Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Podejście systemowe do progresji i prognozy raka: Nowe modele i statystyki do analizy danych genomicznych

2018/29/B/ST7/02550

Słowa kluczowe:

Systemy Teoria koalescencji Przejście epitelialno-mezenchymalne Rak piersi Rak głowy i szyi Modelowanie genomu Dynamika odporności Przerzuty Rozkłady mutacji

Deskryptory:

  • ST7_12: Inne zagadnienia pokrewne
  • ST7_3: Inżynieria symulacji i modelowania
  • ST7_4: Inżynieria systemów, sensoryka, automatyka

Panel:

ST7 - Inżynieria systemów i komunikacji: elektronika, komunikacja, optoelektronika

Jednostka realizująca:

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

woj. śląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Marek Kimmel 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: OPUS 15 - ogłoszony 2018-03-15

Przyznana kwota: 1 418 100 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2019-02-25

Zakończenie projektu: 2023-08-24

Planowany czas trwania projektu: 54 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (13)
  • Publikacje książkowe (2)
  1. Heat Shock Factor 1 (HSF1) cooperates with estrogen receptor α (ERα) in the regulation of estrogen action in breast cancer cells
    Autorzy:
    1.Vydra N, Janus P, Kuś P, Stokowy T, Mrowiec K, Toma-Jonik A, Krzywon A, Cortez A, Wojtas B, Gielnewski B, Jaksik R, Kimmel M, Widlak W
    Czasopismo:
    eLife (rok: 2021, tom: 10, strony: e69843), Wydawca: eLife Sciences Publications, Ltd
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.7554/eLife.69843 - link do publikacji
  2. A general calculus of fitness landscapes finds genes under selection in cancers.
    Autorzy:
    Hsu TK, Asmussen J, Koire A, Choi BK, Gadhikar MA, Huh E, Lin CH, Konecki DM, Kim YW, Pickering CR, Kimmel M, Donehower LA, Frederick MJ, Myers JN, Katsonis P, Lichtarge O.
    Czasopismo:
    Genome Research (rok: 2022, tom: 32, strony: 916-929), Wydawca: Cold Spring Harbor Lab Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1101/gr.275811.121 - link do publikacji
  3. Genomic Analysis of SARS-CoV-2 Alpha, Beta and Delta Variants of Concern Uncovers Signatures of Neutral and Non-Neutral Evolution
    Autorzy:
    Kurpas M, Jaksik R, Kuś P, Kimmel M
    Czasopismo:
    Viruses (rok: 2022, tom: 14, strony: 2375), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/v14112375 - link do publikacji
  4. Interferon Gamma Mediates Hematopoietic StemCell Activation and Niche Relocalizationthrough BST2
    Autorzy:
    Florez M, Matatall KA, Jeong Y, Ortinau L, Shafer P, Lynch A, Jaksik R, Kimmel M, Park D, King KY
    Czasopismo:
    Cell Reports (rok: 2020, tom: 33, strony: 108530), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.celrep.2020.108530 - link do publikacji
  5. Detection and characterization of constitutive replication origins defined by DNA polymerase epsilon
    Autorzy:
    Jaksik R, Wheeler D, Kimmel M
    Czasopismo:
    BMC Biology (rok: 2023, tom: 21, strony: 41), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12915-023-01527-z - link do publikacji
  6. Alternatively spliced CSF3R isoforms in SRSF2 P95H mutated myeloid neoplasms
    Autorzy:
    Borwyn A. Wang, Hrishikesh M. Mehta, Srinivasa R. Penumutchu, Blanton S. Tolbert, Chonghui Cheng, Marek Kimmel, Torsten Haferlach, Jaroslaw P. Maciejewski & Seth J. Corey
    Czasopismo:
    Leukemia (rok: 2022, tom: 36, strony: 2499–2508), Wydawca: nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41375-022-01672-4 - link do publikacji
  7. Statistical Inference for the Evolutionary History of Cancer Genomes
    Autorzy:
    Khanh N. Dinh, Roman Jaksik, Marek Kimmel, Amaury Lambert, and Simon Tavaré
    Czasopismo:
    Statistical Science (rok: 2020, tom: 35, strony: 129–144), Wydawca: The Institute of Mathematical Statistics
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1214/19-STS7561 - link do publikacji
  8. Moran process version of the tug-of-war model: Behavior revealed by mathematical analysis and simulation studies
    Autorzy:
    Adam Bobrowski, Marek Kimmel, Monika K. Kurpas, Elżbieta Ratajczyk
    Czasopismo:
    Discrete and Continuous Dynamical Systems - B (rok: 2023, tom: 28, strony: 4532-4563), Wydawca: American Institute of Mathematical Sciences
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3934/dcdsb.2023029 - link do publikacji
  9. Modes of Selection in Tumors as Reflected by Two Mathematical Models and Site Frequency Spectra
    Autorzy:
    Kurpas M, Kimmel M
    Czasopismo:
    Frontiers in Ecology and Evolution (rok: 2022, tom: 10, strony: 889438), Wydawca: Frontiers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fevo.2022.889438 - link do publikacji
  10. Chronic infection drives Dnmt3a-loss-of-functionclonal hematopoiesis via IFNg signaling
    Autorzy:
    Agulla D, Matatall KA, Le D, Kain B, Long X, Kuś P, Jaksik R, Challen G, Kimmel M, King KY
    Czasopismo:
    Cell Stem Cell (rok: 2021, tom: S1934-5909, strony: 00108-9), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.stem.2021.03.002 - link do publikacji
  11. The origin of bladder cancer from mucosal field effects
    Autorzy:
    1.Bondaruk J, Jaksik R, Wang Z, Cogdell D, Lee S, Chen Y, Dinh K, Majewski T, Zhang L, Cao S, Tian F, Yao H, Kuś P, Chen H, Weinstein J, Navai N, Dinney C, Gao J, Theodorescu D, Logothetis C, Guo C, Wang W, McConkey D, Wei P, Kimmel M, Czerniak B
    Czasopismo:
    iScience (rok: 2022, tom: 25, strony: 104551), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.isci.2022.104551 - link do publikacji
  12. Predicting time to relapse in acute myeloid leukemia through stochastic modeling of minimal residual disease based on clonality data
    Autorzy:
    Dinh K, Jaksik R, Corey S, Kimmel M
    Czasopismo:
    Computational and Systems Oncology (rok: 2021, tom: 1, strony: e1026), Wydawca: Wiley Periodicals LLC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/cso2.1026 - link do publikacji
  13. Mathematical model predicts response to chemotherapy in advanced non-resectable non-small cell lung cancer patients treated with platinum-based doublet
    Autorzy:
    Emilia Kozłowska, Rafał Suwiński, Monika Giglok, Andrzej Świerniak, Marek Kimmel
    Czasopismo:
    PLOS Computational Biology (rok: 2020, tom: 16, strony: e1008234), Wydawca: PLOS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pcbi.1008234 - link do publikacji
  1. Tumor subclonal reconstruction pipelines - comparison of results
    Autorzy:
    Kuś Paweł, Jaksik Roman, Kimmel Marek
    Książka:
    Recent advances in computational oncology and personalized medicine (rok: 2021, tom: 1, strony: 137-147), Wydawca: Wydawnictwo Politechniki Śląskiej
    Status:
    Opublikowana
  2. Biological models' parameter estimation based on discrete measurements and adjoint sensitivity analysis
    Autorzy:
    Fujarewicz K, Łakomiec K
    Książka:
    Advanced, Contemporary Control. Advances in Intelligent Systems and Computing (rok: 2020, tom: 1196, strony: 567-578), Wydawca: Springer, Cham
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy