Projekty finansowane przez NCN
Analiza podatnościowa narzędziem do opracowania polaryzowalnych pól siłowych
2011/01/B/ST4/00636
Słowa kluczowe:
dynamika molekularna analiza podatnościowa rozkładu ładunku polaryzowalne pola siłowe podatności molekularne
Deskryptory:
- ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa
Panel:
ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Jagielloński, Wydział Chemii
woj. małopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 4
Konkurs: OPUS 1 - ogłoszony 2011-03-15
Przyznana kwota: 263 000 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2011-12-01
Zakończenie projektu: 2014-11-30
Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Licencja na oprogramowanie SCIGRESS i ADMEWORKS ModelBuilder; Licencja na oprogramowanie AMBER 12; Licencja na oprogramowanie AIMAll (tworzenie modeli QSAR) ; Licencja na oprogramowanie Tremolo X (pole siłowe AMBER); Przy ostatecznym wyborze pakietów do obliczeń MD kierowaliśmy się dostępnością polaryzowalnych pól siłowych. Związane jest to z koniecznością porównania wyników naszych polaryzowalnych pól siłowych z wynikami otrzymanymi innymi metodami.. Za kwotę 55 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (7)
- Bond Detectors for Molecular Dynamics Simulations: Part I - Hydrogen BondsAutorzy:A. Stachowicz, J. KorchowiecCzasopismo:Journal of Computational Chemistry (rok: 2013, tom: 34, strony: 2261-2269), Wydawca: WileyStatus:OpublikowanaDoi:10.1002/jcc.23385 - link do publikacji
- Intermediate Electrostatic Field for the Accurate Calculation of Generalized Elongation MethodAutorzy:K. Liu, J. Korchowiec, Y. AokiCzasopismo:ChemPhysChem (rok: 2014, tom: nie dotyczy, strony: niedotyczy), Wydawca: Wiley-WCHStatus:ZłożonaDoi:nie - link do publikacji
- Generalized Charge Sensitivity AnalysisAutorzy:A. Stachowicz, J. KorchowiecCzasopismo:Structural Chemistry (rok: 2012, tom: 23, strony: 1449-1458), Wydawca: SpringerStatus:OpublikowanaDoi:10.1007/s11224-012-0054-7 - link do publikacji
- Intermediate electrostatic field for the elongation methodAutorzy:P. Kuzniarowicz, K. Liu, Y. Aoki, F.L. Gu, A. Stachowicz, J. KorchowiecCzasopismo:Journal of Molecular Modeling (rok: 2014, tom: 20, strony: 2277-), Wydawca: SpringerStatus:OpublikowanaDoi:10.1007/s00894-014-2277-6 - link do publikacji
- Charge Sensitivity Approach to Mutual Polarization of Reactants: Molecular Mechanics PerspectiveAutorzy:A. Stachowicz, M. Rogalski, J. KorchowiecCzasopismo:Journal of Molecular Modeling (rok: 2013, tom: 19, strony: 4163-4172), Wydawca: SpringerStatus:OpublikowanaDoi:10.1007/s00894-013-1757-4 - link do publikacji
- Atomic Polarization Justified Fukui Indices and the Affinity Indicators in Aromatic Heterocycles and NucleobasesAutorzy:W. Beker, A. Stachowicz-Kuśnierz, J. Zaklika, A. Ziobro, P. Ordon, L. KomorowskiCzasopismo:J. Chem. Phys. A (rok: 2014, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: ACSStatus:ZłożonaDoi:nie - link do publikacji
- Nucleophilic Properties of Purine Bases: Inherent Reactivity vs. Reaction Conditions. A DFT Study.Autorzy:A. Stachowicz, J. KorchowiecCzasopismo:Structural Chemistry (rok: 2014, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: SpringerStatus:ZłożonaDoi:nie - link do publikacji