Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Badania pangenomu pektynolitycznych bakterii z gatunków Dickeya solani i Pectobacterium wasabiae w celu identyfikacji genów warunkujących lepszą adaptację do wywoływania objawów chorobowych na ziemniaku w klimacie umiarkowanym.

2014/14/M/NZ8/00501

Słowa kluczowe:

Dickeya solani Pectobacterium wasabiae pangenome panregulon podstawowy i dodatkowy genom bioróżnorodność wirulencja mokra zgnilizna czarna nóżka

Deskryptory:

  • NZ8_4: Różnorodność biologiczna
  • NZ1_10: Biologia drobnoustrojów
  • NZ2_7: Bioinformatyka

Panel:

NZ8 - Podstawy wiedzy o życiu na poziomie środowiskowym: biologia ewolucyjna, biologia populacyjna, biologia środowiskowa, systematyka

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Gdański, Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii Uniwersytetu Gdańskiego i Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego

woj. pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Ewa Łojkowska 

Liczba wykonawców projektu: 8

Konkurs: HARMONIA 6 - ogłoszony 2014-06-16

Przyznana kwota: 1 225 900 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2015-06-08

Zakończenie projektu: 2019-06-07

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (9)
  1. High genomic variability in the plant pathogenic bacterium Pectobacterium parmentieri deciphered from de novo assembled complete genomes IF: 4,257
    Autorzy:
    Zoledowska S., Motyka-Pomagruk A., W. Sledz W., Mengoni A., Lojkowska E.*
    Czasopismo:
    BMC Genomics (rok: 2018, tom: 19, strony: 140-149), Wydawca: BMC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12864-018-5140-9 - link do publikacji
  2. Metabolic modeling of Pectobacterium parmentieri SCC3193 provides insights into metabolic pathways of plant pathogenic bacteria IF: 4,167
    Autorzy:
    S. Zoledowska, L. Presta, M. Fondi, F. Decorosi, L. Giovannetti, A. Mengoni *, E. Lojkowska
    Czasopismo:
    Microorganisms MDPI (rok: 2019, tom: 7, 101, strony: 44576), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/microorganisms7040101 - link do publikacji
  3. Molecular methods as tools to control plant diseases caused by Dickeya and Pectobacterium spp: A minireview IF: 3,813
    Autorzy:
    A. Motyka, S. Żołędowska, W. Śledź, E. Łojkowska*
    Czasopismo:
    New Biotechnology (rok: 2017, tom: 39, strony: 181-189), Wydawca: ELSEVIER
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.nbt.2017.08.010) - link do publikacji
  4. Population structure and biodiversity of Pectobacterium parmentieri isolated from potato fields in temperate climate IF: 3,173
    Autorzy:
    Zoledowska S., Motyka A., Zukowska D., Sledz W., Lojkowska E.*
    Czasopismo:
    Plant Disease (rok: 2018, tom: 102, strony: 154-164), Wydawca: APS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1094/PDIS-05-17-0761-RE - link do publikacji
  5. Comparison of high and low virulent D. solani strains in a view of pangenome and panregulon studies on this species IF: 4,019
    Autorzy:
    Golanowska M., Potrykus M., Motyka-Pomagruk A., Kabza M., Bacci G., Galardini M., Bazzicalupo M., Makalowska I., Smalla K., Mengoni A., Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat N., Lojkowska E.*
    Czasopismo:
    Frontiers in Microbiology (rok: 2018, tom: 9, strony: Article 1940), Wydawca: Frontiers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fmicb.2018.01940 - link do publikacji
  6. Interplay of classic Exp and specific Vfm quorum sensing systems on the phenotypic features of Dickeya solani strains exhibiting different virulence levels IF: 4,697
    Autorzy:
    Potrykus M.*, Hugouvieux-Cotte-Pattat N., Łojkowska E.
    Czasopismo:
    Molecular Plant Pathology (rok: 2018, tom: 1, strony: 1238-1251), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/mpp.12614) - link do publikacji
  7. The uniform structure of O-polysaccharides isolated from Dickeya solani strains of different origin IF: 1,817
    Autorzy:
    K. Ossowska, M. Czerwicka, W. Sledz, S. Zoledowska, A. Motyka, M. Golanowska, G. Condemine, E. Łojkowska, Z. Kaczyński*
    Czasopismo:
    Carbohydrate Research (rok: 2017, tom: 445, strony: 40-43), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.carres.2017.04.001 - link do publikacji
  8. Genotypic and phenotypic variability of Pectobacterium strains causing blackleg and soft rot on potato in Turkey IF: 1,478
    Autorzy:
    Ozturk M.*, Aksoy H. M., Potrykus M., Lojkowska E.
    Czasopismo:
    European Journal of Plant Pathology (rok: 2018, tom: 151, strony: 000-000), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10658-018-1459-y - link do publikacji
  9. A review on Dickeya solani, a new pathogenic bacterium causing loss in potato yield in Europe.
    Autorzy:
    M. Golanowska, E. Łojkowska*
    Czasopismo:
    BioTechnologia (rok: 2016, tom: 97(2), strony: 109-127), Wydawca: KB PAN
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.5114/bta.2016.60781 - link do publikacji