Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Analiza genetycznych predyspozycji do klinicznego mastitis na podstawie sekwencji całych genomów 32 krów

2014/13/B/NZ9/02016

Słowa kluczowe:

mastitis sekwencje DNA GWAS

Deskryptory:

  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ9_2: Naukowe podstawy zootechniki
  • ST1_18: Zastosowania matematyki w innych naukach

Panel:

NZ9 - Stosowane nauki o życiu: rolnictwo, leśnictwo, ogrodnictwo, rybactwo, żywienie i żywność, biotechnologia środowiskowa

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu, Wydział Biologii i Hodowli Zwierząt

woj. dolnośląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Joanna Szyda 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: OPUS 7 - ogłoszony 2014-03-17

Przyznana kwota: 291 700 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2015-02-05

Zakończenie projektu: 2018-03-04

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Macierz dskowa do serwera. Za kwotę 25 000 PLN
  2. Laptop (2 szt.). Za kwotę 8 000 PLN
  3. Jednostka centralna typ B (kpmputer stacjonarny). Za kwotę 2 431 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (6)
  1. Assessing DNA sequence features underlying copy number variants
    Autorzy:
    Barski P., Mielczarek M., Frąszczak M., Szyda J.
    Czasopismo:
    Acta Scientiarum Polonorum Zootechnica (rok: 2019, tom: 0,751388888888889, strony: 25-30), Wydawca: West Pomeranian University of Technology, Szczecin
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.21005/asp.2019.18.2.04 - link do publikacji
  2. Population Structure Analysis of Bull Genomes of European and Western Ancestry
    Autorzy:
    Chung N.C., Szyda J., Frąszczak M., The 1000 Bull Genomes Project
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2017, tom: 7, strony: 40688), Wydawca: Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep40688 - link do publikacji
  3. Identification and annotation of breed-specific single nucleotide polymorphisms in Bos taurus genomes
    Autorzy:
    Czech B., Frąszczak M., Mielczarek M., Szyda J.
    Czasopismo:
    PLOS one (rok: 2018, tom: 13, strony: e0198419), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0198419 - link do publikacji
  4. The Genetic Background of Clinical Mastitis in Holstein-Friesian cattle
    Autorzy:
    Szyda J., Mielczarek M., Frąszczak J., Minozzi G., Giannico R., Williams J.L., Wojdak-Maksymiec K.
    Czasopismo:
    Animal (rok: 2019, tom: 0,548611111111111, strony: 2156-2163), Wydawca: Cambridge University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1017/S1751731119000338 - link do publikacji
  5. The assessment of inter-individual variation of whole-genome DNA sequence in 32 cows.
    Autorzy:
    Szyda J., Frąszczak M., Mielczarek M., Giannico R., Minozzi G., Nicolazzi E.L., Kamiński S., Wojdak-Maksymiec K.
    Czasopismo:
    Mammalian Genome (rok: 2015, tom: 26, strony: 658-665), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00335-015-9606-7 - link do publikacji
  6. Analysis of Copy Number Variations in Holstein-Friesian Cow Genomes Based on Whole Genome Sequence Data
    Autorzy:
    Mielczarek M., Frąszczak M., Giannico R., Minozzi G., Williams J.L., Wojdak-Maksymiec K., Szyda J.
    Czasopismo:
    Journal of Dairy Science (rok: 2017, tom: 100(7), strony: 5515-5525), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3168/jds.2016-11987 - link do publikacji