Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Badanie procesów wiązania ligandów oraz aktywacji receptorów GPCR formylowych, opioidowych i kanabinoidowych

2011/03/B/NZ1/03204

Słowa kluczowe:

receptory GPCR receptory formylowe receptory opioidowe receptory kanabinoidowe procesy aktywacji przełączniki molekularne.

Deskryptory:

  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
  • NZ2_8: Biologia obliczeniowa

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Sławomir Filipek 

Liczba wykonawców projektu: 7

Konkurs: OPUS 2 - ogłoszony 2011-09-15

Przyznana kwota: 506 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2012-08-27

Zakończenie projektu: 2015-08-26

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Licencja oprogramowania LigandScout. Za kwotę 15 239 PLN
  2. komputer małej mocy.
  3. Licencja oprogramowania Schrodinger. Za kwotę 12 294 PLN
  4. Wysokowydajny serwer GPU. Za kwotę 150 000 PLN
  5. Procesory Intel XEON. Za kwotę 33 148 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (9)
  1. Activation of G-protein-coupled receptors correlates with the formation of a continuous internal water pathway
    Autorzy:
    S. Yuan, S. Filipek, K. Palczewski, H. Vogel
    Czasopismo:
    Nature Communications (rok: 2014, tom: 5, strony: 4733), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/ncomms5733 - link do publikacji
  2. G Protein-Coupled Receptors – Recent Advances
    Autorzy:
    D. Latek, A. Modzelewska, B. Trzaskowski, K. Palczewski, S. Filipek
    Czasopismo:
    Acta Biochim. Pol. (rok: 2012, tom: 59, strony: 515-529), Wydawca: Polish Biochemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    http://www.actabp.pl/pdf/4_2012/515.pdf - link do publikacji
  3. Towards improved quality of GPCR models by usage of multiple templates and profile-profile comparison
    Autorzy:
    D. Latek, P. Pasznik, T. Carlomagno, S. Filipek
    Czasopismo:
    PLOS ONE (rok: 2013, tom: 8, strony: e56742), Wydawca: PLOS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0056742 - link do publikacji
  4. W246(6.48) opens a gate for a continuous intrinsic water pathway during activation of the adenosine A2A receptor
    Autorzy:
    S. Yuan, Z. Hu, S. Filipek, H. Vogel
    Czasopismo:
    Angew. Chem. Int. Ed. (rok: 2015, tom: 54, strony: 556-559), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/anie.201409679 - link do publikacji
  5. The mechanism of ligand-induced activation or inhibition of mu- and kappa-opioid receptors
    Autorzy:
    S. Yuan, K. Palczewski, Q. Peng, M. Kolinski, H. Vogel, S. Filipek
    Czasopismo:
    Angew. Chem. Int. Ed. (rok: 2015, tom: 54, strony: 7560-7563), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/anie.201501742 - link do publikacji
  6. Lipid receptor S1P1 activation scheme concluded from microsecond all-atom molecular dynamics simulations
    Autorzy:
    S. Yuan, R. Wu, D. Latek, B. Trzaskowski, S. Filipek
    Czasopismo:
    PLOS Comp. Biol. (rok: 2013, tom: 9, strony: e1003261), Wydawca: PLOS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pcbi.1003261 - link do publikacji
  7. Hydrophobic ligands entry and exit pathways of CB1 cannabinoid receptor
    Autorzy:
    J. Jakowiecki, S. Filipek
    Czasopismo:
    J. Chem. Inf. Model. (rok: 2016, tom: 56, strony: 2457-2466), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jcim.6b00499 - link do publikacji
  8. Non-peptide ligand binding to the formyl peptide receptor FPR2—A comparison to peptide ligand binding modes
    Autorzy:
    T.M. Stepniewski, S. Filipek
    Czasopismo:
    Bioorganic & Medicinal Chemistry (rok: 2015, tom: 23, strony: 4072–4081), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bmc.2015.03.062 - link do publikacji
  9. The Role of Water and Sodium Ions in the Activation of the mu-Opioid Receptor
    Autorzy:
    S. Yuan, H. Vogel, S. Filipek
    Czasopismo:
    Angew. Chem. Int. Ed. (rok: 2013, tom: 52, strony: 10112-10115), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/anie.201302244 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy