Projekty finansowane przez NCN
Identyfikacja, analiza biogenezy i funkcji małych, regulatorowych RNA powstających z tRNA u Arabidopsis thaliana
2011/03/B/NZ2/01416
Słowa kluczowe:
regulacja eksperesji genów regulatorowe RNA tRNA Arabidopsis thaliana
Deskryptory:
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ2_7: Bioinformatyka
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Wydział Biologii
woj. wielkopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 5
Konkurs: OPUS 2 - ogłoszony 2011-09-15
Przyznana kwota: 580 300 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2012-08-13
Zakończenie projektu: 2015-08-12
Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- laptop.
- rozbudowa serwera, dysk macierzy.
- serwer obliczeniowy. Za kwotę 78 000 PLN
- stacja robocza. Za kwotę 9 600 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (4)
- mirEX 2.0 - an integrated environment for expression profiling of plant microRNAsAutorzy:Andrzej Zielezinski, Jakub Dolata, Sylwia Alaba, Katarzyna Kruszka, Andrzej Pacak, Aleksandra Swida-Barteczka, Katarzyna Knop, Agata Stepien, Dawid Bielewicz, Halina Pietrykowska, Izabela Sierocka, Lukasz Sobkowiak, Alicja Lakomiak, Artur Jarmolowski, Zofia Szweykowska-Kulinska, Wojciech M. KarlowskiCzasopismo:BMC Plant Biology (rok: 2015, tom: 15, strony: 144), Wydawca: BioMed Central LtdStatus:OpublikowanaDoi:10.1186/s12870-015-0533-2 - link do publikacji
- Early origin and adaptive evolution of the GW182 protein family, the key component of RNA silencing in animalsAutorzy:Andrzej Zielezinski, Wojciech M KarlowskiCzasopismo:RNA Journal (rok: 2015, tom: 12, strony: 761), Wydawca: RNA SocietyStatus:OpublikowanaDoi:10.1080/15476286.2015.1051302 - link do publikacji
- Integrative data analysis indicates an intrinsic disordered domain character of Argonaute-binding motifsAutorzy:Andrzej Zielezinski and Wojciech M. Karlowski*Czasopismo:Bioinformatics (rok: 2014, tom: 9, strony: 332-339), Wydawca: Oxfors JournalsStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/bioinformatics/btu666 - link do publikacji
- Arabidopsis microRNA expression regulation in a wide range of abiotic stress responsesAutorzy:Maria Barciszewska-Pacak, Kaja Milanowska, Katarzyna Knop, Dawid Bielewicz, Przemyslaw Nuc, Patrycja Plewka, Andrzej M. Pacak, Franck Vazquez, Wojciech Karlowski, Artur Jarmolowski, Zofia Szweykowska-KulinskaCzasopismo:Frontiers in Plant Science (rok: 2015, tom: 6, strony: 410), Wydawca: Frontiers Media S.A.Status:OpublikowanaDoi:10.3389/fpls.2015.00410 - link do publikacji