Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Biosynteza seleno-modyfikowanych nukleozydów w pętli antykodonu transferowych kwasów rybonukleinowych. Ewaluacja enzymatycznej transformacji 2-tiourydyny do 2-selenourydyny, badania funkcji i struktury tRNA selenourydyno syntazy z E. coli.

2014/13/B/ST5/03979

Słowa kluczowe:

biosynteza modyfikowanych nukleozydów antykodon tRNA 2-tiourydyna 2-selenourydyna termoforeza krystalizacja białka selenourydyno syntaza

Deskryptory:

  • ST5_16: Chemia biologiczna
  • ST5_23: Chemia organiczna
  • ST5_25: Inne zagadnienia pokrewne

Panel:

ST5 - Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna

Jednostka realizująca:

Centrum Badań Molekularnych i Makromolekularnych Polskiej Akademii Nauk

woj. łódzkie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Barbara Nawrot 

Liczba wykonawców projektu: 11

Konkurs: OPUS 7 - ogłoszony 2014-03-17

Przyznana kwota: 1 252 500 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2015-04-01

Zakończenie projektu: 2019-03-31

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Rozdzielacz przepływu. Za kwotę 6 000 PLN
  2. Dwustopniowa pompa rotacyjna (ciśnienie w zakresie 10-3 torr). Za kwotę 8 000 PLN
  3. Aparat do termoforezy. Za kwotę 475 000 PLN
  4. Reodyna. Za kwotę 6 500 PLN
  5. Pompa próżniowa, membranowa. Za kwotę 5 500 PLN
  6. Semi-preparatywna/analityczna kolumna anionowymienna HPLC. Za kwotę 4 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (8)
  1. Nucleoside modifications in the regulation of gene expression: focus on tRNA IF: 5,694
    Autorzy:
    M. Düchler, G. Leszczyńska, E. Sochacka, B. Nawrot
    Czasopismo:
    Cell Mol Life Sci (rok: 2016, tom: 73, strony: 3075-3095), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007%2Fs00018-016-2217-y - link do publikacji
  2. Reaction of S-geranyl-2-thiouracil modified oligonucleotides with alkyl amines leads to the N2-alkyl isocytosine derivatives. IF: 3,564
    Autorzy:
    Leszczynska G., Sadowska K., Sierant M., Sobczak M., Nawrot B., Sochacka E.
    Czasopismo:
    Org. Biomol. Chem. (rok: 2017, tom: 15, strony: 5332-5336), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c7ob01012e - link do publikacji
  3. Escherichia coli tRNA 2-selenouridine synthase (SelU) converts S2U-RNA to Se2U-RNA via S-geranylated-intermediate. IF: 2999
    Autorzy:
    Sierant M, Leszczynska G, Sadowska K, Komar P, Radzikowska-Cieciura E, Sochacka E, Nawrot B.
    Czasopismo:
    FEBS Lett (rok: 2018, tom: 592 (13), strony: 2248-2258), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/1873-3468.13124 - link do publikacji
  4. S-Geranylated 2-Thiouridines of Bacterial tRNAs: Chemical Synthesis and Physicochemical Properties IF: 3,068
    Autorzy:
    G. Leszczynska, K. Sadowska, P. Bartos, B. Nawrot, E. Sochacka
    Czasopismo:
    Eur. J. Org. Chem. (rok: 2016, tom: 2016, strony: 3482-3485), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/ejoc.201600519 - link do publikacji
  5. C5-Substituted 2-Selenouridines Ensure Efficient Base Pairing with Guanosine; Consequences for Reading the NNG-3′ Synonymous mRNA Codons IF: 4,183
    Autorzy:
    Grazyna Leszczynska , Marek Cypryk , Bartlomiej Gostynski2, Klaudia Sadowska , Paulina Herman , Grzegorz Bujacz , Elzbieta Lodyga-Chruscinska , Elzbieta Sochacka and Barbara Nawrot ,*
    Czasopismo:
    Int. J. Mol. Sci (rok: 2020, tom: 21, strony: 2882), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms21082882 - link do publikacji
  6. C5-substituents of uridines and 2-thiouridines present at the wobble position of tRNA determine the formation of their keto-enol or zwitterionic forms - a factor important for accuracy of reading of guanosine at the 3΄-end of the mRNA codons. IF: 10,162
    Autorzy:
    Sochacka E, Lodyga-Chruscinska E, Pawlak J, Cypryk M, Bartos P, Ebenryter-Olbinska K, Leszczynska G, Nawrot B.
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Res. (rok: 2017, tom: 45, strony: 4825-4836), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkw1347 - link do publikacji
  7. Cytochrome C catalyzes the hydrogen peroxide-assisted oxidative desulfuration of 2-thiouridines in transfer RNAs. IF: 2,593
    Autorzy:
    Sierant, M., Kulik, K., Sochacka, E., Szewczyk, R., Sobczak, M. and Nawrot, B.
    Czasopismo:
    ChemBioChem (rok: 2018, tom: 19, strony: 687-695), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/cbic.201700692 - link do publikacji
  8. S-Geranyl-2-thiouridine wobble nucleosides of bacterial tRNAs; chemical and enzymatic synthesis of S-geranylated-RNAs and their physicochemical characterization IF: 9,2
    Autorzy:
    M. Sierant, G. Leszczynska, K. Sadowska, A. Dziergowska, M. Rozanski, E. Sochacka. B. Nawrot
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Res (rok: 2016, tom: 44(22), strony: 10986-10996), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkw727 - link do publikacji