Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Badania oddziaływania nanorurek węglowych z telomerycznym DNA przy użyciu metod dynamiki molekularnej

2017/27/B/ST4/00108

Słowa kluczowe:

nanorurki węglowe telomer i-motif adsorpcja nośniki leków dynamika molekularna

Deskryptory:

  • ST4_5: Chemia i fizykochemia powierzchni
  • ST4_13: Chemia fizyczna układów biologicznych
  • ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Instytut Katalizy i Fizykochemii Powierzchni im. Jerzego Habera Polskiej Akademii Nauk

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Tomasz Pańczyk 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: OPUS 14 - ogłoszony 2017-09-15

Przyznana kwota: 803 240 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-06-29

Zakończenie projektu: 2021-12-28

Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Serwer obliczeniowy GPU. Za kwotę 14 589 PLN
  2. Serwery obliczeniowe. Za kwotę 80 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (8)
  1. Cytosine-rich dna fragments covalently bound to carbon nanotube as factors triggering doxorubicin release at acidic ph. A molecular dynamics study
    Autorzy:
    P. Wolski, K. Nieszporek, T. Pańczyk
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2021, tom: 22, strony: 8466), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms22168466 - link do publikacji
  2. Regulation of Water Access, Storage, Separation and Release of Drugs from the Carbon Nanotube Functionalized by Cytosine Rich DNA Fragments
    Autorzy:
    Pawel Wolski , Krzysztof Nieszporek, Tomasz Panczyk
    Czasopismo:
    Materials Science & Engineering C , Wydawca: Elsevier
    Status:
    Złożona
  3. Molecular Dynamics Study of the Interaction of Carbon Nanotubes with Telomeric DNA Fragment Containing Noncanonical G-Quadruplex and i-Motif Forms
    Autorzy:
    Tomasz Panczyk, Patrycja Wojton,Pawel Wolski
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21, strony: 1925), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms21061925 - link do publikacji
  4. Protonation of Cytosine-Rich Telomeric DNA Fragments by Carboxylated Carbon Nanotubes: Insights from Computational Studies
    Autorzy:
    P. Wojtoń, P. Wolski, K. Woliński,T. Pańczyk
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry B (rok: 2021, tom: 125, strony: 5526-5536), Wydawca: ACS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.1c01393 - link do publikacji
  5. G-Quadruplex and I-Motif Structures within the Telomeric DNA Duplex. A Molecular Dynamics Analysis of Protonation States as Factors Affecting Their Stability
    Autorzy:
    Wolski P., Nieszporek K., Panczyk T
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry B (rok: 2019, tom: 123, strony: 468-479), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.8b11547 - link do publikacji
  6. Interaction of Human Telomeric i-Motif DNA with Single-Walled Carbon Nanotubes: Insights from Molecular Dynamics Simulations
    Autorzy:
    Wolski P., Wojton P., Nieszporek K., Panczyk T.
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry B (rok: 2019, tom: 123, strony: 10343-10353), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.9b07292 - link do publikacji
  7. Carbon Nanotubes and Short Cytosine-Rich Telomeric DNA Oligomeres as Platforms for Controlled Release of Doxorubicin—A Molecular Dynamics Study
    Autorzy:
    Pawel Wolski, Krzysztof Nieszporek, Tomasz Panczyk
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21, strony: 3619), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms21103619 - link do publikacji
  8. Mechanism of unfolding and relative stabilities of G-quadruplex and I-motif noncanonical DNA structures analyzed in biased molecular dynamics simulations
    Autorzy:
    Panczyk T., Wojton P., Wolski P.
    Czasopismo:
    Biophysical Chemistry (rok: 2019, tom: 250, strony: 106173), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bpc.2019.106173 - link do publikacji