białka wielodomenowe i częściowo nieustrukturyzowane w procesach rozkładu celulozy i adhezji komórek

Konkurs: OPUS 11 , panel: NZ1

Kierownik: dr Bartosz Różycki

Instytut Fizyki Polskiej Akademii Nauk

Algorytmy globalnego dokowania białek oparte na gruboziarnistym modelu UNRES

Konkurs: PRELUDIUM 9 , panel: ST4

Kierownik: dr Paweł Krupa

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Gruboziarnisty model oddziaływań nanocząstek z białkami do symulacji transportu substancji leczniczych do miejsc docelow...

Konkurs: PRELUDIUM 9 , panel: ST4

Kierownik: dr Magdalena Mozolewska

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii