Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Mechanistyczne spójrzenie na specyficzność oddziaływań glikozaminoglikanów z białkami regulatorowymi

2018/31/G/ST4/00246

Słowa kluczowe:

oddziaływania białko-glikozaminoglikan specyficzność elektrostatyka mimetyka glikosaminoglikanów magnetyczny rezonans jądrowy modelowanie molekularne

Deskryptory:

  • ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa
  • ST4_13: Chemia fizyczna układów biologicznych
  • ST4_4: Struktura i architektura molekularna

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

woj. pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Sergey Samsonov 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: BEETHOVEN 3 - ogłoszony 2018-09-14

Przyznana kwota: 976 500 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2020-08-31

Zakończenie projektu: 2024-05-30

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt zakończony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (12)
  1. Role of oligosaccharide chain polarity in protein-glycosaminoglycan interactions.
    Autorzy:
    Bojarski K.K., Samsonov S.A.
    Czasopismo:
    J Chem Inf Mod (rok: 2021, tom: 61, strony: 455-466), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jcim.0c01402 - link do publikacji
  2. Molecular dynamics-based comparative analysis of chondroitin and dermatan sulfates
    Autorzy:
    Pągielska M., Samsonov S.A.
    Czasopismo:
    Biomolecules (rok: 2023, tom: 13, strony: 247), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/biom13020247 - link do publikacji
  3. Molecular dynamics-based descriptors of 3-O-Sulfated Heparan sulfate as contributors of protein binding specificity
    Autorzy:
    Danielsson A., Kogut M.M., Maszota-Zieleniak M., Chopra P., Boons G.J., Samsonov S.A.
    Czasopismo:
    Computational Biology and Chemistry (rok: 2022, tom: 99, strony: 107716), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.compbiolchem.2022.107716 - link do publikacji
  4. Biglycan Interacts with Type I Insulin-like Receptor (IGF-IR) Signaling Pathway to Regulate Osteosarcoma Cell Growth and Response to Chemotherapy
    Autorzy:
    Giatagana E-M., Berdiaki A., Gaardløs M., Samsonov S.A., Tzanakakis G.N., Nikitovic D.
    Czasopismo:
    Cancers (rok: 2022, tom: 14, strony: 1196), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/cancers14051196 - link do publikacji
  5. Investigation of hexacyanoferrate(II)/(III) charge-dependent interactions with bovine and human serum albumins
    Autorzy:
    Grabowska O., Samsonov S.A., Chmurzyński L., Wyrzykowski D., Żamojć K.
    Czasopismo:
    Spectrochimica Acta Part A (rok: 2023, tom: 293, strony: 122505), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.saa.2023.122505 - link do publikacji
  6. Rapamycin- induced autophagy in osteosarcoma cells is mediated via the biglycan/Wnt/β-catenin signaling axis
    Autorzy:
    Giatagana E-M., Berdiaki A., Gaardløs M., Tsatsakis A., Samsonov S.A., Nikitovic D.
    Czasopismo:
    American Journal of Physiology-Cell Physiology (rok: 2022, tom: 323, strony: C1740-C1756), Wydawca: American Physiological Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1152/ajpcell.00368.2022 - link do publikacji
  7. Computational modeling of the molecular basis for the calcium-dependence of the mannuronan C-5 epimerase AvAlgE6 from Azotobacter vinelandii
    Autorzy:
    Gaardløs M., Lervik A., Samsonov S.A.
    Czasopismo:
    Computational and Structural Biotechnology Journal (rok: 2023, tom: 21, strony: 2188-2196), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.csbj.2023.03.021 - link do publikacji
  8. Extension of the SUGRES-1P Coarse-Grained Model of Polysaccharides to Heparin
    Autorzy:
    Danielsson A., Samsonov S.A., Liwo A., Sieradzan A.K.
    Czasopismo:
    Journal of Chemical Theory and Computation (rok: 2023, tom: 17, strony: 6023–6036.), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jctc.3c00511 - link do publikacji
  9. The effect of Pd(II) and Pt(II) coordination on the affinity of avibactam to OXA-48 β-lactamase
    Autorzy:
    Brzeski J., Nowicka P., Samsonov S.A.
    Czasopismo:
    European Journal of Medicinal Chemistry Reports (rok: 2023, tom: 9, strony: 100118), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ejmcr.2023.100118 - link do publikacji
  10. Ligand Binding of Interleukin-8: A Comparison of Glycosaminoglycans and Acidic Peptides
    Autorzy:
    Schulze C., Danielsson A., Liwo A., Huster D., Samsonov S.A., Penk A.
    Czasopismo:
    Physical Chemistry Chemical Physics (rok: 2023, tom: 25, strony: 24930-24947), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/d3cp02457a - link do publikacji
  11. Studying specificity in protein-glycosaminoglycan recognition with umbrella sampling
    Autorzy:
    Marcicz M., Anila S., Gaardløs M., Zacharias M., Samsonov S.A.
    Czasopismo:
    Beilstein Journal of Organic Chemistry (rok: 2023, tom: 19, strony: 1933-1946), Wydawca: Beistein Institute
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3762/bjoc.19.144 - link do publikacji
  12. Detecting protein-ligand interactions with nitroxide based paramagnetic cosolutes
    Autorzy:
    Penk A., Danielsson A., Gaardløs M., Montag C., Schöler A., Huster D., Samsonov S.A., Künze G.
    Czasopismo:
    Chemistry - A European Journal (rok: 2023, tom: -, strony: e202303570), Wydawca: Wiley
    Status:
    Przyjęta do publikacji
    Doi:
    10.1002/chem.202303570 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy