Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Analiza somatycznych mutacji w genach miRNA i w genach biogenezy miRNA w celu identyfikacji nowych celów terapii i biomarkerów chorób nowotworowych

2016/22/A/NZ2/00184

Słowa kluczowe:

miRNA głębokie sekwencjonowanie mutacje somatyczne rak płuca

Deskryptory:

  • NZ2_1: Genetyka molekularna
  • NZ2_11: Epidemiologia genetyczna
  • NZ5_5: Diagnostyka chorób człowieka

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Piotr Kozłowski 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: MAESTRO 8 - ogłoszony 2016-06-15

Przyznana kwota: 3 419 300 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2017-05-15

Zakończenie projektu: 2024-05-14

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt zakończony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (15)
  1. BRIP1, RAD51C, and RAD51D mutations are associated with high susceptibility to ovarian cancer: mutation prevalence and precise risk estimates based on a pooled analysis of ~30,000 cases
    Autorzy:
    Suszynska M, Ratajska M, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Journal of Ovarian Research (rok: 2020, tom: 13, strony: 50), Wydawca: BMC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s13048-020-00654-3 - link do publikacji
  2. CMC: Cancer miRNA Census - a list of cancer-related miRNA genes
    Autorzy:
    Suszynska M, Machowska M, FraszczykE, Michalczyk M, Philips A, Galka-Marciniak P, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2024, tom: 52, strony: 1628-1644), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkae017 - link do publikacji
  3. BARD1 is A Low/Moderate Breast Cancer Risk Gene: Evidence Based on An Association Study of the Central European p.Q564X Recurrent Mutation
    Autorzy:
    Suszynska M, Kluzniak W, Wokolorczyk D, Jakubowska A, Huzarski T, Gronwald J, Debniak T, Szwiec M, Ratajska M, Klonowska K, Narod S, Bogdanova N, Dörk T, Lubinski J, Cybulski C, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Cancers (rok: 2019, tom: 11, strony: 740), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/cancers11060740 - link do publikacji
  4. Large-scale meta-analysis of mutations identified in panels of breast/ovarian cancer-related genes - Providing evidence of cancer predisposition genes
    Autorzy:
    Suszynska M, Klonowska K, Jasinska AJ, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Gynecologic Oncology (rok: 2019, tom: 153, strony: 452-462), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ygyno.2019.01.027 - link do publikacji
  5. Somatic mutations in miRNA genes in lung cancer – potential functional consequences of non-coding sequence variants
    Autorzy:
    Galka-Marciniak P, Urbanek-Trzeciak MO, Nawrocka PM, Dutkiewicz A, Giefing M, Lewandowska MA, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Cancers (rok: 2019, tom: 11, strony: 793), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/cancers11060793 - link do publikacji
  6. A pan-cancer atlas of somatic mutations in miRNA biogenesis genes
    Autorzy:
    Galka-Marciniak P, Urbanek-Trzeciak MO, Nawrocka PM, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2021, tom: 49, strony: 601-620), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkaa1223 - link do publikacji
  7. Summary of BARD1 Mutations and Precise Estimation of Breast and Ovarian Cancer Risks Associated with the Mutations
    Autorzy:
    Suszynska M, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Genes (rok: 2020, tom: 11, strony: 798), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/genes11070798 - link do publikacji
  8. Variant Identification in BARD1, PRDM9, RCC1, and RECQL in Patients with Ovarian Cancer by Targeted Next-generation Sequencing of DNA Pools
    Autorzy:
    Suszynska M, Ratajska M, Galka-Marciniak P, Ryszkowska A, Wydra D, Debniak J, Jasiak A, Wasag D, Cybulski C, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Cancer Prevention Research (rok: 2022, tom: 15(3), strony: 151-160), Wydawca: American Association for Cancer Research
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1158/1940-6207.CAPR-21-0295 - link do publikacji
  9. Essential thrombocythaemia progression to the fibrotic phase is associated with a decrease in JAK2 and PDL1 levels
    Autorzy:
    Lewandowski K, Kandula Z, Gniot M, Paczkowska E, Nawrocka PM, Wojtaszewska M, Janowski M, Mariak M, Handschuh L, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Annals of Hematology (rok: 2022, tom: 101, strony: 2665-2667), Wydawca: Springer Link
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00277-022-05001-8 - link do publikacji
  10. Consequences of genetic variants in miRNA genes
    Autorzy:
    Machowska M, Galka-Marciniak P, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Computational and Structural Biotechnology Journal (rok: 2022, tom: 20, strony: 6443-6457), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.csbj.2022.11.036 - link do publikacji
  11. Mutations in the miR-142 gene are not common in myeloproliferative neoplasms
    Autorzy:
    Galka-Marciniak P, Kandula Z, Tire A, Wegorek W, Gwozdz-Bak K, Handschuh L, Giefing M, Lewandowski K, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2022, tom: 12(1), strony: 10924), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-022-15162-1 - link do publikacji
  12. miRMut: Annotation of mutation in miRNA genes from whole-exome or whole-genome sequencing
    Autorzy:
    Urbanek-Trzeciak MO, Kozlowski P, Galka-Marciniak P
    Czasopismo:
    STAR Protocols (rok: 2021, tom: 3 (1), strony: 101023), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.xpro.2021.101023 - link do publikacji
  13. qEva-CRISPR: a method for quantitative evaluation of CRISPR/Cas-mediated genome editing in target and off-target sites
    Autorzy:
    Dabrowska M, Czubak K, Juzwa W, Krzyzosiak WJ, Olejniczak M, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2018, tom: 46(17), strony: e101), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gky505 - link do publikacji
  14. Profile of basal cell carcinoma mutations and copy number alterations- focus on gene-associated noncoding variants
    Autorzy:
    Nawrocka PM, Galka-Marciniak P, Urbanek-Trzeciak MO, M-Thirusenthilarasan I, Szostak N, Philips A, Susok L, Sand M, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Frontiers in Oncology (rok: 2021, tom: 11, strony: 752579), Wydawca: Frontiers Media SA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fonc.2021.752579 - link do publikacji
  15. Pan-cancer analysis of somatic mutations in miRNA genes
    Autorzy:
    Urbanek-Trzeciak MO, Galka-Marciniak P, Nawrocka PM, Kowal E, Szwec S, Giefing M, Kozlowski P
    Czasopismo:
    EBioMedicine (rok: 2020, tom: 61, strony: 106031), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ebiom.2020.103051 - link do publikacji