Projects funded by the NCN

Algorithms for Editable Pangenome Graphs

Call: PRELUDIUM 24 , Panel: ST6

Principal investigator: Adam Aleksander Cicherski

Uniwersytet Warszawski

Computational methods for understanding tumor immune microenvironment from spatial imaging data

Call: SONATA 19 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Krzysztof Kamil Gogolewski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Modeling and Forecasting of Infection Spread in Warand Post War Settings Using Epidemiological, Behavioral and Genomic S...

Call: IMPRESS-U , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Sergiy Yakovlev

Politechnika Łódzka, Wydział Fizyki Technicznej, Informatyki i Matematyki Stosowanej

The genetic basis underlying immune resistance in selected accessions of the model plant A. thaliana against the plant p...

Call: PRELUDIUM 22 , Panel: NZ2

Principal investigator: Anastasiia Satyr

Instytut Chemii Bioorganicznej PAN

Comprehensive, multimodal profiling of chromatin states and gene expression in single cells.

Call: SONATA BIS 12 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Marcin Tabaka

Instytut Chemii Fizycznej Polskiej Akademii Nauk, Międzynarodowe Centrum Badań Oka

Temporal profiles of miRNA expression during multiciliogenesis and miRNA contribution to the pathogenesis of primary cil...

Call: PRELUDIUM 21 , Panel: NZ2

Principal investigator: Joanna Jurczak

Instytut Genetyki Człowieka PAN

Genomic, morphological, and paleontological data in reconstructing the taxonomic structure and evolutionary history of t...

Call: PRELUDIUM 21 , Panel: NZ8

Principal investigator: Alexandra Tokareva

Muzeum i Instytut Zoologii PAN

Topic modeling for multimodal single-cell data

Call: PRELUDIUM 21 , Panel: NZ2

Principal investigator: Piotr Rutkowski

Instytut Chemii Fizycznej Polskiej Akademii Nauk, Międzynarodowe Centrum Badań Oka

Significance of discordant methylation phenomenon in cell physiology

Call: OPUS 22 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr hab. Tomasz Kazimierz Wojdacz

Pomorski Uniwersytet Medyczny w Szczecinie

Functional roles of somatic piRNAs and their evolution

Call: SONATA 17 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr hab. Guillem Ylla Bou

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii

Cell-to-cell heterogeneity of cross-wired cytokine signaling: filling the gaps between molecular origins and translation...

Call: OPUS 20 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr hab. Michał Komorowski

Instytut Podstawowych Problemów Techniki Polska Akademia Nauk

Phylogenetic models to infer cancer evolution

Call: SONATA 16 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Jarosław Andrzej Paszek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Integrative analysis of single-cell genomics data

Call: SONATA 16 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Aleksander Albert Jankowski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Testing species boundaries in the order Apochela (Tardigrada) with genomic data

Call: ETIUDA 8 , Panel: NZ8

Principal investigator: Witold Morek

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biologii

High-resolution analysis of data from proton-deuterium exchange experiments monitored by mass spectrometry.

Call: PRELUDIUM BIS 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Michał Lech Dadlez

Instytut Biochemii i Biofizyki PAN

UNDERSTANDING CROSS-TALK BETWEEN AMYLOID PROTEINS

Call: OPUS 18 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Małgorzata Kotulska

Politechnika Wrocławska

Combined genomic, phenotypic and spatial analysis of intra-tumor heterogeneity

Call: OPUS 17 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Ewa Szczurek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Systems approach to cancer progression and prognosis: New models and statistics for analysis of genomic data

Call: OPUS 15 , Panel: ST7

Principal investigator: prof. Marek Kimmel

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Compression of large-scale genomic data collections

Call: OPUS 13 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Sebastian Deorowicz

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Expression regulation of protein-coding genes overlapping at their 5' ends.

Call: OPUS 13 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Izabela Alina Makałowska

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Statistical and machine learning challenges in classification and integration of molecular and genomic data

Call: SONATA 12 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Neo Christopher Honghoon Chung

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Principles of mitochondrial protein compartmentalization in vertebrates

Call: POLONEZ 3 , Panel: NZ3

Principal investigator: dr Barbara Uszczyńska-Ratajczak

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Incorporating genomic variation information into DNA sequencing data analysis

Call: OPUS 11 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Norbert Artemi Dojer

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

New algorithms for estimating clonal structures and for modeling heterogenous evolution for applications in cancer genom...

Call: OPUS 11 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Andrzej Polański

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Compression and analysis of genomic data

Call: OPUS 9 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Sebastian Deorowicz

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

gEMiLia - gEnomic Machine Learning. Machine learning algorithms and methods with cloud computing for biological and medi...

Call: SONATA 9 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Anna Leśniewska

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki

PerM-Cloud, ALgorithms and methods of processing big genomic data repositories in computing cloud environment towards th...

Call: OPUS 7 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Michał Okoniewski

Politechnika Warszawska, Wydział Elektroniki i Technik Informacyjnych

Methods and algorithms of discovering novel phenomena in genomes and transcriptomes with the statistical analysis of nuc...

Call: PRELUDIUM 7 , Panel: ST6

Principal investigator: Marek Stanisław Wiewiórka

Politechnika Warszawska, Wydział Elektroniki i Technik Informacyjnych

Relationship between viral genome composition and virus-host interactions. Viral host prediction based on genomic sequen...

Call: PRELUDIUM 4 , Panel: NZ2

Principal investigator: Wojciech Kazimierz Gałan

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii

Comprehensive mammalian enhancer annotation from sequence and functional data

Call: OPUS 3 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Jerzy Tiuryn

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Using transcriptomic data for identification of new miRNAs and prediction of miRNA gene structures

Call: PRELUDIUM 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Michał Szcześniak

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Analysis of protein mass profiles obtained by MALDI-ToF spectrometry to discover signatures of cancer

Call: PRELUDIUM 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Michał Marczyk

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Structure prediction of proteins and large protein assemblies guided by low-resolution or/and sparse experimental data.

Call: SONATA 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Dominik Gront

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

Compression and data mining algorithms for genomic data and their implications for comparative genomics

Call: OPUS 1 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Andrzej Polański

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Integrative systems biology: inferring from massive heterogeneous data

Call: OPUS 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr hab. Anna Barbara Gambin

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki