Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Metabolizm metali ciężkich oraz antybiotyków w arktycznych mikrobiocenozach bakteryjnych - analizy metagenomiczne, metatranskryptomiczne i genomiczne

2016/22/E/NZ8/00340

Słowa kluczowe:

Arktyka antybiotyk metal ciężki mikrobiocenoza bakteryjna metagenomika metatranskryptomika genomika

Deskryptory:

  • NZ8_4: Różnorodność biologiczna
  • NZ8_2: Ekologia
  • NZ9_8: Mikrobiologia środowiskowa

Panel:

NZ8 - Podstawy wiedzy o życiu na poziomie środowiskowym: biologia ewolucyjna, biologia populacyjna, biologia środowiskowa, systematyka

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Biologii

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Łukasz Dziewit 

Liczba wykonawców projektu: 7

Konkurs: SONATA BIS 6 - ogłoszony 2016-06-15

Przyznana kwota: 1 965 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2017-04-20

Zakończenie projektu: 2023-04-19

Planowany czas trwania projektu: 72 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Przenośna zamrażarka (-20ᵒC) (np. MPRF 35, firmy Angelantoni Life Science s.r.l.) (2 szt.). Za kwotę 26 000 PLN
  2. Szafa chłodnicza z wytrząsarkami laboratoryjnymi (aparatura wytworzona w ramach projektu). Za kwotę 30 000 PLN
  3. Zamrażarka niskotemperaturowa (-80ᵒC) (np. model PLATINUM 340V Next, firmy CHEMINST). Za kwotę 44 000 PLN
  4. Homogenizator (np. FastPrep-24™ 5G, firmy MP Biomedicals). Za kwotę 45 000 PLN
  5. Serwer komputerowy do obliczeń.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (6)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Revealing the diversity of bacteria and fungi in the active layer of permafrost at Spitsbergen island (Arctic) – Combining classical microbiology and metabarcoding for ecological and bioprospecting exploration
    Autorzy:
    Dziurzynski Mikolaj, Gorecki Adrian, Pawlowska Julia, Istel Lukasz, Decewicza Przemysław, Golec Piotr, Styczynski Michał, Poszytek Krzysztof, Rokowska Anna, Gorniak Dorota, Dziewit Łukasz
    Czasopismo:
    Science of the Total Environment (rok: 2023, tom: 856, part 2, strony: 159072), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.scitotenv.2022.159072 - link do publikacji
  2. Literature-based, manually-curated database of PCR primers for the detection of antibiotic resistance genes in various environments.
    Autorzy:
    Gorecki Adrian, Decewicz Przemysław, Dziurzynski Mikołaj, Janeczko Anna, Drewniak Łukasz, Dziewit Łukasz
    Czasopismo:
    Water Research (rok: 2019, tom: 161, strony: 211-221), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.watres.2019.06.009 - link do publikacji
  3. Metaplasmidome-encoded functions of Siberian low-centered polygonal tundra soils
    Autorzy:
    Gorecki Adrian, Holm Stine, Dziurzynski Mikolaj, Winkel Matthias, Yang Sizhong, Liebner Susanne, Wagner Dirk, Dziewit Lukasz, Horn Fabian
    Czasopismo:
    ISME Journal (rok: 2021, tom: 15, strony: 3258-3270), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41396-021-01003-y - link do publikacji
  4. Development and validation of novel PCR primers for identification of plasmid-mediated colistin resistance (mcr) genes in various environmental settings
    Autorzy:
    Gorecki Adrian, Musialowski Marcin, Wolacewicz Mikolaj, Decewicz Przemyslaw, Ferreira Catarina, Vejmelkova Dana, Grzesiuk Malgorzata, Manaia Celia M., Bartacek Jan, Dziewit Łukasz
    Czasopismo:
    Journal of Hazardous Materials (rok: 2022, tom: 425, strony: 127936), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jhazmat.2021.127936 - link do publikacji
  5. Draft genome sequence of Arctic, heavy metal-resistant Agrococcus sp. strain ARC_14 isolated from active layer of permafrost from Spitsbergen (Norway).
    Autorzy:
    Dziurzynski Mikołaj, Rokowska Anna, Gorecki Adrian, Decewicz Przemysław, Szych Anna, Dziewit Łukasz
    Czasopismo:
    Microbiology Resource Announcements (rok: 2022, tom: 11, strony: e00221-22), Wydawca: American Society for Microbiology (ASM Journals)
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1128/mra.00221-22 - link do publikacji
  6. Development of the LCPDb-MET database facilitating selection of PCR primers for the detection of metal metabolism and resistance genes in bacteria
    Autorzy:
    Dziurzynski Mikolaj, Gorecki Adrian, Decewicz Przemysław, Ciuchcinski Karol, Dabrowska Maria, Dziewit Łukasz
    Czasopismo:
    Ecological Indicators (rok: 2022, tom: 145, strony: 109606), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ecolind.2022.109606 - link do publikacji
  1. Simple, reliable, and time-efficient manual annotation of bacterial genomes with MAISEN
    Autorzy:
    Dziurzynski Mikolaj, Decewicz Przemyslaw, Ciuchcinski Karol, Gorecki Adrian, Dziewit Lukasz
    Książka:
    Methods in Molecular Biology / Bacterial Pangenomics, second edition (rok: 2021, tom: 2242, strony: 221-229), Wydawca: Springer Protocols/Humana Press
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy