Projekty finansowane przez NCN
Nowe metody znakowania końca 5' mRNA oraz przykłady ich wykorzystania w badaniach metabolizmu RNA i poszukiwaniu inhibitorów białek rozpoznających strukturę kapu o znaczeniu terapeutycznym.
2013/09/B/ST5/01341
Słowa kluczowe:
synteza nukleotydów znaczniki fluorescencyjne chemia bioorganiczna
Deskryptory:
- ST5_16: Chemia biologiczna
- NZ1_3: Biofizyka
- ST5_11: Synteza biomateriałów
Panel:
ST5 - Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 9
Konkurs: OPUS 5 - ogłoszony 2013-03-15
Przyznana kwota: 993 000 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2014-02-14
Zakończenie projektu: 2017-02-13
Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Spektrofluorymetr z opcją odczytu fluorescencji na 96-dołkowych płytkach. Za kwotę 200 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (10)
- Amino-functionalized 5' cap analogs as tools for site-specific sequence- independent labeling of messenger RNAAutorzy:Marcin Warminski, Pawel J. Sikorski, Zofia Warminska, Maciej Lukaszewicz, Anna Kropiwnicka, Joanna Zuberek, Edward Darzynkiewicz, Joanna Kowalska, Jacek JemielityCzasopismo:Bioconjugate Chemistry (rok: 2017, tom: 28, strony: 1978-1992), Wydawca: American Chemical SocietyStatus:OpublikowanaDoi:10.1021/acs.bioconjchem.7b00291 - link do publikacji
- Applications of Phosphate Modification and Labeling to Study (m)RNA CapsAutorzy:Marcin Warminski, Pawel J. Sikorski, Joanna Kowalska, Jacek JemielityCzasopismo:Topics in Current Chemistry (rok: 2017, tom: 375, strony: Article Number: 16), Wydawca: Springer International PublishingStatus:OpublikowanaDoi:10.1007/s41061-017-0106-y - link do publikacji
- Gold-decorated polymer vessel structures as carriers of mRNA cap analogsAutorzy:Krystyna Kijewska, Paulina Głowala, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity, Katarzyna Kaczyńska, Katarzyna Janiszewska, Jarosław Stolarski, Gary J. Blanchard, Daria Kępińska, Katarzyna Lubelska, Katarzyna Wiktorska, Marcin Pisarek, Maciej MazurCzasopismo:Polymer (rok: 2015, tom: 57, strony: 77-87), Wydawca: Elsevier Ltd.Status:OpublikowanaDoi:10.1016/j.polymer.2014.12.019 - link do publikacji
- Phosphate-modified analogues of m7GTP and m7Gppppm7G – synthesis and biochemical propertiesAutorzy:Marcin Ziemniak, Joanna Kowalska, Maciej Lukaszewicz, Joanna Zuberek, Katarzyna Wnek, Edward Darzynkiewicz, Jacek JemielityCzasopismo:Bioorganic & Medicinal Chemistry 23 (2015) 5369–5381 (rok: 2015, tom: 23, strony: 5369–5381), Wydawca: PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTDStatus:OpublikowanaDoi:10.1016/j.bmc.2015.07.052 - link do publikacji
- mRNA Cap Modification through Carbamate Chemistry: Synthesis of Aminoand Carboxy-Functionalised Cap Analogues Suitable for Labelling and BioconjugationAutorzy:Marcin Warminski, Zofia Warminska, Joanna Kowalska, Jacek JemielityCzasopismo:European Journal of Organic Chemistry (rok: 2015, tom: 2015, strony: 6153-6169), Wydawca: WILEY-V C H VERLAG GMBHStatus:OpublikowanaDoi:10.1002/ejoc.201500672 - link do publikacji
- Central Regulatory Role for SIN1 in Interferon γ (IFNγ) Signaling and Generation of Biological ResponsesAutorzy:Barbara Kroczynska, Gavin T. Blyth, Robert L. Rafidi, Beata Majchrzak-Kita, Lucy Xu, Diana Saleiro, Ewa M. Kosciuczuk, Jacek Jemielity, Bing Su, Jessica K. Altman, Elizabeth A. Eklund, Eleanor H. Fish, and Leonidas C. PlataniasCzasopismo:The Journal of Biological Chemistry (rok: 2017, tom: brak, strony: brak), Wydawca: The American Society for Biochemistry and Molecular BiologyStatus:OpublikowanaDoi:10.1074/jbc.M116.757666 - link do publikacji
- Acetylpyrene-labelled 7-methylguanine nucleotides: unusual fluorescence properties and application to decapping scavenger activity monitoringAutorzy:Renata Kasprzyk, Joanna Kowalska, Zbigniew Wieczorek, Mariusz Szabelski, Ryszard Stolarski, Jacek JemielityCzasopismo:Organic & Biomolecular Chemistry (rok: 2016, tom: 14, strony: 3863-3868), Wydawca: The Royal Society of ChemistryStatus:OpublikowanaDoi:10.1039/C6OB00419A - link do publikacji
- Interferon γ (IFNγ)-Signaling via mTORC2 and Regulatory Effects in the Generation of Type II IFN Biological ResponsesAutorzy:Barbara Kroczynska, Robert L. Rafidi, Beata Majchrzak-Kita, Ewa M. Kosciuczuk, Gavin T. Blyth, Jacek Jemielity, Zofia Warminska, Diana Saleiro, Swarna Mehrotra, Ahmet Dirim Arslan, Eleanor N. Fish, Leonidas C. PlataniasCzasopismo:JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY (rok: 2016, tom: 291, strony: 2389-2396), Wydawca: AMER SOC BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOGY INCStatus:OpublikowanaDoi:10.1074/jbc.M115.664995 - link do publikacji
- Two-headed tetraphosphate cap analogs are inhibitors of the Dcp1/2 RNA decapping complexAutorzy:Marcin Ziemniak, Jeffrey S. Mugridge, Joanna Kowalska, Robert E. Rhoads, John D. Gross, Jacek JemielityCzasopismo:RNA (rok: 2016, tom: 22, strony: 518-529), Wydawca: COLD SPRING HARBOR LAB PRESSStatus:OpublikowanaDoi:10.1261/rna.055152.115 - link do publikacji
- eIF4E phosphorylation by MST1 reduces translation of a subset of mRNAs, but increases lncRNA translationAutorzy:Kyung-Won Min, Sylvia Davila, Richard W. Zealy, Lawson T. Lloyd, In Young Lee, Rumi Lee, Kyung Hye Roh, Ahjin Jung, Jacek Jemielity, Eui-Ju Choi, Jeong Ho Chang, Je-Hyun YoonCzasopismo:BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENE REGULATORY MECHANISMS (rok: 2017, tom: 1860, strony: 761-772), Wydawca: ELSEVIERStatus:OpublikowanaDoi:10.1016/j.bbagrm.2017.05.002 - link do publikacji