Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Analiza struktury i funkcji chromidów występujących w bakteriach z rodzaju Paracoccus (Alphaproteobacteria).

2013/09/B/NZ1/00133

Słowa kluczowe:

chromidy genomika ewolucja genomów bakteryjnych Paracoccus Alphaproteobacteria

Deskryptory:

  • NZ1_10: Biologia drobnoustrojów
  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ8_1: Biologia ewolucyjna

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Biologii

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Dariusz Bartosik 

Liczba wykonawców projektu: 7

Konkurs: OPUS 5 - ogłoszony 2013-03-15

Przyznana kwota: 794 400 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2014-03-13

Zakończenie projektu: 2017-12-12

Planowany czas trwania projektu: 45 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Inkubator z wytrząsaniem i z chłodzeniem (np. Excella E24R, New Brunswick). Za kwotę 60 000 PLN
  2. Komputer z opragormowaniem SeqMan Pro. Za kwotę 18 000 PLN
  3. Wirówka z chłodzeniem (n.p. Wirówka 5424R, Eppendorf). Za kwotę 17 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (7)
  • Publikacje książkowe (2)
  1. Koncepcja chromidu i jej znaczenie dla klasyfikacji pozachromosomowych replikonów bakterii.
    Autorzy:
    Czarnecki J, Bartosik D.
    Czasopismo:
    Postępy mikrobiologii (rok: 2016, tom: 55, strony: 215-223), Wydawca: Polskie Towarzystwo Mikrobiologów
    Status:
    Opublikowana
  2. Lifestyle-determining extrachromosomal replicon pAMV1 and its contribution to the carbon metabolism of the methylotrophic bacterium Paracoccus aminovorans JCM 7685.
    Autorzy:
    Czarnecki J, Dziewit L, Puzyna M, Prochwicz E, Tudek A, Wibberg D, Schlüter A, Pühler A, Bartosik D.
    Czasopismo:
    Environmental Microbiology (rok: 2017, tom: 19, strony: 4536-4550), Wydawca: Society for Applied Microbiology and John Wiley & Sons Ltd
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/1462-2920.13901 - link do publikacji
  3. Maintenance and genetic load of plasmid pKON1 of Paracoccus kondratievae, containing a highly efficient toxin-antitoxin module of the hipAB family.
    Autorzy:
    Czarnecki J, Dziewit L, Kowalski L, Ochnio M, Bartosik D.
    Czasopismo:
    Plasmid (rok: 2015, tom: -, strony: -), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.plasmid.2015.02.003 - link do publikacji
  4. Genome structure of the opportunistic pathogen Paracoccus yeei (Alphaproteobacteria) and identification of putative virulence factors
    Autorzy:
    Lasek R, Szuplewska M, Mitura M, Decewicz P, Chmielowska C, Pawłot A, Sentkowska D, Czarnecki J, Bartosik D.
    Czasopismo:
    Frontiers in Microbiology (rok: 2018, tom: 9, strony: 2553), Wydawca: Frontiers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fmicb.2018.02553 - link do publikacji
  5. Diversity of methylotrophy pathways in the genus Paracoccus (Alphaproteobacteria).
    Autorzy:
    Czarnecki J, Bartosik D.
    Czasopismo:
    Current Issues in Molecular Biology (rok: 2019, tom: Brak, strony: ), Wydawca: Horizon Scientific Press
    Status:
    Przyjęta do publikacji
  6. Characterization of the virome of Paracoccus spp. (Alphaproteobacteria) by combined in silico and in vivo approaches.
    Autorzy:
    Decewicz P, Dziewit L, Golec P, Kozlowska P, Bartosik D, Radlinska M
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: Brak, strony: Brak), Wydawca: Nature Research
    Status:
    Złożona
  7. Genome-guided insight into the methylotrophy of Paracoccus aminophilus JCM 7686
    Autorzy:
    Dziewit L, Czarnecki J, Prochwicz E, Wibberg D, Schlüter A, Pühler A, Bartosik D.
    Czasopismo:
    Frontiers in Microbiology (rok: 2015, tom: 6, strony: 852), Wydawca: Frontiers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fmicb.2015.00852 - link do publikacji
  1. Comparative analyses of extrachromosomal bacterial replicons, identification of chromids, and experimental evaluation of their indispensability.
    Autorzy:
    Dziewit L, Bartosik D.
    Książka:
    Bacterial pangenomics (rok: 2015, tom: 1231, strony: 15-29), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
  2. Diversity of methylotrophy pathways in the genus Paracoccus (Alphaproteobacteria).
    Autorzy:
    Carnecki J, Bartosik D.
    Książka:
    Methylotrophs and Methylotroph Communities (rok: 2019, ), Wydawca: Caister Academic Press
    Status:
    Przyjęta do publikacji