Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Określenie znaczenia nowych, potencjalnych biomarkerów opartych na miRNA w biologii i wczesnym wykrywaniu raka jajnika.

2011/02/A/NZ2/00017

Słowa kluczowe:

rak jajnika krążące miRNA osocze mutacje germinalne geny BRCA1 BRCA2 BARD1 RAD51C RAD51D

Deskryptory:

  • NZ2_1: Genetyka molekularna
  • NZ2_11: Epidemiologia genetyczna

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Gdański Uniwersytet Medyczny, Wydział Lekarski

woj. pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Janusz Limon 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: MAESTRO 1 - ogłoszony 2011-06-15

Przyznana kwota: 3 000 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2012-04-30

Zakończenie projektu: 2017-12-30

Planowany czas trwania projektu: 68 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. analizator genetyczny (sekwenator) MiSeq Illumina.
  2. po-demonstracyjny analizator genetyczny ABI PRISM 3500. Za kwotę 470 000 PLN
  3. Blok 384 do LightCyclera 480. Za kwotę 30 000 PLN
  4. oprogramowanie HGMD.
  5. licencja dostępu do bazy ALAMUT.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (10)
  1. Analysis of large mutations in BARD1 in patients with breast and/or ovarian cancer: the Polish population as an example.
    Autorzy:
    Klonowska K, Ratajska M, Czubak K, Kuzniacka A, Brozek I, Koczkowska M, Sniadecki M, Debniak J, Wydra D, Balut M, Stukan M, Zmienko A, Nowakowska B, Irminger-Finger I, Limon J, Kozlowski P.
    Czasopismo:
    Scientific reports (rok: 2015, tom: 5, strony: 10424), Wydawca: Nature group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep10424. - link do publikacji
  2. Detection of BRCA1/2 mutations in circulating tumor DNA from patients with ovarian cancer.
    Autorzy:
    Ratajska M, Koczkowska M, Żuk M, Gorczyński A, Kuźniacka A, Stukan M, Biernat W, Limon J, Wasąg B
    Czasopismo:
    Oncotarget (rok: 2017, tom: 8 (60), strony: 101325-101332), Wydawca: Impact Journals, LLC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.18632/oncotarget.20722 - link do publikacji
  3. Concurrent DNA Copy-Number Alterations and Mutations in Genes Related to Maintenance of Genome Stability in Uninvolved Mammary Glandular Tissue from Breast Cancer Patients.
    Autorzy:
    Ronowicz A, Janaszak-Jasiecka A, Skokowski J, Madanecki P, Bartoszewski R, Bałut M, Seroczyńska B, Kochan K, Bogdan A, Butkus M, Pęksa R, Ratajska M, Kuźniacka A, Wasąg B, Gucwa M, Krzyżanowski M, Jaśkiewicz J, Jankowski Z, Forsberg L, Ochocka JR, Limon J, Crowley MR, Buckley PG, Messiaen L, Dumanski JP, Piotrowski A.
    Czasopismo:
    Human Mutation (rok: 2015, tom: 36(11, strony: 1088-1099), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/humu.22845 - link do publikacji
  4. Mutational analysis of BRCA1/2 in a group of 134 consecutive ovarian cancer patients. Novel and recurrent BRCA1/2 alterations detected by next generation sequencing
    Autorzy:
    Magdalena Ratajska, Magdalena Krygier, Maciej Stukan, Alina Kuźniacka, Magdalena Koczkowska, Mirosław Dudziak, Marcin Śniadecki, Jarosław Dębniak, Dariusz Wydra, Izabela Brozek, Wojciech Biernat, Ake Borg, Janusz Limon, Bartosz Wasąg
    Czasopismo:
    J Appl Genetics (rok: 2014, tom: online, strony: online), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s13353-014-0254-5 - link do publikacji
  5. A novel splicing mutation in the SLC9A3R1 gene in tumors from ovarian cancer patients.
    Autorzy:
    Kreimann EL, Ratajska M, Kuzniacka A, Demacopulo B, Stukan M, Limon J.
    Czasopismo:
    Oncology Letters (rok: 2015, tom: 10(6), strony: 3722-3726), Wydawca: Spandidos publications
    Status:
    Opublikowana
  6. Bayesian multilevel model of micro RNA levels in ovarian-cancer and healthy subjects.
    Autorzy:
    Wiczling P, EmiliaDaghir-Wojtkowiak E, Kaliszan R, Markuszewski M, Limon J, Koczkowska M, Stukan M,Kuźniacka A, Ratajska M
    Czasopismo:
    PLOS ONE (rok: 2019, tom: 14(8), strony: e0221764), Wydawca: PLOS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0221764 - link do publikacji
  7. Antagonizing functions of BARD1 and its alternatively spliced variant BARD1δ in telomere stability.
    Autorzy:
    Pilyugin M, André PA, Ratajska M, Kuzniacka A, Limon J, Tournier BB, Colas J, Laurent G, Irminger-Finger I.
    Czasopismo:
    Oncotarget (rok: 2017, tom: 8, strony: 9339-9353), Wydawca: Impact Journals, LLC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.18632/oncotarget.14068 - link do publikacji
  8. Spectrum and Prevalence of Pathogenic Variants in Ovarian Cancer Susceptibility Genes in a Group of 333 Patients
    Autorzy:
    Koczkowska M, Krawczynska N, Stukan M, Kuzniacka A, Brozek I, Sniadecki M, Debniak J, Wydra D, Biernat W, Kozlowski P, Limon J, Wasag B, Ratajska M
    Czasopismo:
    Cancers (rok: 2018, tom: 10(11), strony: E442), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/cancers10110442 - link do publikacji
  9. Cancer predisposing BARD1 mutations affect exon skipping and are associated with overexpression of specific BARD1 isoforms.
    Autorzy:
    Ratajska M, Matusiak M, Kuzniacka A, Wasag B, Brozek I, Biernat W, Koczkowska M, Debniak J, Sniadecki M, Kozlowski P, Klonowska K, Pilyugin M, Wydra D, Laurent G, Limon J, Irminger-Finger I.
    Czasopismo:
    Oncology Reports (rok: 2015, tom: 34(5), strony: 2609-2617), Wydawca: Spandidos publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3892/or.2015.4235. - link do publikacji
  10. Prevalence of the BLM nonsense mutation, p.Q548X, in ovarian cancer patients from Central and Eastern Europe.
    Autorzy:
    Bogdanova N1, Togo AV, Ratajska M, Kluźniak W, Takhirova Z, Tarp T, Prokofyeva D, Bermisheva M, Yanus GA, Gorodnova TV, Sokolenko AP, Kuźniacka A, Podolak A, Stukan M, Wokołorczyk D, Gronwald J, Vasilevska D, Rudaitis V, Runnebaum IB, Dürst M, Park-Simon TW, Hillemanns P, Antonenkova N, Khusnutdinova E, Limon J, Lubinski J, Cybulski C, Imyanitov E, Dörk T.
    Czasopismo:
    Fam Cancer. (rok: 2014, tom: online, strony: online), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10689-014-9748-x - link do publikacji