Projekty finansowane przez NCN
Zastosowanie DNase I-seq w celu identyfikacji czynników transkrypcyjnych uczestniczących w alternatywnej aktywacji mikrogleju w odpowiedzi na substancje wydzielane przez glejak.
2013/09/B/NZ2/03170
Słowa kluczowe:
mikroglej glejak C6 LPS DNase I-seq TF fingerprinting ChIP-PCR
Deskryptory:
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 5
Konkurs: OPUS 5 - ogłoszony 2013-03-15
Przyznana kwota: 605 000 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2014-02-18
Zakończenie projektu: 2017-08-17
Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (3)
- Learning Bayesian networks from datasets joining continuous and discrete variablesAutorzy:Norbert DojerCzasopismo:International Journal of Approximate Reasoning (rok: 2016, tom: 78, strony: 116-124), Wydawca: ElsevierStatus:OpublikowanaDoi:10.1016/j.ijar.2016.07.003 - link do publikacji
- Optimally choosing PWM motif databases and sequence scanning approaches based on ChIP-seq.Autorzy:Dabrowski M, Dojer N, Krystkowiak I, Kaminska B, Wilczynski B.Czasopismo:BMC Bioinformatics (rok: 2015, tom: 16, strony: 140 (14 stron)), Wydawca: BioMed Central LtdStatus:OpublikowanaDoi:10.1186/s12859-015-0573-5 - link do publikacji
- Open chromatin landscape of rat microglia upon pro-invasive or inflammatory polarizationAutorzy:Piotr Przanowski, Shamba S. Mondal, Aleksandra Cabaj, Konrad J. Dębski, Bartosz Wojtas, Bartłomiej Gielniewski, Beata Kaza, Bozena Kaminska, Michal DabrowskiCzasopismo:Glia (rok: 2019, tom: -, strony: -), Wydawca: WileyStatus:ZłożonaDoi:brak - link do publikacji