Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Całościowa adnotacja enhancerów ssaków w oparciu o dane genomowe i funkcjonalne

2012/05/B/NZ2/00567

Słowa kluczowe:

enhancer modyfikacje histonów kooperacyjne wiązania czynników transkrypcyjnych enhanceosom

Deskryptory:

  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ2_8: Biologia obliczeniowa

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Jerzy Tiuryn 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 3 - ogłoszony 2012-03-15

Przyznana kwota: 565 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-02-05

Zakończenie projektu: 2017-02-04

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. serwer obliczeniowy. Za kwotę 100 000 PLN
  2. Komputer PC lub laptop (2 szt.). Za kwotę 10 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (5)
  1. FastBill: An Improved Tool for Prediction of Cis-Regulatory Modules
    Autorzy:
    Bartosz Wilczyński, Jerzy Tiuryn
    Czasopismo:
    JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY (rok: 2016, tom: 23, strony: 45298), Wydawca: Mary Ann Liebert, Inc.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1089/cmb.2016.0108 - link do publikacji
  2. Romulus: robust multi-state identification of transcription factor binding sites from DNase-seq data
    Autorzy:
    Jankowski A, Tiuryn J, Prabhakar S.
    Czasopismo:
    Bionformatics (rok: 2016, tom: 32 (16), strony: 2419-2426), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/btw209 - link do publikacji
  3. Active enhancer position can be accrately predicted from chromatin marks and collective sequence motif data
    Autorzy:
    A. Podsiadło, M. Wrzesień, W. Paja, W. Rudnicki, B. Wilczyński
    Czasopismo:
    BMC Systems Biology (rok: 2013, tom: 7 (Suppl. 6), strony: S16), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/1752-0509-7-S6-S16 - link do publikacji
  4. Enhanceosome transcription factors preferentially dimerize with high mobility group proteins
    Autorzy:
    Aleksander Jankowski, Paulina Obara, Utsav Mathur, Jerzy Tiuryn
    Czasopismo:
    BMC Systems Biology (rok: 2016, tom: 10, strony: 3), Wydawca: BioMedCentral
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12918-016-0258-3 - link do publikacji
  5. TACO: a general-purpose tool for predicting cell-type–specific transcription factor dimers
    Autorzy:
    Aleksander Jankowski, Shyam Prabhakar, and Jerzy Tiuryn
    Czasopismo:
    BMC Genomics (rok: 2014, tom: 15, strony: 208), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/1471-2164-15-208 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy