Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Globalna analiza regulatorowych miejsc RNA rozpoznawanych przez czynnik splicingowy MBNL1 - Implikacje dla patomechanizmu dystrofii miotonicznej

2011/01/B/NZ1/01603

Słowa kluczowe:

głębokie sekwencjonowanie alternatywny splicing struktura RNA dystrofia miotoniczna powtórzenia CUG MBNL1

Deskryptory:

  • NZ1_1: Biologia molekularna
  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Wydział Biologii

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Krzysztof Sobczak 

Liczba wykonawców projektu: 7

Konkurs: OPUS 1 - ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota: 654 380 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2011-12-21

Zakończenie projektu: 2015-06-20

Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Kuchenka mikrofalowa. Za kwotę 500 PLN
  2. Termoblok do probówek Eppendorf. Za kwotę 5 000 PLN
  3. Termocykler. Za kwotę 35 000 PLN
  4. Zestaw do analizy kwasów nukleinowych (aparaty do elektroforezy z zasilaczami). Za kwotę 17 000 PLN
  5. Zestaw pipet automatycznych (3 szt.). Za kwotę 5 000 PLN
  6. Pompa próżniowa. Za kwotę 3 500 PLN
  7. Miniwirówki i worteksy. Za kwotę 6 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (8)
  1. Small molecule kinase inhibitors alleviate different molecular features of myotonic dystrophy type 1.
    Autorzy:
    Wojciechowska M, Taylor K, Sobczak K, Napierala M, Krzyzosiak WJ
    Czasopismo:
    RNA Biology (rok: 2014, tom: 11, strony: 742-54), Wydawca: Landes Bioscience
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4161/rna.28799 - link do publikacji
  2. Oral administration of erythromycin reduces RNA toxicity in myotonic dystrophy
    Autorzy:
    Masayuki Nakamori, Katarzyna Taylor, Hideki Mochizuki, Krzysztof Sobczak, Masanori P. Takahashi
    Czasopismo:
    Annals of Clinical and Translational Neurology (rok: 2016, tom: 3, strony: 42–54), Wydawca: American Neurological Association
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/acn3.271 - link do publikacji
  3. Short antisense-locked nucleic acids (all-LNAs) correct alternative splicing abnormalities in myotonic dystrophy
    Autorzy:
    Wojtkowiak-Szlachcic A, Taylor K, Stepniak-Konieczna E, Sznajder LJ, Mykowska A, Sroka J, Thornton CA, Sobczak K
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2015, tom: 43, strony: 3318-3331), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkv163 - link do publikacji
  4. Loss of MBNL leads to disruption of developmentally regulated alternative polyadenylation in RNA-mediated disease.
    Autorzy:
    Batra R, Charizanis K, Manchanda M, Mohan A, Li M, Finn DJ, Goodwin M, Zhang C, Sobczak K, Thornton CA, Swanson MS.
    Czasopismo:
    Molecular Cell (rok: 2014, tom: 56, strony: 311-22), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.molcel.2014.08.027 - link do publikacji
  5. Mechanistic Determinants of MBNL Activity
    Autorzy:
    Łukasz J. Sznajder, Michał Michalak, Michał Kabza, Katarzyna Taylor, Piotr Cywoniuk, Agnieszka Wojtkowiak-Szlachcic, Magdalena Matloka, Patryk Konieczny, Krzysztof Sobczak
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research , Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Złożona
  6. Dystrofia miotoniczna - patomechanizm molekularny i strategie terapeutyczne
    Autorzy:
    Arkadiusz Kajdasz, Krzysztof Sobczak
    Czasopismo:
    Postępy Biologii Komórki (rok: 2016, tom: 43, strony: 27-52), Wydawca: Polskie Towarzystwo Anatomiczne i Polskie Towarzystwo Biologii Komórki
    Status:
    Opublikowana
  7. MBNL proteins and their target RNAs, interaction and splicing regulation.
    Autorzy:
    Konieczny P, Stepniak-Konieczna E, Sobczak K.
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2014, tom: 42, strony: 10873-87), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gku767 - link do publikacji
  8. Autoregulation of MBNL1 by binding to its transcript
    Autorzy:
    Patryk Konieczny, Katarzyna Taylor, Lukasz J. Sznajder and Krzysztof Sobczak
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2015, ), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Złożona