Projects funded by the NCN

Non-canonical functions of ATP in the regulation of gene expression

Call: SONATA BIS 11 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Aleksandra Pękowska

Instytut Biologii Doświadczalnej im. Marcelego Nenckiego Polskiej Akademii Nauk

IFIT proteins in the regulation of inflammatory responses

Call: OPUS 21 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Maria Górna

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Close Encounters of the Third Kind: what happens when ribonuclease Dicer encounters in the cell RNA and DNA adopting G-q...

Call: OPUS 21 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr hab. Anna Kurzyńska-Kokorniak

Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk

WWOX gene as a modulator of the structure and function of the cytoskeleton and intercellular communication in glioblasto...

Call: PRELUDIUM 20 , Panel: NZ2

Principal investigator: Żaneta Kałuzińska

Uniwersytet Medyczny w Łodzi, Wydział Lekarski

Living on the edge: evolutionary adaptation of substrate-recruiting subunits of the cullin-RING ubiquitin ligase complex...

Call: PRELUDIUM 20 , Panel: NZ1

Principal investigator: Natalia Szulc

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

Predicting 3D RNA structures using Generative Adversarial Networks

Call: PRELUDIUM BIS 2 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Marta Szachniuk

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki i Telekomunikacji

3D Structure determination of key regulatory regions at the 5' and 3' termini of pathogenic Flaviviruses RNA

Call: SONATA 16 , Panel: NZ6

Principal investigator: dr Tales Rocha de Moura

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

Investigation of the RNA secondary structure in vivo with employment of high-throughput sequencing techniques

Call: SONATA 2 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Marek Żywicki

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Wydział Biologii UAM

Structural and functional characterization of novel non-coding RNAs from Helicobacter pylori

Call: SONATA 1 , Panel: NZ1

Principal investigator: dr Grzegorz Chojnowski

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Development of tools for the rational design of peptide therapeutics

Call: OPUS 20 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr hab. Sebastian Kmiecik

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych

Discovery and characterization of RNA structure motifs conserved in positive-sense single-stranded RNA viruses and in ot...

Call: SONATA 16 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Tomasz Wirecki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

Input of the structure of influenza A virus RNA on regulation of virus proliferation. High throughput screening of small...

Call: OPUS 20 , Panel: NZ1

Principal investigator: prof. Elżbieta Kierzek

Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk

Unraveling the influence of posttranscriptional modifications on RNA 3D structure formation and its dynamics, with the i...

Call: OPUS 19 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Janusz Bujnicki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

Towards automatic derivation of geometry-based descriptors as surrogates for complex structural approaches in enzyme-sub...

Call: PRELUDIUM 19 , Panel: NZ2

Principal investigator: Carlos Sequeiros Borja

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Making use of siderophore transport systems to deliver peptide nucleic acids to bacterial cells

Call: OPUS 19 , Panel: NZ1

Principal investigator: prof. Joanna Trylska

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Multiscale spatial reorganization of chromatin in response to replication stress and its role in cellular protection aga...

Call: OPUS 19 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr hab. Dariusz Plewczyński

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Identification and comprehensive classification of peptidases

Call: SONATA 15 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Kamil Steczkiewicz

Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

Analysis of the conformations of organic compounds in macromolecular structures

Call: PRELUDIUM 18 , Panel: ST6

Principal investigator: Joanna Macnar

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Spatial network model of sequence and structure diversity of Human genome at a population scale

Call: PRELUDIUM BIS 1 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Dariusz Plewczyński

Politechnika Warszawska, Wydział Matematyki i Nauk Informacyjnych

Feature exploration and modelling of quadruplex structures

Call: OPUS 18 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Marta Szachniuk

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki

Regulation and spatiotemporal dynamics of chromatin insulators in mammalian development

Call: OPUS 17 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Aleksandra Pękowska

Instytut Biologii Doświadczalnej im. Marcelego Nenckiego Polskiej Akademii Nauk

Novel families of ADP-ribosyltransferases and proteins involved in ADP-ribosylation.

Call: OPUS 17 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr hab. Krzysztof Pawłowski

Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie, Wydział Rolnictwa i Biologii

Relative dependencies analysis in the exploration of multi-omics data

Call: OPUS 17 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Marcin Czajkowski

Politechnika Białostocka, Wydział Informatyki

Zastosowanie metod uczenia maszynowego i symulacji molekularnych w badaniu zależności pomiędzy sekwencją, strukturą a fu...

Call: ETIUDA 7 , Panel: NZ1

Principal investigator: Jan Ludwiczak

Instytut Biologii Doświadczalnej im. Marcelego Nenckiego Polskiej Akademii Nauk

Biological significance of DNA replication-dependent changes in local higher-order chromatin structure.

Call: OPUS 16 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Michal Gdula

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Bridging the gap: DNA catalysis explained

Call: SONATA 14 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Maria Ponce Salvatierra

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

Structural and functional characterization of loci determining the content of cell wall-bound phenolics under the condit...

Call: OPUS 16 , Panel: NZ9

Principal investigator: dr hab. Tomasz Hura

Instytut Fizjologii Roślin im. Franciszka Górskiego Polskiej Akademii Nauk

Computational methods for genomic structural variants interpretation

Call: HARMONIA 10 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Anna Gambin

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Using transcriptomic data for identification of new miRNAs and prediction of miRNA gene structures

Call: PRELUDIUM 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Michał Szcześniak

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Wydział Biologii

Prediction of protein and peptide isoelectric point based on sequence and structure features

Call: OPUS 15 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Łukasz Kozłowski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Globalna identyfikacja mRNA regulowanych przez PUM1 i PUM2 oraz ich białkowych kofaktorów, w modelu nasieniaka człowieka...

Call: ETIUDA 6 , Panel: NZ1

Principal investigator: Maciej Śmiałek

Instytut Genetyki Człowieka Polskiej Akademii Nauk

Mapping NARES-2P coarse-grained model of nucleic acids to all-atom representation

Call: PRELUDIUM 14 , Panel: ST4

Principal investigator: Łukasz Golon

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Functional and structural interplay between two mitochondrial inner membrane proteases, AtFTSH4 and AtOMA1, in Arabidops...

Call: OPUS 14 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Hanna Jańska

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii

The role of solvation water in shaping the activity of antifreeze proteins.

Call: PRELUDIUM 14 , Panel: ST4

Principal investigator: Joanna Grabowska

Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny

Molecular mechanisms of the allosteric communication in thymidylate synthase

Call: PRELUDIUM 14 , Panel: NZ1

Principal investigator: dr Jan Ludwiczak

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Integrative modeling and structure determination of macromolecular complexes comprising RNA and proteins

Call: MAESTRO 9 , Panel: NZ1

Principal investigator: prof. Janusz Bujnicki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Molecular origins of mechanisms governing biological functions of enzymes with buried actives sites: substrate inhibitio...

Call: SONATA BIS 7 , Panel: NZ1

Principal investigator: dr hab. Jan Brezovsky

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

An integrated approach to modeling protein structure and dynamics based on the UNRES coarse-grained force field and bioi...

Call: HARMONIA 9 , Panel: ST4

Principal investigator: dr hab. Cezary Czaplewski

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Molecular picture of the mechanochemical coupling in ATP synthase as a conceptual framework for the development of novel...

Call: SONATA BIS 7 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr hab. Jacek Czub

Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny

Developement of new methods for designing RNA molecules that fold into desired spatial structures and their use for deve...

Call: OPUS 13 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Janusz Bujnicki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Enabling routine and reliable analysis of transport tunnels in proteins

Call: OPUS 13 , Panel: NZ1

Principal investigator: dr Jan Brezovsky

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

A coarse-grained method for RNA 3D structure modeling, with emphasis on non-canonical base pairing.

Call: OPUS 12 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Michał Boniecki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Development of novel bioinformatics software for analysis of genetic variation in non-coding elements of the human genom...

Call: POLONEZ 3 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Paweł Sztromwasser

Uniwersytet Medyczny w Łodzi, I Katedra Pediatrii

Development of bioinformatics models to analyze 3D RNA structures in torsion angle space

Call: PRELUDIUM 12 , Panel: ST6

Principal investigator: Tomasz Żok

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki

RNApolis - methods and algorithms to model and analyse the RNA structure

Call: OPUS 12 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Marta Szachniuk

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki i Telekomunikacji

Identification of novel structural variants in patients presenting with congenital limb malformations by means of the ge...

Call: PRELUDIUM 12 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Magdalena Socha

Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu, Wydział Lekarski

Unknown areas of activity of human ribonuclease Dicer

Call: SONATA BIS 6 , Panel: NZ1

Principal investigator: dr hab. Anna Kurzyńska-Kokorniak

Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk

New algorithms for estimating clonal structures and for modeling heterogenous evolution for applications in cancer genom...

Call: OPUS 11 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Andrzej Polański

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Modelowanie i analiza przestrzennej struktury i dynamiki chromatyny w jądrze komórkowym.

Call: ETIUDA 4 , Panel: NZ2

Principal investigator: Przemysław Szałaj

Uniwersytet Medyczny w Białymstoku, Wydział Lekarski z Oddziałem Stomatologii i Oddziałem Nauczania w Języku Angielskim

Metody wspomagania modelowania struktury trzeciorzędowej białek za pomocą predyktorów miejsc kontaktowych

Call: ETIUDA 4 , Panel: NZ1

Principal investigator: Paweł Woźniak

Politechnika Wrocławska, Wydział Podstawowych Problemów Techniki