Projekty finansowane przez NCN
Udział polimorfizmu liczby kopii genów w naturalnym zróżnicowaniu odpowiedzi ekotypów Arabidopsis thaliana na stres biotyczny
2017/26/D/NZ2/01079
Słowa kluczowe:
zmienność liczby kopii DNA sekwencjonowanie nanopore biotic stress geny odporności R geny NBS-LRR ekspresja genów dawka genu
Deskryptory:
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ8_9: Genetyka populacyjna
- NZ2_7: Bioinformatyka
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk
woj. wielkopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 6
Konkurs: SONATA 13 - ogłoszony 2017-06-14
Przyznana kwota: 812 120 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2018-09-17
Zakończenie projektu: 2022-09-16
Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt zakończony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (3)
- Sekwencjonowanie nanoporowe i jego zastosowanie w biologiiAutorzy:Anastasiia Satyr, Agnieszka ŻmieńkoCzasopismo:Postępy biochemii (rok: 2020, tom: 66, strony: 193-204), Wydawca: Polskie Towarzystwo BiochemiczneStatus:OpublikowanaDoi:10.18388/pb.2020_328 - link do publikacji
- AthCNV - a map of DNA copy number variations in the Arabidopsis thaliana genomeAutorzy:Agnieszka Żmieńko, Małgorzata Marszałek-Zeńczak, Paweł Wojciechowski, Anna Samelak-Czajka, Magdalena Łuczak, Piotr Kozłowski, Wojciech M. Karłowski, Marek FiglerowiczCzasopismo:Plant Cell (rok: 2020, tom: 32, strony: 1797–1819), Wydawca: American Society of Plant Biologists (ASPB)Status:OpublikowanaDoi:10.1105/tpc.19.00640 - link do publikacji
- Analysis of Arabidopsis nonreference accessions reveals high diversity of metabolic gene clusters and discovers new candidate cluster membersAutorzy:Malgorzata Marszalek-Zenczak, Anastasiia Satyr, Pawel Wojciechowski, Michal Zenczak, Paula Sobieszczanska, Krzysztof Brzezinski, Tetiana Iefimenko, Marek Figlerowicz, Agnieszka ZmienkoCzasopismo:Frontiers in Plant Science (rok: 2023, tom: 14, strony: 1104303), Wydawca: Frontiers MediaStatus:OpublikowanaDoi:10.3389/fpls.2023.1104303 - link do publikacji