Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Produkty szlaków demetylacji i deaminacji DNA jako nowe biomarkery rozwoju i predyktory efektów leczenia ostrych białaczek.

2015/19/B/NZ5/02208

Słowa kluczowe:

epigenetyka aktywna demetylacja DNA deaminacja DNA ostra białaczka limfoblastyczna ostra białaczka szpikowa biomarkers

Deskryptory:

  • NZ5_3: Patogeneza chorób człowieka
  • NZ5_5: Diagnostyka chorób człowieka
  • NZ1_2: Biochemia

Panel:

NZ5 - Choroby niezakaźne ludzi i zwierząt: przyczyny, mechanizmy, rozpoznawanie i leczenie chorób, zatruć i urazów

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Mikołaja Kopernika, Collegium Medicum im. Ludwika Rydygiera w Bydgoszczy, Wydział Farmaceutyczny

woj. kujawsko-pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Daniel Gackowski 

Liczba wykonawców projektu: 16

Konkurs: OPUS 10 - ogłoszony 2015-09-15

Przyznana kwota: 1 575 920 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-07-01

Zakończenie projektu: 2021-07-10

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Aparat do izolacji DNA. Za kwotę 120 000 PLN
  2. Komputery stacjonarne i przenośne z oprogramowaniem (2 szt.). Za kwotę 12 000 PLN
  3. Magnetyczny separator komórek. Za kwotę 5 912 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (5)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (7)
  • Publikacje książkowe (3)
  1. Context dependent effects of ascorbic acid treatment in TET2 mutant myeloid neoplasia
    Autorzy:
    Yihong Guan, Edward F. Greenberg, Metis Hasipek, Shi Chen, Xiaochen Liu, Cassandra M. Kerr, Daniel Gackowski, Ewelina Zarakowska, Tomas Radivoyevitch, Xiaorong Gu, Belinda Willard, Valeria Visconte, Hideki Makishima, Aziz Nazha, Mridul Mukherji, Mikkael A. Sekeres, Yogen Saunthararajah, Ryszard Oliński, Mingjiang Xu, Jaroslaw P. Maciejewski & Babal K. Jha
    Czasopismo:
    Communications Biology (rok: 2020, tom: 3, strony: 493), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s42003-020-01220-9 - link do publikacji
  2. Profiles of a broad spectrum of epigenetic DNA modifications in normal and malignant human cell lines: Proliferation rate is not the major factor responsible for the 5- hydroxymethyl-20-deoxycytidine level in cultured cancerous cell lines
    Autorzy:
    Marek Foksinski, Ewelina Zarakowska, Daniel Gackowski, Magdalena Skonieczna, Karolina Gajda, Dorota Hudy, Anna Szpila, Karol Bialkowski, Marta Starczak, Anna Labejszo, Jaroslaw Czyz, Joanna Rzeszowska-Wolny, Ryszard Olinski
    Czasopismo:
    PLOS ONE (rok: 2017, tom: 12(11), strony: e0188856), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0188856 - link do publikacji
  3. Diagnostic and prognostic power of active DNA demethylation pathway intermediates in acute myelogenous leukemia and myelodysplastic syndromes
    Autorzy:
    Aleksandra Skalska-Bugala, Marta Starczak, Łukasz Szukalski, Maciej Gawronski, Agnieszka Siomek-Gorecka, Justyna Szpotan, Anna Labejszo, Ewelina Zarakowska1, Anna Szpila, Anna Jachalska, Adriana Szukalska, Marcin Kruszewski, Anna Sadowska, Aleksandra Wasilow, Patrycja Baginska, Jaroslaw Czyz, Ryszard Olinski, Rafal Rozalski, Daniel Gackowski
    Czasopismo:
    Cells (rok: 2022, tom: 11, strony: 888), Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/cells11050888 - link do publikacji
  4. The urinary excretion of epigenetically modified DNA as a marker of pediatric ALL status and chemotherapy response
    Autorzy:
    Rafal Rozalski, Daniel Gackowski, Aleksandra Skalska-Bugała, Marta Starczak, Agnieszka Siomek-Gorecka, Ewelina Zarakowska, Martyna Modrzejewska, Tomasz Dziaman, Anna Szpila, Kinga Linowiecka, Jolanta Guz1, Justyna Szpotan, Maciej Gawronski, Anna Labejszo, Lidia Gackowska, Marek Foksinski, Elwira Olinska,, Aleksandra Wasilow, Andrzej Koltan, Jan Styczynski & Ryszard Olinski
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2021, tom: 11, strony: 21345), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-021-00880-9 - link do publikacji
  5. 5-Formylcytosine and 5-hydroxymethyluracil as surrogate markers of TET2 and SF3B1 mutations in myelodysplastic syndrome, respectively
    Autorzy:
    Daniel Gackowski, Maciej Gawroński, C. Kerr, T. Radivoyevitch, Ewelina Zarakowska, Marta Starczak, Abdulkadir Abakir, Alexey Ruzow, Jaroslaw P. Maciejewski, Ryszard Olińsk
    Czasopismo:
    Haematologica (rok: 2020, tom: 105 (5), strony: 45295), Wydawca: Ferrata Storti Foundation
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3324/haematol.2019.224030 - link do publikacji
  1. Assessment of pathway of active DNA demethylation in myelodysplastic syndrome
    Autorzy:
    Kinga Linowiecka, Jolanta Guz, Tomasz Dziaman, Justyna Szpotan, Martyna Modrzejewska, Marta Starczak, Maciej Gawroński, Anna Łabejszo, Marek Foksiński, Jarosław Czyż, Andrzej Kołtan, Jan Styczyński, G. Charliński, Daniel Gackowski.
    Konferencja:
    43rd FEBS Congress "Biochemistry forever 2018" (rok: 2018, ), Wydawca: FEBS Open Bio (FEBS Press and John Wiley & Sons)
    Data:
    konferencja 7-12 July 2018
    Status:
    Opublikowana
  2. Development and validation of indirect flow cytometry method for analysis of expression of proteins involved in active DNA demethylation in patients with acute leukemia.
    Autorzy:
    Anna Łabejszo, Lidia Gackowska, Maciej Gawroński, Marta Starczak, Daniel Gackowski.
    Konferencja:
    33rd Congress of the International Society for Advancement of Cytometry. CYTO 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: International Society for Advancement of Cytometry (ISAC)
    Data:
    konferencja April 28-May 2 2018
    Status:
    Opublikowana
  3. The enzymes involved in active DNA demethylation as a potential biomarkers in B-cell acute lymphoblastic leukemia and chronic lymphocytic leukemia.
    Autorzy:
    Anna Łabejszo, Lidia Gackowska, Anna Helmin-Basa, Izabela Kubiszewska, Andrzej Kołtan, Jan Styczyński, Jarosław Czyż, Daniel Gackowski.
    Konferencja:
    ESCCA 2018: At the shore of future cytometry. (rok: 2018, ), Wydawca: Cytometry Part B (Clinical Cytometry); ESCCA and John Wiley & Sons
    Data:
    konferencja 13-15 September 2018
    Status:
    Opublikowana
  4. Vitamin C restores TET proteins activity in leukemic cells.
    Autorzy:
    Maciej Gawroński, Marta Starczak, Anna Łabejszo, Martyna Modrzejewska, Daniel Gackowski.
    Konferencja:
    43rd FEBS Congress "Biochemistry forever 2018" (rok: 2018, ), Wydawca: FEBS Open Bio (FEBS Press and John Wiley & Sons)
    Data:
    konferencja 7-12 July 2018
    Status:
    Opublikowana
  5. Relationship between the levels of epigenetic DNA modifications, 2-oxoglutarate and 2-hydroxyglutarates in acute leukemias.
    Autorzy:
    Justyna Szpotan, Martyna Modrzejewska, Kinga Linowiecka, Ewelina Zarakowska, Anna Szpila, Agnieszka Siomek-Górecka, Marta Starczak, Maciej Gawroński, Anna Łabejszo, Marek Foksiński, Jarosław Czyż, Andrzej Kołtan, Jan Styczyński, G. Charliński, Daniel Gackowski.
    Konferencja:
    43rd FEBS Congress "Biochemistry forever 2018" (rok: 2018, ), Wydawca: FEBS Open Bio (FEBS Press and John Wiley & Sons)
    Data:
    konferencja 7-12 July 2018
    Status:
    Opublikowana
  6. Assessment of active DNA demethylation pathway during chemotherapy of acute myeloid leukemia
    Autorzy:
    Anna Łabejszo, Marta Starczak, Lidia Gackowska, Martyna Modrzejewska, Justyna Szpotan, Maciej Gawroński, Andrzej Kołtan, G. Charliński, Jarosław Czyż, Jan Styczyński, Daniel Gackowski.
    Konferencja:
    43rd FEBS Congress "Biochemistry forever 2018" (rok: 2018, ), Wydawca: FEBS Open Bio (FEBS Press and John Wiley & Sons)
    Data:
    konferencja 7-12 July 2018
    Status:
    Opublikowana
  7. The Assessment of Expression of TETs and AID Enzymes Involved in Active DNA Demethylation, in Patients with B-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia
    Autorzy:
    Lidia Gackowska, Anna Labejszo, Anna Helmin- Basa, Andrzej Koltan, Jan Styczynski, Daniel Gackowski
    Konferencja:
    33rd Congress of the International Society for Advancement of Cytometry. CYTO 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: International Society for Advancement of Cytometry (ISAC)
    Data:
    konferencja April 28-May 2 2018
    Status:
    Opublikowana
  1. MS analysis of DNA modifications in urinary/body fluids.
    Autorzy:
    Skalska Aleksandra, Siomek-Górecka Agnieszka, Oliński Ryszard, Różalski Rafał
    Książka:
    Methods in molecular biology: DNA modifications: methods and protocols. (rok: 2021, tom: 2198, strony: 109-122), Wydawca: Humana Press, Springer US
    Status:
    Opublikowana
  2. Preparation of internal standards for 2D-UPLC-MS/MS quantification of noncanonical DNA bases
    Autorzy:
    Starczak Marta, Skalska Aleksandra, Różalski Rafał, Oliński Ryszard, Gackowski Daniel
    Książka:
    Methods in molecular biology: DNA modifications: methods and protocols. (rok: 2021, tom: 2198, strony: 123-136), Wydawca: Humana Press, Springer US
    Status:
    Opublikowana
  3. Quantification of DNA modifications using two-dimensional ultraperformance liquid chromatography tendem mass spectrometry (2D-UPLC-MS/MS).
    Autorzy:
    Marta Starczak, Maciej Gawronski, Ryszard Olinski, and Daniel Gackowski
    Książka:
    Methods in molecular biology: DNA modifications: methods and protocols. (rok: 2021, tom: 2198, strony: 91-108), Wydawca: Humana Press, Springer US
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy