Projekty finansowane przez NCN
Synteza i charakteryzacja nowych sond molekularnych do monitorowania aktywności enzymów związanych z dekapingiem RNA w żywych komórkach
2018/31/B/ST5/03821
Słowa kluczowe:
dekaping RNA degradacja sondy fluorescencyjne synteza nukleotydów analogi nukleotydów mRNA cap
Deskryptory:
- ST5_16: Chemia biologiczna
- ST5_23: Chemia organiczna
- NZ1_3: Biofizyka
Panel:
ST5 - Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Warszawski, Wydział Fizyki
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 6
Konkurs: OPUS 16 - ogłoszony 2018-09-14
Przyznana kwota: 1 654 400 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2019-07-01
Zakończenie projektu: 2024-07-25
Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt zakończony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (10)
- Fluorescence-Based Activity Screening Assay Reveals Small Molecule Inhibitors of Vaccinia Virus mRNA Decapping Enzyme D9Autorzy:Marcelina Bednarczyk, Jessica K. Peters, Renata Kasprzyk, Jagoda Starek, Marcin Warminski, Tomasz Spiewla, Jeffrey S. Mugridge, John D. Gross, Jacek Jemielity, Joanna KowalskaCzasopismo:ACS CHEMICAL BIOLOGY (rok: 2022, tom: 17, strony: 1460−1471), Wydawca: American Chemical SocietyStatus:OpublikowanaDoi:10.1021/acschembio.2c00049 - link do publikacji
- 5′-fluoro(di)phosphate-labeled oligonucleotides are versatile molecular probes for studying nucleic acid secondary structure and interactions by 19F NMRAutorzy:Marek R. Baranowski, Marcin Warmiński, Jacek Jemielity, Joanna KowalskaCzasopismo:Nucleic Acids Research (rok: 2020, tom: 48, strony: 8209–8224), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/nar/gkaa470 - link do publikacji
- Chemical Modifications of mRNA Ends for Therapeutic ApplicationsAutorzy:Marcin Warminski, Adam Mamot, Anaïs Depaix, Joanna Kowalska and Jacek JemielityCzasopismo:Accounts of Chemical Research (rok: 2023, tom: 56, strony: 2814-2826), Wydawca: American Chemical SocietyStatus:OpublikowanaDoi:10.1021/acs.accounts.3c00442 - link do publikacji
- Substrate-Based Design of Cytosolic Nucleotidase IIIB Inhibitors and Structural Insights into Inhibition MechanismAutorzy:Dorota Kubacka, Mateusz Kozarski, Marek R. Baranowski, Radoslaw Wojcik , Joanna Panecka-Hofman, Dominika Strzelecka , Jerome Basquin , Jacek Jemielity, Joanna KowalskaCzasopismo:Pharmaceuticals (rok: 2022, tom: 15(5), strony: 554), Wydawca: MDPIStatus:OpublikowanaDoi:10.3390/ph15050554 - link do publikacji
- Chemically Modified Poly(A) Analogs Targeting PABP: Structure Activity Relationship and Translation Inhibitory PropertiesAutorzy:Olga Perzanowska, Miroslaw Smietanski, Jacek Jemielity, Joanna KowalskaCzasopismo:Chemistry—A European Journal (rok: 2022, tom: 28, strony: e202201115), Wydawca: Wiley-VCH GmbHStatus:OpublikowanaDoi:10.1002/chem.202201115 - link do publikacji
- Towards superior mRNA caps accessible by click chemistry: synthesis and translational properties of triazole-bearing oligonucleotide cap analogsAutorzy:Mateusz Kozarski, Karolina Drazkowska, Marcelina Bednarczyk, MarcinWarminski, JacekJemielity, Joanna KowalskaCzasopismo:RSC Advances (rok: 2023, tom: 13, strony: 12809–12824), Wydawca: Royal Society of ChemistryStatus:OpublikowanaDoi:10.1039/d3ra00026e - link do publikacji
- Trinucleotide mRNA Cap Analogue N6-Benzylated at the Site of Posttranscriptional m6Am Mark Facilitates mRNA Purification and Confers Superior Translational Properties In Vitro and In VivoAutorzy:Marcin Warminski, Edyta Trepkowska, Miroslaw Smietanski, Pawel J. Sikorski, Marek R. Baranowski, Marcelina Bednarczyk, Hanna Kedzierska, Bartosz Majewski, Adam Mamot, Diana Papiernik, Agnieszka Popielec, Remigiusz A. Serwa, Brittany A. Shimanski, Piotr Sklepkiewicz, Marta Sklucka, Olga Sokolowska, Tomasz Spiewla, Diana Toczydlowska-Socha, Zofia Warminska, Karol Wolosewicz, Joanna Zuberek, Jeffrey S. Mugridge, Dominika Nowis, Jakub Golab, Jacek Jemielity, and Joanna KowalskaCzasopismo:Journal of the American Chemical Society (rok: 2024, tom: brak, strony: brak), Wydawca: American Chemical SocietyStatus:OpublikowanaDoi:10.1021/jacs.3c12629 - link do publikacji
- Biomolecular condensates amplify mRNA decapping by biasing enzyme conformationAutorzy:Tibble R.W., Depaix A., Kowalska J., Jemielity J., J.D. GrossCzasopismo:Nature Chemical Biology (rok: 2021, tom: 17, strony: 615-623), Wydawca: Nature Publishing GroupStatus:OpublikowanaDoi:10.1038/s41589-021-00774-x - link do publikacji
- Cellular delivery of dinucleotides by conjugation with small molecules: targeting translation initiation for anticancer applicationsAutorzy:9.Kleczewska N., Sikorski P.J., Warmińska Z., Markiewicz Ł., Kasprzyk R., Baran N., Kwapiszewska K., Karpińska A., Michalski J., Hołyst R., Kowalska J., Jemielity J.Czasopismo:Chemical Science (rok: 2021, tom: 12, strony: 10242-10251), Wydawca: Royal Society of ChemistryStatus:OpublikowanaDoi:10.1039/D1SC02143E - link do publikacji
- Ethylenediamine derivatives efficiently react with oxidized RNA 3′ ends providing access to mono and dually labelled RNA probes for enzymatic assays and in vivo translationAutorzy:Mamot A., Sikorski P.J., Siekierska A., de Witte P., Kowalska J., Jemielity J.Czasopismo:Nucleic Acids Research (rok: 2021, tom: 50, strony: Page e3), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/nar/gkab867 - link do publikacji