Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

IDENTYFIKACJA NOWYCH GENÓW ODGRYWAJĄCYCH WAŻNĄ ROLĘ W PROCESIE NOWOTWORZENIA W CZĘSTYCH NOWOTWORACH CZŁOWIEKA

2011/01/B/NZ5/02773

Słowa kluczowe:

CNV zmienność liczby kopii onkogeny geny supresorowe MLPA mutacje somatyczne

Deskryptory:

  • NZ2_1: Genetyka molekularna
  • NZ5_5: Diagnostyka chorób człowieka
  • NZ2_11: Epidemiologia genetyczna

Panel:

NZ5 - Choroby niezakaźne ludzi i zwierząt: przyczyny, mechanizmy, rozpoznawanie i leczenie chorób, zatruć i urazów

Jednostka realizująca:

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Piotr Kozłowski 

Liczba wykonawców projektu: 8

Konkurs: OPUS 1 - ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota: 746 200 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2011-12-06

Zakończenie projektu: 2016-07-05

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (14)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (6)
  1. Analysis of boutique arrays: A universal method for the selection of the optimal data normalization procedure IF: 1,957
    Autorzy:
    Uszczyńska B, Zyprych-Walczak J, Handschuh L, Szabelska A, Kaźmierczak M, Woronowicz W, Kozłowski P, Sikorski MM, Komarnicki M, Siatkowski I, Figlerowicz M
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Medicine (rok: 2013, tom: 32, strony: 668-684), Wydawca: Spandidos Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3892/ijmm.2013.1443 - link do publikacji
  2. The Use of a Two-Tiered Testing Strategy for the Simultaneous Detection of Small EGFR Mutations and EGFR Amplification in Lung Cancer IF: 4,015
    Autorzy:
    Lewandowska MA, Czubak K, Klonowska K, Jozwicki W, Kowalewski J, Kozlowski P
    Czasopismo:
    PLoS One (rok: 2015, tom: 10, strony: 44939), Wydawca: PLOS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0117983 - link do publikacji
  3. Cancer predisposing BARD1 mutations affect exon skipping and are associated with overexpression of specific BARD1 isoforms. IF: 2,301
    Autorzy:
    Ratajska M, Matusiak M, Kuzniacka A, Wasag B, Brozek I, Biernat W, Koczkowska M, Debniak J, Sniadecki M, Kozlowski P, Klonowska K, Pilyugin M, Wydra D, Laurent G, Limon J, Irminger-Finger I
    Czasopismo:
    Oncology Reports (rok: 2015, tom: 34, strony: 2609-2617), Wydawca: Spandidos Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3892/or.2015.4235 - link do publikacji
  4. Copy number variation in the region harboring SOX9 gene in dogs with testicular/ovotesticular disorder of sex development (78,XX; SRY-negative) IF: 5,578
    Autorzy:
    Marcinkowska-Swojak M, Szczerbal I, Pausch H, Nowacka-Woszuk J, Flisikowski K, Dzimira S, Nizanski W, Payan-Carreira R, Fries R, Kozlowski P, Switonski M
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2015, tom: 5, strony: 14696), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep14696 - link do publikacji
  5. Simultaneous detection of mutations and copy number variation of NPM1 in the acute myeloid leukemia using multiplex ligation-dependent probe amplification IF: 3,68
    Autorzy:
    Marcinkowska-Swojak M, Handschuh L, Wojciechowski P, Goralski M, Tomaszewski K, Kazmierczak M, Lewandowski K, Komarnicki M, Blazewicz J, Figlerowicz M, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Mutation Research-Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis (rok: 2016, tom: 786, strony: 14-26), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.mrfmmm.2016.02.001 - link do publikacji
  6. Unpredictable changes of selected miRNA in expression profile of HNSCC IF: 1,721
    Autorzy:
    Lamperska KM, Kozlowski P, Kolenda T, Teresiak A, Blizniak R, Przybyla W, Masternak MM, Golusinski P, Golusinski W
    Czasopismo:
    Cancer Biomarkers (rok: 2016, tom: 16, strony: 55-64), Wydawca: IOS Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3233/CBM-150540 - link do publikacji
  7. Copy number polymorphism in plant genomes IF: 3,658
    Autorzy:
    Zmienko A, Samelak A, Kozlowski P, Figlerowicz M
    Czasopismo:
    Theoretical and Applied Genetics (rok: 2014, tom: 127, strony: 44944), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00122-013-2177-7 - link do publikacji
  8. High copy number variation of cancer-related microRNA genes and frequent amplification of DICER1 and DROSHA in lung cancer IF: 6,359
    Autorzy:
    Czubak K, Lewandowska MA, Klonowska K, Roszkowski K, Kowalewski J, Figlerowicz M, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Oncotarget (rok: 2015, tom: 6, strony: 23399-23416), Wydawca: Impact Journals
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.18632/oncotarget.4351 - link do publikacji
  9. An MLPA-based approach for high-resolution genotyping of disease-related multi-allelic CNVs IF: 2,246
    Autorzy:
    Marcinkowska-Swojak M, Klonowska K, Figlerowicz M, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Gene (rok: 2014, tom: 546, strony: 257-262), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.gene.2014.05.072 - link do publikacji
  10. An MLPA-based strategy for discrete CNV genotyping: CNV-miRNAs as an example IF: 5,213
    Autorzy:
    Marcinkowska-Swojak M, Uszczynska B, Figlerowicz M, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Human Mutation (rok: 2013, tom: 34, strony: 763-773), Wydawca: Wiley Periodicals Inc.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/humu.22288 - link do publikacji
  11. Analysis of large mutations in BARD1 in patients with breast and/or ovarian cancer: the Polish population as an example IF: 5,578
    Autorzy:
    Klonowska K, Ratajska M, Czubak K, Kuzniacka A, Brozek I, Koczkowska M, Sniadecki M, Debniak J, Wydra D, Balut M, Stukan M, Zmienko A, Nowakowska B, Irminger-Finger I, Limon J, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2015, tom: 5, strony: 10424), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep10424 - link do publikacji
  12. Copy number variation of genes involved in the hepatitis C virus-human interactome IF: 5,228
    Autorzy:
    Budzko L, Marcinkowska-Swojak M, Jackowiak P, Kozlowski P, Figlerowicz M
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2016, tom: 6, strony: 31340), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep31340 - link do publikacji
  13. Oncogenomic portals for the visualization and analysis of genome-wide cancer data IF: 6,359
    Autorzy:
    Klonowska K, Czubak K, Wojciechowska M, Handschuh L, Zmienko A, Figlerowicz M, Dams-Kozlowska H, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Oncotarget (rok: 2016, tom: 7, strony: 176-192), Wydawca: Impact Journals
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.18632/oncotarget.6128. - link do publikacji
  14. Genetic predisposition to breast and/or ovarian cancer – focus on the candidate BARD1 gene
    Autorzy:
    Klnowska K, Ratajska M, Wojciechowsak M, Kozlowski P
    Czasopismo:
    BioTechnologia Journal of Biotechnology, Computational Biology and Bionanotechnology (rok: 2014, tom: 95, strony: 203-214), Wydawca: Termedia
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.5114/bta.2014.54796 - link do publikacji
  1. Analysis of Large Mutations in BARD1 Gene in Patients with Breast and/or Ovarian Cancer
    Autorzy:
    Klonowska K, Ratajska M, Kuzniacka A, Brozek I, Kozlowski P, Limon J
    Konferencja:
    The 5th International Symposium on Hereditary Breast and Ovarian Cancer – BRCA: Twenty Years of Advances" Montreal 2014 (rok: 2014, ), Wydawca: Multimed Inc
    Data:
    konferencja 23-25 kwiecień
    Status:
    Opublikowana
  2. Detection of leukemia-specific NPM1 mutations with the use of three different approaches
    Autorzy:
    Handschuh L Marcinkowska-Swojak M, Tomaszewski K, Wojciechowski P, Goralski M, Kazmierczak M, Komarnicki M, Figlerowicz M, Kozlowski P
    Konferencja:
    BIO 2014 - Warsaw (rok: 2014, ), Wydawca: Polish Biochemical Society and of the Committee of Biochemistry and Biophysics Polish Academy of Sciences
    Data:
    konferencja 9-12 wrzesień
    Status:
    Opublikowana
  3. MLPA-based strategy for discrete CNV genotyping: CNV-miRNAs as an example
    Autorzy:
    Marcinkowska M, Kozlowski P
    Konferencja:
    62nd Annual Meeting of The American Society of Human Genetics - San Francisco 2012 (rok: 2012, ), Wydawca: American Society of Human Genetics
    Data:
    konferencja 6-10 listopad
    Status:
    Opublikowana
  4. Analiza dużych mutacji w genie BARD1 u pacjentek z rakiem piersi i/lub jajnika
    Autorzy:
    Klonowska K, Ratajska M, Kuzniacka A, Limon J, Czubak K, Kozlowski P
    Konferencja:
    VI Kongres Współczesnej Onkologii – "Next Generation" - Poznan 2014 (rok: 2014, ), Wydawca: Termedia
    Data:
    konferencja 27-29 marzec
    Status:
    Opublikowana
  5. Analiza liczby kopii wybranych genów mikroRNA i genów związanych z biogenezą mikroRNA w raku płuca
    Autorzy:
    Czubak K, Lewandowska MA, Jozwicki W, Kowalewski W, Klonowska K, Kozlowski P
    Konferencja:
    VI Kongres Współczesnej Onkologii – "Next Generation" - Poznan 2014 (rok: 2014, ), Wydawca: Termedia
    Data:
    konferencja 27-29 marzec
    Status:
    Opublikowana
  6. Copy number polymorphism of microRNA Genes
    Autorzy:
    Kozlowski P, Marcinkowska M
    Konferencja:
    RNA Biology Cold Spring Harbor Asia (rok: 2012, ), Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
    Data:
    konferencja 8-12 październik
    Status:
    Opublikowana