Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Status metylacji końca 5' mRNA: w kierunku głębszego zrozumienia biologicznej roli oraz identyfikacji syntetycznych mimetyków.

2019/33/B/ST4/01843

Słowa kluczowe:

synteza nukleotydów mRNA 5' cap therapeutic mRNA affinity chromatography resins methylation wydajność translacji immunogenność

Deskryptory:

  • ST4_9: Chemia biologiczna
  • ST4_10: Chemia polimerów, biopolimerów
  • NZ1_2: Biochemia

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

woj.

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Jacek Jemielity 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 17 - ogłoszony 2019-03-15

Przyznana kwota: 1 995 440 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2020-02-01

Zakończenie projektu: 2024-02-19

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (17)
  1. 2′-O-Methylation of the second transcribed nucleotide within the mRNA 5′ cap impacts the protein production level in a cell-specific manner and contributes to RNA immune evasion
    Autorzy:
    Karolina Drazkowska, Rafal Tomecki, Marcin Warminski, Natalia Baran, Dominik Cysewski, Anaïs Depaix, Renata Kasprzyk, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity, Pawel J. Sikorski
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2022, tom: 50(16), strony: 9051–9071), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkac722 - link do publikacji
  2. Chemically Modified Poly(A) Analogs Targeting PABP: Structure Activity Relationship and Translation Inhibitory Properties
    Autorzy:
    Olga Perzanowska, Miroslaw Smietanski, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Chemistry—A European Journal (rok: 2022, tom: 28 (42), strony: e202201115), Wydawca: Wiley-VCH GmbH
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/chem.202201115 - link do publikacji
  3. Novel N7-Arylmethyl Substituted Dinucleotide mRNA 50 cap Analogs: Synthesis and Evaluation as Modulators of Translation
    Autorzy:
    1. Wójcik R., Baranowski M., Markiewicz Ł., Kubacka D., Bednarczyk M., Baran N., Wojtczak A., Sikorski P.J., Żuberek J., Kowalska J., Jemielity J.
    Czasopismo:
    Pharmaceutics (rok: 2021, tom: 13(11), strony: 1941), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/pharmaceutics13111941 - link do publikacji
  4. Chemically Modified Poly(A) Analogs Targeting PABP: Structure Activity Relationship and Translation Inhibitory Properties
    Autorzy:
    Olga Perzanowska, Miroslaw Smietanski, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Chemistry—A European Journal (rok: 2022, tom: 28 (42), strony: e202201115), Wydawca: Wiley-VCH GmbH
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/chem.202201115 - link do publikacji
  5. Quick Access to Nucleobase-Modified Phosphoramidites for the Synthesis of Oligoribonucleotides Containing Post-Transcriptional Modifications and Epitranscriptomic Marks
    Autorzy:
    Kamil Ziemkiewicz, Marcin Warminski, Radoslaw Wojcik, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    The Journal of Organic Chemistry (rok: 2022, tom: 87 (15), strony: 10333-10348), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.joc.2c01390 - link do publikacji
  6. Preparation of RNAs with non-canonical 5′ ends using novel di- and trinucleotide reagents for co-transcriptional capping
    Autorzy:
    Anaïs Depaix, Ewa Grudzien-Nogalska, Bartlomiej Fedorczyk, Megerditch Kiledjian, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES (rok: 2022, tom: 9, strony: Article Number 854170), Wydawca: FRONTIERS MEDIA SA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fmolb.2022.854170 - link do publikacji
  7. Novel N7-Arylmethyl Substituted Dinucleotide mRNA 50 cap Analogs: Synthesis and Evaluation as Modulators of Translation
    Autorzy:
    1. Wójcik R., Baranowski M., Markiewicz Ł., Kubacka D., Bednarczyk M., Baran N., Wojtczak A., Sikorski P.J., Żuberek J., Kowalska J., Jemielity J.
    Czasopismo:
    Pharmaceutics (rok: 2021, tom: 13(11), strony: 1941), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/pharmaceutics13111941 - link do publikacji
  8. 2′-O-Methylation of the second transcribed nucleotide within the mRNA 5′ cap impacts the protein production level in a cell-specific manner and contributes to RNA immune evasion
    Autorzy:
    Karolina Drazkowska, Rafal Tomecki, Marcin Warminski, Natalia Baran, Dominik Cysewski, Anaïs Depaix, Renata Kasprzyk, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity, Pawel J. Sikorski
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2022, tom: 50(16), strony: 9051–9071), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkac722 - link do publikacji
  9. Novel N7-Arylmethyl Substituted Dinucleotide mRNA 50 cap Analogs: Synthesis and Evaluation as Modulators of Translation
    Autorzy:
    1. Wójcik R., Baranowski M., Markiewicz Ł., Kubacka D., Bednarczyk M., Baran N., Wojtczak A., Sikorski P.J., Żuberek J., Kowalska J., Jemielity J.
    Czasopismo:
    Pharmaceutics (rok: 2021, tom: 13(11), strony: 1941), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/pharmaceutics13111941 - link do publikacji
  10. Stereocontrolled access to thioisosteres of nucleoside di- and triphosphates
    Autorzy:
    Hai-Jun Zhang, Michał Ociepa, Molhm Nassir, Bin Zheng, Sarah A. Lewicki, Veronica Salmaso, Helay Baburi, Jessica Nagel, Salahuddin Mirza, Beatriz Bueschbell, Haneen Al-Hroub, Olga Perzanowska, Ziqin Lin, Michael A. Schmidt, Martin D. Eastgate, Kenneth A. Jacobson, Christa E. Müller, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity & Phil S. Baran
    Czasopismo:
    Nature Chemistry (rok: 2023, tom: 16, strony: 249–258), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41557-023-01347-2 - link do publikacji
  11. Quick Access to Nucleobase-Modified Phosphoramidites for the Synthesis of Oligoribonucleotides Containing Post-Transcriptional Modifications and Epitranscriptomic Marks
    Autorzy:
    Kamil Ziemkiewicz, Marcin Warminski, Radoslaw Wojcik, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    The Journal of Organic Chemistry (rok: 2022, tom: 87 (15), strony: 10333-10348), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.joc.2c01390 - link do publikacji
  12. RNA Ligation for Mono and Dually Labeled RNAs
    Autorzy:
    Depaix A. Młynarska-Cieślak A., Warmiński M., Sikorski P.J., Jemielity J., Kowalska J.
    Czasopismo:
    Chemistry - A European Journal (rok: 2021, tom: 27, strony: 12190-12197), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/chem.202101909 - link do publikacji
  13. RNA Ligation for Mono and Dually Labeled RNAs
    Autorzy:
    Depaix A. Młynarska-Cieślak A., Warmiński M., Sikorski P.J., Jemielity J., Kowalska J.
    Czasopismo:
    Chemistry - A European Journal (rok: 2021, tom: 27, strony: 12190-12197), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/chem.202101909 - link do publikacji
  14. Trinucleotide mRNA Cap Analogue N6-Benzylated at the Site of Posttranscriptional m6Am Mark Facilitates mRNA Purification and Confers Superior Translational Properties In Vitro and In Vivo
    Autorzy:
    Marcin Warminski, Edyta Trepkowska, Miroslaw Smietanski, Pawel J. Sikorski, Marek R. Baranowski, Marcelina Bednarczyk, Hanna Kedzierska, Bartosz Majewski, Adam Mamot, Diana Papiernik, Agnieszka Popielec, Remigiusz A. Serwa, Brittany A. Shimanski, Piotr Sklepkiewicz, Marta Sklucka, Olga Sokolowska, Tomasz Spiewla, Diana Toczydlowska-Socha, Zofia Warminska, Karol Wolosewicz, Joanna Zuberek, Jeffrey S. Mugridge, Dominika Nowis*, Jakub Golab*, Jacek Jemielity*, and Joanna Kowalska*
    Czasopismo:
    J. Am. Chem. Soc. (rok: 2024, tom: 146, strony: 8149–8163), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/jacs.3c12629 - link do publikacji
  15. 1 of 1 Chemical Modifications of mRNA Ends for Therapeutic Applications
    Autorzy:
    Marcin Warminski, Adam Mamot, Anaïs Depaix, Joanna Kowalska and Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Accounts of Chemical Research (rok: 2023, tom: Volume 56 Issue 20, strony: 2814-2826), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.accounts.3c00442 - link do publikacji
  16. Preparation of RNAs with non-canonical 5′ ends using novel di- and trinucleotide reagents for co-transcriptional capping
    Autorzy:
    Anaïs Depaix, Ewa Grudzien-Nogalska, Bartlomiej Fedorczyk, Megerditch Kiledjian, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES (rok: 2022, tom: 9, strony: Article Number 854170), Wydawca: FRONTIERS MEDIA SA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fmolb.2022.854170 - link do publikacji
  17. RNA Ligation for Mono and Dually Labeled RNAs
    Autorzy:
    Depaix A. Młynarska-Cieślak A., Warmiński M., Sikorski P.J., Jemielity J., Kowalska J.
    Czasopismo:
    Chemistry - A European Journal (rok: 2021, tom: 27, strony: 12190-12197), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/chem.202101909 - link do publikacji