Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Ewolucja liczby kopii genów MHC: test hipotezy optymalności i analiza mechanizmów alternatywnych.

2013/08/A/NZ8/00153

Słowa kluczowe:

Główny kompleks zgodności tkankowej odpowiedź odpornościowa koewolucja gospodarz-pasożyt wybór partnera

Deskryptory:

  • NZ8_1: Biologia ewolucyjna

Panel:

NZ8 - Podstawy wiedzy o życiu na poziomie środowiskowym: biologia ewolucyjna, biologia populacyjna, biologia środowiskowa, systematyka

Jednostka realizująca:

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Jacek Radwan 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: MAESTRO 4 - ogłoszony 2012-12-15

Przyznana kwota: 2 282 500 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-09-26

Zakończenie projektu: 2018-09-25

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Szprzęt komputerowy z oprogramowaniem. Za kwotę 54 000 PLN
  2. Średnioprzepustowy sekwenator nowej generacji. Za kwotę 500 000 PLN
  3. zamrażarka. Za kwotę 6 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (7)
  1. De novo transcriptome assembly facilitates characterisation of fast-evolving gene families, MHC class I in the bank vole (Myodes glareolus)
    Autorzy:
    M Migalska, A Sebastian, M Konczal, P Kotlík, J Radwan
    Czasopismo:
    Heredity (rok: 2017, tom: 118, strony: 348–357), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/hdy.2016.105 - link do publikacji
  2. Major histocompatibility complex class I diversity limits repertoire of T-cell receptors
    Autorzy:
    Migalska M., Sebastian A., Radwan J.
    Czasopismo:
    PNAS (rok: 2019, tom: 116(11), strony: 5021–5026.), Wydawca: NAS USA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1073/pnas.1807864116 - link do publikacji
  3. Mating preferences can drive expansion or contraction of major histocompatibility complex gene family
    Autorzy:
    Bentkowski. P, Radwan, J.
    Czasopismo:
    Proc. R. Soc. B (rok: 2020, tom: 287, strony: 20192706), Wydawca: Royal Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1098/rspb.2019.2706 - link do publikacji
  4. Amplisas: A web server for multilocus genotyping using next-generation amplicon sequencing data
    Autorzy:
    Sebastian, A., Herdegen, M., Migalska, M., & Radwan, J.
    Czasopismo:
    Molecular Ecology Resources (rok: 2016, tom: 16, strony: 498-510), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/1755-0998.12453 - link do publikacji
  5. Testing genotyping strategies for ultra-deep sequencing of a co-amplifying gene family: MHC class I in a passerine bird
    Autorzy:
    Biedrzycka, A., Sebastian, A., Migalska, M., Westerdahl, H., & Radwan, J.
    Czasopismo:
    Molecular Ecology Resources (rok: 2017, tom: 17, strony: 642-655.), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/1755-0998.12612 - link do publikacji
  6. Profiling of the TCRβ repertoire in non-model species using high-throughput sequencing.
    Autorzy:
    Migalska, M., Sebastian, A., & Radwan, J.
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2018, tom: 8, strony: Article number: 11613), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-018-30037-0 - link do publikacji
  7. Evolution of major histocompatibility complex gene copy number
    Autorzy:
    Bentkowski, P., Radwan, J.
    Czasopismo:
    Plos Computational Biology (rok: 2019, tom: 15(5), strony: e1007015.), Wydawca: PLOS
    Status:
    Złożona
    Doi:
    10.1371/journal.pcbi.1007015 - link do publikacji