Projekty finansowane przez NCN

Obliczeniowy model specyficznej tkankowo regulacji genów.

Konkurs: ETIUDA 3 , panel: NZ2

Kierownik: Paweł Bednarz

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Wykorzystanie metod uczenia maszynowego w zadaniach komputerowo wspomaganego projektowania leków.

Konkurs: ETIUDA 3 , panel: NZ2

Kierownik: Sabina Podlewska

Instytut Farmakologii PAN

Opracowanie metody do przewidywania struktury przestrzennej kompleksów receptorów GPCR z agonistami i antagonistami z uw...

Konkurs: SONATA 1 , panel: NZ2

Kierownik: dr Michał Koliński

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego PAN

Porównawcza analiza strukturalno-funkcjonalna in silico białek STAT i IRF, w celu identyfikacji związków chemicznych, dz...

Konkurs: ETIUDA 3 , panel: NZ2

Kierownik: Małgorzata Szeląg

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Oksygenazy zależne od 2-oksoglutaranu katalizujące atypowe reakcje utleniania - badania nad strukturami oraz mechanizmam...

Konkurs: OPUS 8 , panel: NZ1

Kierownik: prof. Tomasz Borowski

Instytut Katalizy i Fizykochemii Powierzchni im. Jerzego Habera PAN

Identyfikacja elementów regulatorowych i czynników transkrypcyjnych odpowiedzialnych za różnice w transkrypcji genów pom...

Konkurs: PRELUDIUM 8 , panel: NZ2

Kierownik: Paweł Bednarz

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Nowy model homologiczny receptora H3 histaminowego - budowa, oddziaływanie z ligandami

Konkurs: PRELUDIUM 8 , panel: NZ7

Kierownik: Jakub Jończyk

Uniwersytet Jagielloński - Collegium Medicum, Collegium Medicum, Wydział Farmaceutyczny

Oksygenazy zależne od 2-oksoglutaranu w biosyntezie alkaloidów o aktywności farmakologicznej - struktury, mechanizmy rea...

Konkurs: SONATA BIS 4 , panel: NZ1

Kierownik: prof. Tomasz Borowski

Instytut Katalizy i Fizykochemii Powierzchni im. Jerzego Habera Polskiej Akademii Nauk

Opracowanie wielostanowego komputera DNA poprzez zastosowanie wielu enzymów restrykcyjnych

Konkurs: OPUS 1 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Tomasz Popławski

Uniwersytet Łódzki, Wydział Biologii i Ochrony Środowiska

Stochastyczne zmiany fenotypu dzielących się bakterii

Konkurs: PRELUDIUM 7 , panel: NZ2

Kierownik: dr Joanna Jaruszewicz-Błońska

Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN

Mechanizmy determinujące los komórki w odpowiedzi na stress. Analiza eksperymentalna i teoretyczna

Konkurs: OPUS 7 , panel: NZ2

Kierownik: prof. Tomasz Lipniacki

Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN

PerM-Cloud, Algorytmy i metody przetwarzania dużych zbiorów danych genomicznych w środowiskach chmur obliczeniowych na p...

Konkurs: OPUS 7 , panel: NZ2

Kierownik: dr Michał Okoniewski

Politechnika Warszawska, Wydział Elektroniki i Technik Informacyjnych

Oddziaływania hydrodynamiczne w układach biomolekularnych. Badania obliczeniowe.

Konkurs: OPUS 7 , panel: NZ1

Kierownik: dr hab. Maciej Długosz

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Teoretyczne badania nad strukturą receptorów związanych z białkiem G. Narzędzia wspomagające modelowanie homologiczne or...

Konkurs: ETIUDA 2 , panel: NZ2

Kierownik: Stefan Mordalski

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii

Regulacja kaskady RAF/MEK/ERK przez izoformy RAF

Konkurs: PRELUDIUM 6 , panel: NZ2

Kierownik: Paweł Kocieniewski

Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN

Stabilność białek w wodnych roztworach osmolitów w oparciu o komplementarne podejście eksperymentalne i teoretyczne

Konkurs: OPUS 6 , panel: NZ1

Kierownik: prof. Janusz Stangret

Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny

Zintegrowane podejście do przewidywania struktur białek oraz kompleksów białek przy użyciu gruboziarnistego pola siłoweg...

Konkurs: HARMONIA 5 , panel: ST4

Kierownik: prof. Józef Liwo

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Badanie struktury centrum aktywnego gamma-sekretazy oraz jej interakcji z wybranymi substratami.

Konkurs: PRELUDIUM 5 , panel: NZ2

Kierownik: Krzysztof Młynarczyk

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Opracowanie narzędzia do automatycznej oceny kompleksów ligandów z receptorami serotoninowymi opartego o wykorzystanie m...

Konkurs: PRELUDIUM 5 , panel: NZ2

Kierownik: Sabina Podlewska

Instytut Farmakologii PAN

Mechanizm wiązania liganda oraz zmiany konformacyjne w cząsteczce receptora beta2-adrenergicznego

Konkurs: SONATA 5 , panel: NZ2

Kierownik: dr Anita Płazińska

Uniwersytet Medyczny w Lublinie, Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Analityki Medycznej

Zostosowanie wysoko wydajnych metod obliczeniowych do modelowania dynamiki dywersyfikacji hemaglutyniny wirusa grypy

Konkurs: OPUS 5 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Dariusz Plewczyński

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Emergentne własności biologicznych krajobrazów dostosowania na podstawie modeli sztucznego życia

Konkurs: PRELUDIUM 4 , panel: NZ2

Kierownik: dr Marcin Zagórski

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej

seQinspector - analiza mechanizmów regulacji transkrypcji genów w skali całego genomu

Konkurs: PRELUDIUM 1 , panel: NZ2

Kierownik: dr Marcin Piechota

Instytut Farmakologii PAN

Teoretyczny model SH2-zależnej dimeryzacji białka STAT1 jako nowe narzędzie do identyfikacji specyficznych inhibitorów a...

Konkurs: PRELUDIUM 4 , panel: NZ2

Kierownik: Małgorzata Szeląg

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Analiza struktury sekwencji regulatorowych i predykcja dynamiki ekspresji genów.

Konkurs: PRELUDIUM 3 , panel: NZ2

Kierownik: dr Marta Iwanaszko

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Przewidywanie struktury kompleksu Cascade.

Konkurs: PRELUDIUM 3 , panel: NZ2

Kierownik: dr Joanna Kasprzak

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Metody obliczeniowe do detekcji mutacji związanych z opornością na antybiotyki w szczepach bakteryjnych

Konkurs: PRELUDIUM 3 , panel: ST6

Kierownik: Michał Woźniak

Uniwersytet Warszawski

Oszczędne pamięciowo algorytmy przetwarzania i analizy danych z sekwencjonowania genomów

Konkurs: OPUS 3 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Sebastian Deorowicz

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Całościowa adnotacja enhancerów ssaków w oparciu o dane genomowe i funkcjonalne

Konkurs: OPUS 3 , panel: NZ2

Kierownik: prof. Jerzy Tiuryn

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Projektowanie nowych związków, wpływających na agregację beta-amyloidu oraz przekaźnictwo cholinergiczne, metodami model...

Konkurs: FUGA 1 , panel: NZ2

Kierownik: dr Marek Bajda

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Nowa metoda bioinformatyczna do predykcji miejsc wiązania ligandów w strukturach RNA

Konkurs: PRELUDIUM 2 , panel: NZ2

Kierownik: dr Anna Philips

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Wydział Biologii

Całościowe przewidywanie kooperatywnych elementów regulatorowych w genomach eukariotycznych

Konkurs: PRELUDIUM 2 , panel: NZ2

Kierownik: Aleksander Jankowski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Opracowanie nowej funkcji oceniającej modele kompleksów białek z małymi cząsteczkami i jej zastosowanie do zbadania oddz...

Konkurs: PRELUDIUM 2 , panel: NZ2

Kierownik: dr Irina Tuszyńska

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Struktura i funkcja dioksygenaz acireduktonu - badania doświadczalne i obliczeniowe.

Konkurs: OPUS 2 , panel: NZ1

Kierownik: dr hab. Tomasz Borowski

Instytut Katalizy i Fizykochemii Powierzchni im. Jerzego Habera PAN

Poszukiwanie nowych inhibitorów kinazy IKK-β w kontekście terapii chorób o podłożu neurodegeneracyjnym w oparciu o struk...

Konkurs: PRELUDIUM 22 , panel: NZ7

Kierownik: Emilia Sługocka

Uniwersytet Jagielloński, Collegium Medicum

Optymalizacja gruboziarnistych symulacji dynamiki molekularnej do badania tuneli dużych białek z zagłębionymi miejscami ...

Konkurs: PRELUDIUM 22 , panel: NZ2

Kierownik: Nishita Mandal

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Alchemia obliczeniowa i walidacja eksperymentalna: hybrydowe podejście do projektowania nowych peptydów przeciwdrobnoust...

Konkurs: PRELUDIUM 22 , panel: NZ1

Kierownik: Piotr Chyży

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Badanie procesów wiązania ligandów oraz aktywacji receptorów GPCR formylowych, opioidowych i kanabinoidowych

Konkurs: OPUS 2 , panel: NZ1

Kierownik: prof. Sławomir Filipek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Celowanie w kompleksy kwas nukleinowy-białko za pomocą małych cząsteczek przy użyciu platformy głębokiego uczenia

Konkurs: SONATINA 7 , panel: NZ1

Kierownik: dr Ryhor Nikalayeu

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

Ustanowienie uniwersalnego modelu pangenomowego

Konkurs: OPUS 24 , panel: ST6

Kierownik: dr hab. Norbert Dojer

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Wzorce ewolucyjne a kolonizacja nowych środowisk: badanie ewolucji i morfologii funkcjonalnej słodkowodnych szczękoczułk...

Konkurs: PRELUDIUM BIS 4 , panel: NZ8

Kierownik: dr hab. Kenneth De Baets

Uniwersytet Warszawski, Wydział Biologii

Matematyczne modelowanie roli mikro-RNA w regulacji poziomu transkryptów i efektywności translacji w komórkach napromien...

Konkurs: OPUS 23 , panel: NZ2

Kierownik: prof. Marek Kimmel

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Mechanizmy cyklizacji związków czynnych biologicznie katalizowane przez enzymy zależne od żelaza.

Konkurs: OPUS 23 , panel: ST4

Kierownik: prof. Tomasz Borowski

Instytut Katalizy i Fizykochemii Powierzchni im. Jerzego Habera Polskiej Akademii Nauk

Biomechanika molekularna wariantów SARS-CoV-2: wiązanie wirus - komórka gospodarz i omijanie układu odpornościowego

Konkurs: OPUS 23 , panel: NZ1

Kierownik: dr Adolfo Maximo Poma Bernaola

Instytut Podstawowych Problemów Techniki Polskiej Akademii Nauk

Rola i właściwości fizyczne trójwymiarowej struktury chromatyny w różnicowaniu komórek krwiotwórczych w odpowiedzi na pr...

Konkurs: PRELUDIUM BIS 3 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Jakub Mieczkowski

Gdański Uniwersytet Medyczny, Międzynarodowa Agenda Badawcza

Znaczenie zjawiska "discordant methylation" w fizjologii komórki

Konkurs: OPUS 22 , panel: NZ2

Kierownik: dr hab. Tomasz Wojdacz

Pomorski Uniwersytet Medyczny w Szczecinie

Biologiczny kod zawęźlenia - identyfikacja wzoru zawęźlenia w biomolekułach na postawie metod AI

Konkurs: OPUS 22 (LAP) , panel: NZ1

Kierownik: dr hab. Joanna Sułkowska

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Mikro-sprzymierzeńcy w czasach mega-kryzysu? Rola mikrobiomu w odpowiedzi zbiorowisk owadów na zmiany klimatyczne

Konkurs: OPUS 22 , panel: NZ8

Kierownik: dr hab. Piotr Łukasik

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biologii

Wielo-skalowa metoda składania włókien amyloidowych przy użyciu struktur protofilamentów przewidzianych na podstawie gru...

Konkurs: OPUS 22 , panel: NZ2

Kierownik: dr Michał Koliński

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego Polskiej Akademii Nauk

Zrozumienie biofizycznych czynników ograniczających precyzję powstawania wzoru w trakcie rozwoju tkanki

Konkurs: SONATA BIS 11 , panel: NZ2

Kierownik: dr Marcin Zagórski

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej