Projekty finansowane przez NCN
Przewidywane struktury przestrzennej RNA w oparciu o modelowanie sekwencji celu wraz z sekwencjami homologicznymi
2015/17/N/NZ2/03360
Słowa kluczowe:
bioinformatyka strukturalna bioinformatyka RNA ryboprzełączniki
Deskryptory:
- NZ2_7: Bioinformatyka
- NZ1_4: Biologia strukturalna
- NZ1_1: Biologia molekularna
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej
woj. mazowieckie
Konkurs: PRELUDIUM 9 - ogłoszony 2015-03-16
Przyznana kwota: 49 400 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2016-02-15
Zakończenie projektu: 2017-02-14
Planowany czas trwania projektu: 12 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Cztery dyski 2TB do macierzy Fujitsu. Za kwotę 5 276 PLN
- Komputer przenośny z pakietem Office. Za kwotę 4 324 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (2)
- RNA-Puzzles toolkit: a computational resource of RNA 3D structure benchmark datasets, structure manipulation, and evaluation toolsAutorzy:Marcin Magnus, Maciej Antczak, Tomasz Zok, Jakub Wiedemann, Piotr Lukasiak, Yang Cao, Janusz M. Bujnicki, Eric Westhof, Marta Szachniuk, Zhichao MiaoCzasopismo:Nucleic Acids Research (rok: 2020, tom: 48(2), strony: 576-588), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/nar/gkz1108 - link do publikacji
- RNA 3D structure prediction guided by independent folding of homologous sequencesAutorzy:Marcin Magnus, Kalli Kappel, Rhiju Das, Janusz M. BujnickiCzasopismo:BMC Bioinformatics (rok: 2019, tom: 1,18888888888889, strony: 45306), Wydawca: BMCStatus:OpublikowanaDoi:10.1186/s12859-019-3120-y - link do publikacji