Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Produkty szlaków demetylacji i deaminacji DNA jako nowe biomarkery rozwoju i predyktory efektów leczenia ostrych białaczek.

2015/19/B/NZ5/02208

Słowa kluczowe:

epigenetyka aktywna demetylacja DNA deaminacja DNA ostra białaczka limfoblastyczna ostra białaczka szpikowa biomarkers

Deskryptory:

  • NZ5_3: Patogeneza chorób człowieka
  • NZ5_5: Diagnostyka chorób człowieka
  • NZ1_2: Biochemia

Panel:

NZ5 - Choroby niezakaźne ludzi i zwierząt: przyczyny, mechanizmy, rozpoznawanie i leczenie chorób, zatruć i urazów

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu, Collegium Medicum im. Ludwika Rydygiera w Bydgoszczy; Wydział Farmaceutyczny

woj. kujawsko-pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Daniel Stefan Gackowski 

Liczba wykonawców projektu: 16

Konkurs: OPUS 10 - ogłoszony 2015-09-15

Przyznana kwota: 1 575 920 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-07-11

Zakończenie projektu: 2021-07-10

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Aparat do izolacji DNA. Za kwotę 120 000 PLN
  2. Komputery stacjonarne i przenośne z oprogramowaniem (2 szt.). Za kwotę 12 000 PLN
  3. Magnetyczny separator komórek. Za kwotę 5 912 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (4)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (5)
  • Publikacje książkowe (2)
  1. 5-Formylcytosine and 5-hydroxymethyluracil as surrogate markers of TET2 and SF3B1 mutations in myelodysplastic syndrome, respectively
    Autorzy:
    Daniel Gackowski, Maciej Gawroński, C. Kerr, T. Radivoyevitch, Ewelina Zarakowska, Marta Starczak, Abdulkadir Abakir, Alexey Ruzow, Jaroslaw P. Maciejewski, Ryszard Olińsk
    Czasopismo:
    Haematologica (rok: 2020, tom: 105 (5), strony: 45661), Wydawca: Ferrata Storti Foundation
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3324/haematol.2019.224030 - link do publikacji
  2. Diagnostic and prognostic power of active DNA demethylation pathway intermediates in acute myelogenous leukemia and myelodysplastic syndromes
    Autorzy:
    Aleksandra Skalska-Bugala, Marta Starczak, Łukasz Szukalski, Maciej Gawronski, Agnieszka Siomek-Gorecka, Justyna Szpotan, Anna Labejszo, Ewelina Zarakowska1, Anna Szpila, Anna Jachalska, Adriana Szukalska, Marcin Kruszewski, Anna Sadowska, Aleksandra Wasilow, Patrycja Baginska, Jaroslaw Czyz, Ryszard Olinski, Rafal Rozalski, Daniel Gackowski
    Czasopismo:
    Cells (rok: 2022, tom: 11, strony: 888), Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/cells11050888 - link do publikacji
  3. The urinary excretion of epigenetically modified DNA as a marker of pediatric ALL status and chemotherapy response
    Autorzy:
    Rafal Rozalski, Daniel Gackowski, Aleksandra Skalska-Bugała, Marta Starczak, Agnieszka Siomek-Gorecka, Ewelina Zarakowska, Martyna Modrzejewska, Tomasz Dziaman, Anna Szpila, Kinga Linowiecka, Jolanta Guz1, Justyna Szpotan, Maciej Gawronski, Anna Labejszo, Lidia Gackowska, Marek Foksinski, Elwira Olinska,, Aleksandra Wasilow, Andrzej Koltan, Jan Styczynski & Ryszard Olinski
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2021, tom: 11, strony: 21345), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-021-00880-9 - link do publikacji
  4. Profiles of a broad spectrum of epigenetic DNA modifications in normal and malignant human cell lines: Proliferation rate is not the major factor responsible for the 5- hydroxymethyl-20-deoxycytidine level in cultured cancerous cell lines
    Autorzy:
    Marek Foksinski, Ewelina Zarakowska, Daniel Gackowski, Magdalena Skonieczna, Karolina Gajda, Dorota Hudy, Anna Szpila, Karol Bialkowski, Marta Starczak, Anna Labejszo, Jaroslaw Czyz, Joanna Rzeszowska-Wolny, Ryszard Olinski
    Czasopismo:
    PLOS ONE (rok: 2017, tom: 12(11), strony: e0188856), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0188856 - link do publikacji
  1. Relationship between the levels of epigenetic DNA modifications, 2-oxoglutarate and 2-hydroxyglutarates in acute leukemias.
    Autorzy:
    Justyna Szpotan, Martyna Modrzejewska, Kinga Linowiecka, Ewelina Zarakowska, Anna Szpila, Agnieszka Siomek-Górecka, Marta Starczak, Maciej Gawroński, Anna Łabejszo, Marek Foksiński, Jarosław Czyż, Andrzej Kołtan, Jan Styczyński, G. Charliński, Daniel Gackowski.
    Konferencja:
    43rd FEBS Congress Biochemistry forever 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: FEBS Open Bio (FEBS Press and John Wiley & Sons)
    Data:
    konferencja 7-12 July 2018
    Status:
    Opublikowana
  2. The enzymes involved in active DNA demethylation as a potential biomarkers in B-cell acute lymphoblastic leukemia and chronic lymphocytic leukemia.
    Autorzy:
    Anna Łabejszo, Lidia Gackowska, Anna Helmin-Basa, Izabela Kubiszewska, Andrzej Kołtan, Jan Styczyński, Jarosław Czyż, Daniel Gackowski.
    Konferencja:
    ESCCA 2018: At the shore of future cytometry. (rok: 2018, ), Wydawca: Cytometry Part B (Clinical Cytometry); ESCCA and John Wiley & Sons
    Data:
    konferencja 13-15 September 2018
    Status:
    Opublikowana
  3. Vitamin C restores TET proteins activity in leukemic cells.
    Autorzy:
    Maciej Gawroński, Marta Starczak, Anna Łabejszo, Martyna Modrzejewska, Daniel Gackowski.
    Konferencja:
    43rd FEBS Congress Biochemistry forever 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: FEBS Open Bio (FEBS Press and John Wiley & Sons)
    Data:
    konferencja 7-12 July 2018
    Status:
    Opublikowana
  4. Assessment of pathway of active DNA demethylation in myelodysplastic syndrome
    Autorzy:
    Kinga Linowiecka, Jolanta Guz, Tomasz Dziaman, Justyna Szpotan, Martyna Modrzejewska, Marta Starczak, Maciej Gawroński, Anna Łabejszo, Marek Foksiński, Jarosław Czyż, Andrzej Kołtan, Jan Styczyński, G. Charliński, Daniel Gackowski.
    Konferencja:
    43rd FEBS Congress Biochemistry forever 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: FEBS Open Bio (FEBS Press and John Wiley & Sons)
    Data:
    konferencja 7-12 July 2018
    Status:
    Opublikowana
  5. Assessment of active DNA demethylation pathway during chemotherapy of acute myeloid leukemia
    Autorzy:
    Anna Łabejszo, Marta Starczak, Lidia Gackowska, Martyna Modrzejewska, Justyna Szpotan, Maciej Gawroński, Andrzej Kołtan, G. Charliński, Jarosław Czyż, Jan Styczyński, Daniel Gackowski.
    Konferencja:
    43rd FEBS Congress Biochemistry forever 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: FEBS Open Bio (FEBS Press and John Wiley & Sons)
    Data:
    konferencja 7-12 July 2018
    Status:
    Opublikowana
  1. Preparation of internal standards for 2D-UPLC-MS/MS quantification of noncanonical DNA bases
    Autorzy:
    Starczak Marta, Skalska Aleksandra, Różalski Rafał, Oliński Ryszard, Gackowski Daniel
    Książka:
    Methods in molecular biology: DNA modifications: methods and protocols. (rok: 2021, tom: 2198, strony: 123-136), Wydawca: Humana Press, Springer US
    Status:
    Opublikowana
  2. Quantification of DNA modifications using two-dimensional ultraperformance liquid chromatography tendem mass spectrometry (2D-UPLC-MS/MS).
    Autorzy:
    Marta Starczak, Maciej Gawronski, Ryszard Olinski, and Daniel Gackowski
    Książka:
    Methods in molecular biology: DNA modifications: methods and protocols. (rok: 2021, tom: 2198, strony: 91-108), Wydawca: Humana Press, Springer US
    Status:
    Opublikowana