Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Wyjaśnienie mechanizmu i znaczenia zmian przestrzennej organizacji chromatyny zachodzących w skutek pobudzenia komórki nerwowej.

2015/18/E/NZ3/00730

Słowa kluczowe:

archtektura chromatyny epigenetyka interakcje chromatyny plastyczność neuronalna ChIA-PET

Deskryptory:

  • NZ3_5: Neurobiologia molekularna

Panel:

NZ3 - Biologia na poziomie komórki: biologia komórkowa, biologia rozwoju i starzenia, neurobiologia

Jednostka realizująca:

Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego Polskiej Akademii Nauk

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Adriana Magalska 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: SONATA BIS 5 - ogłoszony 2015-06-15

Przyznana kwota: 1 949 350 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-04-11

Zakończenie projektu: 2022-04-10

Planowany czas trwania projektu: 72 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Iinkubator do hodowli komórkowych z kontrolowanym dostępem CO2/O2. Za kwotę 60 000 PLN
  2. Komputery przenośne z oprogramowaniem dla członków zespołu. (3 szt.). Za kwotę 12 000 PLN
  3. Monitor 27 cali o wysokiej rodzielczości.
  4. Blok Grzejny z wytrząsaniem (2 szt.). Za kwotę 10 000 PLN
  5. UV Spektrofotometr Nanodrop 2000c z komputerem przenośnym do obsługi. Za kwotę 40 000 PLN
  6. Wytrząsarka kołyskowa. Za kwotę 6 000 PLN
  7. Termomikser z wytrząsarką do płytek (2 szt.). Za kwotę 10 000 PLN
  8. Stacja robocza z oprogramowaniem, monitorem i przyrządowaniem. Za kwotę 16 000 PLN
  9. Wirówka laboratoryjna (2 szt.). Za kwotę 10 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (6)
  1. Activation-induced chromatin reorganization in neurons depends on HDAC1 activity
    Autorzy:
    Agnieszka Grabowska, Hanna Sas-Nowosielska, Dagmara Holm-Kaczmarek, Elzbieta Januszewicz, Yana Yushkevich, Iwona Czaban, Pawel Trzaskoma, Katarzyna Krawczyk, Bartosz Wojtas, Bartlomiej Gielniewski, Ana Martin-Gonzalez, Robert Kuba Filipkowski, Krzysztof Hubert Olszynski, Tytus Bernas, Andrzej Antoni Szczepankiewicz, Malgorzata Alicja Sliwinska, Tambudzai Kanhema, Clive R. Bramham, Grzegorz Bokota, Dariusz Plewczynski, Grzegorz Marek Wilczynski, Adriana Magalska
    Czasopismo:
    Cell Reports (rok: 2022, tom: 38, strony: 110352), Wydawca: CellPress
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.celrep.2022.110352. - link do publikacji
  2. Long noncoding RNAs - crucial players organizing the landscape of neuronal nucleus
    Autorzy:
    Hanna Sas-Nowosielska1, Adriana Magalska
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2021, tom: 22, strony: 3478), Wydawca: MDPI Open Access Journals
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms22073478 - link do publikacji
  3. PartSeg: a tool for quantitative feature extraction from 3D microscopy images for dummies
    Autorzy:
    Bokota, G., Sroka, J., Basu, S., Das, N., Trzaskoma, P., Yushkevich, Y., Grabowska, A., Magalska, A., and Plewczynski, D.
    Czasopismo:
    BMC Bioinformatics (rok: 2021, tom: 22, strony: -), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12859-021-03984-1 - link do publikacji
  4. The interplay of seizures-induced axonal sprouting and transcription-dependent Bdnf repositioning in the model of temporal lobe epilepsy
    Autorzy:
    Skupien-Jaroszek A., Walczak A., Czaban I., Pels K.K., Szczepankiewicz A.A., Krawczyk K., Ruszczycki B., Wilczynski G.M., Dzwonek J., Magalska A.
    Czasopismo:
    PLoS ONE (rok: 2021, tom: 16, strony: 45309), Wydawca: PLOS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0239111 - link do publikacji
  5. Ultrastructural Visualization of 3D Chromatin Folding Using Serial Block-Face Scanning Electron Microscopy and In Situ Hybridization (3D-EMISH)
    Autorzy:
    Paweł Trzaskoma, Błażej Ruszczycki, Byoungkoo Lee, Katarzyna K. Pels, Katarzyna Krawczyk, Grzegorz Bokota, Andrzej A. Szczepankiewicz, Jesse Aaron, Agnieszka Walczak, Małgorzata A. Śliwińska, Adriana Magalska, Michal Kadlof, Artur Wolny, Zofia Parteka, Sebastian Arabasz, Magdalena Kiss-Arabasz, Dariusz Plewczynski, Yijun Ruan, Grzegorz M. Wilczyński
    Czasopismo:
    Nature Communication (rok: 2020, tom: 11, strony: 2120), Wydawca: Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41467-020-15987-2 - link do publikacji
  6. Nowoczesne techniki mikroskopowe w badaniach nad trójwymiarową strukturą chromatyny
    Autorzy:
    Paweł Trzaskoma, Adriana Magalska
    Czasopismo:
    KOSMOS (rok: 2019, tom: 68/1, strony: 19-33), Wydawca: POLSKIE TOWARZYSTWO PRZYRODNIKÓW IM. KOPERNIKA,
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.36921/kos.2019_2508 - link do publikacji