Projekty finansowane przez NCN
Stabilność białek w wodnych roztworach osmolitów w oparciu o komplementarne podejście eksperymentalne i teoretyczne
2013/11/B/NZ1/02258
Słowa kluczowe:
Efekt osmofobowy osmolity białka roztwory wodne spektroskopia IR dynamika molekularna obliczenia ab initio kalorymetria
Deskryptory:
- ST4_13: Chemia fizyczna układów biologicznych
- NZ2_8: Biologia obliczeniowa
- NZ1_3: Biofizyka
Panel:
NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia
Jednostka realizująca:
Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny
woj. pomorskie
Konkurs: OPUS 6 - ogłoszony 2013-09-16
Przyznana kwota: 685 940 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2014-07-10
Zakończenie projektu: 2017-07-09
Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Stacja robocza o dużej mocy obliczeniowej. Za kwotę 15 000 PLN
- Stacje robocze PC. Za kwotę 16 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (8)
- Hydration of amino acids: FTIR spectra and molecular dynamics studiesAutorzy:A. Panuszko, B. Adamczak, J. Czub, E. Gojło, J. StangretCzasopismo:Amino Acids (rok: 2015, tom: 47, strony: 2265-2278), Wydawca: Springer WienStatus:OpublikowanaDoi:10.1007/s00726-015-2005-2 - link do publikacji
- Protein thermal stabilization in aqueous solutions of osmolytesAutorzy:P. Bruździak, A. Panuszko, M. Jourdan, J. StangretCzasopismo:Acta Biochimica Polonica (rok: 2016, tom: 63, strony: 65-70), Wydawca: Polskie Towarzystwo BiochemiczneStatus:OpublikowanaDoi:10.18388/abp.2014_950 - link do publikacji
- Taurine as a water structure breaker and protein stabilizerAutorzy:P. Bruździak, A. Panuszko, E. Kaczkowska, B. Piotrowski, A. Daghir, S. Demkowicz, J. StangretCzasopismo:Amino Acids (rok: 2018, tom: 50, strony: 125-140), Wydawca: Springer WienStatus:OpublikowanaDoi:10.1007/s00726-017-2499-x - link do publikacji
- Are stabilizing osmolytes preferentially excluded from the protein surface? FTIR and MD studiesAutorzy:P. Bruździak, B. Adamczak, E. Kaczkowska, J. Czub, J. StangretCzasopismo:Physical Chemistry Chemical Physics (rok: 2015, tom: 17, strony: 23155-23164), Wydawca: Royal Society of ChemistryStatus:OpublikowanaDoi:10.1039/C5CP03065J - link do publikacji
- Effect of osmolytes on the thermal stability of proteins: replica exchange simulations of Trp-cage in urea and betaine solutionsAutorzy:B. Adamczak, M. Kogut, J. CzubCzasopismo:Physical Chemistry Chemical Physics (rok: 2018, tom: 20, strony: 11174-11182), Wydawca: Royal Society of ChemistryStatus:OpublikowanaDoi:10.1039/c7cp07436k - link do publikacji
- General Mechanism of Osmolytes' Influence on Protein Stability Irrespective of the Type of Osmolyte CosolventAutorzy:Aneta Panuszko, Piotr Bruździak, Emilia Kaczkowska, Janusz StangretCzasopismo:Journal of Physical Chemistry B (rok: 2016, tom: 120, strony: 11159-11169), Wydawca: American Chemical SocietyStatus:OpublikowanaDoi:10.1021/acs.jpcb.6b10119 - link do publikacji
- Molecular basis of the osmolyte effect on protein stability: a lesson from the mechanical unfolding of lysozymeAutorzy:Beata Adamczak, Miłosz Wieczór, Mateusz Kogut, Janusz Stangret, Jacek CzubCzasopismo:Biochemical Journal (rok: 2016, tom: 473, strony: 3705-3724), Wydawca: Portland Press LtdStatus:OpublikowanaDoi:10.1042/BCJ20160604 - link do publikacji
- Structural changes of a simple peptide—Trpzip-1—in aqueous solutions and the corresponding hydration phenomena under the influence of temperatureAutorzy:P. Bruździak, A. Panuszko, B. Piotrowski, J. StangretCzasopismo:Journal of Molecular Liquids (rok: 2019, tom: 277, strony: 532-540), Wydawca: Elsevier Science B.V.Status:OpublikowanaDoi:10.1016/j.molliq.2018.12.101 - link do publikacji