Projekty finansowane przez NCN
Poznanie sieci genów regulujących rozwój serca u danio pręgowanego przy użyciu genomiki
2014/13/B/NZ2/03863
Słowa kluczowe:
Danio pręgowany wady wrodzone serca ChIP-seq genomika epigenetyka
Deskryptory:
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ2_3: Proteomika
- NZ3_2: Fizjologia komórki
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej
woj. mazowieckie
Konkurs: OPUS 7 - ogłoszony 2014-03-17
Przyznana kwota: 955 500 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2015-01-01
Zakończenie projektu: 2018-01-22
Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Bioanalyzer. Za kwotę 50 000 PLN
- Bioinformatyczny sprzęt komputerowy. Za kwotę 15 000 PLN
- Systemy do elektroforezy białek i technik typu "Western-blot". Za kwotę 10 000 PLN
- Zestaw hodowlany Danio rerio. Za kwotę 98 000 PLN
- Inkubator - 2 sztuki. Za kwotę 60 791 PLN
- Transiluminator z pokrywą.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (3)
- Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (3)
- Dynamics of cardiomyocyte transcriptome and chromatin landscape demarcates key events of heart developmentAutorzy:Michal Pawlak, Katarzyna Z. Kedzierska, Maciej Migdal, Karim Abu Nahia, Jordan A. Ramilowski, Lukasz Bugajski, Kosuke Hashimoto, Aleksandra Marconi, Katarzyna Piwocka, Piero Carninci, and Cecilia L. WinataCzasopismo:Genome Research (rok: 2019, tom: 29(3), strony: 506-519), Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1101/gr.244491.118 - link do publikacji
- Cytoplasmic polyadenylation-mediated translational control of maternal mRNAs directs maternal to zygotic transitionAutorzy:Winata CL, Łapiński M, Pryszcz L, Vaz C, Bin Ismail MH, Nama S, Hajan HS, Lee SGP, Korzh V, Sampath P, Tanavde V, Mathavan S.Czasopismo:Development (rok: 2018, tom: 45299, strony: 145(1)), Wydawca: Company of Biologists LtdStatus:OpublikowanaDoi:10.1242/dev.159566 - link do publikacji
- The canonical way to make a heart: β-catenin and plakoglobin in heart development and remodelingAutorzy:Piven Oksana, Winata CeciliaCzasopismo:Experimental Biology and Medicine (rok: 2017, tom: 242(18), strony: 1735-1745), Wydawca: SAGE Publications Inc.Status:OpublikowanaDoi:10.1177/1535370217732737 - link do publikacji
- Elucidating the gene regulatory network of zebrafish heart development using genomicsAutorzy:Niescierowicz, Katarzyna ; Lapinski, Maciej ; Abu Nahia, K ; Carvalho, Ana Leonor ; Winata, CeciliaKonferencja:18th International Congress of Developmental Biology (rok: 2017, ), Wydawca: ELSEVIER SCIENCE BVData:konferencja JUN 18-22, 2017Status:Opublikowana
- Genomics dissection of the zebrafish heartAutorzy:Pawlak, Michal ; Kedzierska, Katarzyna ; Bugajski, Lukasz ; Hashimoto, Kosuke ; Ramilowski, Jordan ; Marconi, Aleksandra ; Carninci, Piero ; Piwocka, Katarzyna; Winata, CeciliaKonferencja:18th International Congress of Developmental Biology (rok: 2017, ), Wydawca: ELSEVIER SCIENCE BVData:konferencja JUN 18-22, 2017Status:Opublikowana
- Identification of epigenomic regulatory network of heart developmentAutorzy:Michal Pawlak, Katarzyna Kedzierska, Maciej Migdal, Karim Abu Nahia, Hashimoto Kosuke, Jordan Ramilowski, Lukasz Bugajski, Aleksandra Marconi, Katarzyna Piwocka, Piero Carninci, Cecilia WinataKonferencja:Human Genome Meeting 2018 (rok: 2018, ), Wydawca: Human Genome OrganizationData:konferencja 12 - 15 MarchStatus:Opublikowana