Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Analiza somatycznych mutacji w genach miRNA i w genach biogenezy miRNA w celu identyfikacji nowych celów terapii i biomarkerów chorób nowotworowych

2016/22/A/NZ2/00184

Słowa kluczowe:

miRNA głębokie sekwencjonowanie mutacje somatyczne rak płuca

Deskryptory:

  • NZ2_1: Genetyka molekularna
  • NZ2_11: Epidemiologia genetyczna
  • NZ5_5: Diagnostyka chorób człowieka

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Piotr Kozłowski 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: MAESTRO 8 - ogłoszony 2016-06-15

Przyznana kwota: 3 419 300 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2017-05-15

Zakończenie projektu: 2024-05-14

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt zakończony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (13)
  1. Mutations in the miR-142 gene are not common in myeloproliferative neoplasms
    Autorzy:
    Gałka-Marciniak P, Kanduła Z, Tire A, Węgorek W, Gwóźdź-Bąk K, Handschuh L, Giefing M, Lewandowski K, Kozłowski P
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2022, tom: 12(1), strony: 10924), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-022-15162-1 - link do publikacji
  2. Summary of BARD1 Mutations and Precise Estimation of Breast and Ovarian Cancer Risks Associated with the Mutations
    Autorzy:
    Malwina Suszyńska, Piotr Kozłowski
    Czasopismo:
    Genes (rok: 2020, tom: 11, strony: 798), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/genes11070798 - link do publikacji
  3. Variant Identification in BARD1, PRDM9, RCC1, and RECQL in Patients with Ovarian Cancer by Targeted Next-generation Sequencing of DNA Pools
    Autorzy:
    Suszynska M, Ratajska M, Gałka-Marciniak P, Ryszkowska A, Wydra D, Debniak J, Jasiak A, Wasąg D, Cybulski C, Kozłowski P
    Czasopismo:
    Cancer Prevention Research (rok: 2022, tom: 15(3), strony: 151-160), Wydawca: American Association for Cancer Research
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1158/1940-6207.CAPR-21-0295 - link do publikacji
  4. miRMut: Annotation of mutation in miRNA genes from whole-exome or whole-genome sequencing
    Autorzy:
    Urbanek-Trzeciak MO, Kozlowski P, Galka-Marciniak P
    Czasopismo:
    STAR Protocols (rok: 2021, tom: 3 (1), strony: 101023), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.xpro.2021.101023 - link do publikacji
  5. A pan-cancer atlas of somatic mutations in miRNA biogenesis genes
    Autorzy:
    Galka-Marciniak P, Urbanek-Trzeciak MO, Nawrocka PM, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2021, tom: 49, strony: 601-620), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkaa1223 - link do publikacji
  6. Consequences of genetic variants in miRNA genes
    Autorzy:
    Machowska M, Gałka-Marciniak P, Kozłowski P
    Czasopismo:
    Computational and Structural Biotechnology Journal (rok: 2022, tom: 20, strony: 6443-6457), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.csbj.2022.11.036 - link do publikacji
  7. Somatic mutations in miRNA genes in lung cancer – potential functional consequences of non-coding sequence variants
    Autorzy:
    Paulina Gałka-Marciniak, Martyna Urbanek-Trzeciak, Paulina Nawrocka, Agata Dutkiewicz, Maciej Giefing, Marzena Lewandowska, Piotr Kozłowski
    Czasopismo:
    Cancers (rok: 2019, tom: 11, strony: 793), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/cancers11060793 - link do publikacji
  8. Large-scale meta-analysis of mutations identified in panels of breast/ovarian cancer-related genes - Providing evidence of cancer predisposition genes
    Autorzy:
    Malwina Suszyńska , Katarzyna Klonowska, Anna Jasińska, Piotr Kozłowski
    Czasopismo:
    Gynecologic Oncology (rok: 2019, tom: 153, strony: 452-462), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ygyno.2019.01.027 - link do publikacji
  9. qEva-CRISPR: a method for quantitative evaluation of CRISPR/Cas-mediated genome editing in target and off-target sites
    Autorzy:
    Magdalena Dabrowska, Karol Czubak, Wojciech Juzwa, Wlodzimierz J. Krzyzosiak, Marta Olejniczak, Piotr Kozlowski
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2018, tom: 46(17), strony: e101), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gky505 - link do publikacji
  10. BARD1 is A Low/Moderate Breast Cancer Risk Gene: Evidence Based on An Association Study of the Central European p.Q564X Recurrent Mutation
    Autorzy:
    Malwina Suszynska, W. Kluzniak, D. Wokolorczyk, A. Jakubowska, T. Huzarski, J. Gronwald, T. Debniak, M. Szwiec, M. Ratajska, K. Klonowska, S. Narod, N. Bogdanova, T. Dörk, J. Lubinski, C. Cybulski, Piotr Kozłowski
    Czasopismo:
    Cancers (rok: 2019, tom: 11, strony: 740), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/cancers11060740 - link do publikacji
  11. BRIP1, RAD51C, and RAD51D mutations are associated with high susceptibility to ovarian cancer: mutation prevalence and precise risk estimates based on a pooled analysis of ~30,000 cases
    Autorzy:
    Malwina Suszyńska, Magdalena Ratajska, Piotr Kozłowski
    Czasopismo:
    Journal of Ovarian Research (rok: 2020, tom: 13, strony: 50), Wydawca: BMC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s13048-020-00654-3 - link do publikacji
  12. Pan-cancer analysis of somatic mutations in miRNA genes
    Autorzy:
    Martyna O. Urbanek-Trzeciak, Paulina Gałka-Marciniak, Paulina M. Nawrocka, Ewelina Kowal, Sylwia Szwec, Maciej Giefing, Piotr Kozłowski
    Czasopismo:
    EBioMedicine (rok: 2020, tom: 61, strony: 106031), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ebiom.2020.103051 - link do publikacji
  13. Profile of basal cell carcinoma mutations and copy number alterations- focus on gene-associated noncoding variants
    Autorzy:
    Nawrocka PM, Galka-Marciniak P, Urbanek-Trzeciak MO, M-Thirusenthilarasan I, Szostak N, Philips A, Susok L, Sand M, Kozlowski P
    Czasopismo:
    Frontiers in Oncology (rok: 2021, tom: 11, strony: 752579), Wydawca: Frontiers Media SA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fonc.2021.752579 - link do publikacji